Informatie voor professionals in voedsel en groen

Informatie voor professionals in voedsel en groen

  • externe gebruiker (Let opwarning)
  • Log in as
  • Over Groenekennis


    Groenekennis - Informatie voor professionals in voedsel en groen

    Groenekennis bevat artikelen uit vaktijdschriften, rapporten, video’s, presentaties, posters en websites op het gebied van landbouw, visserij, groene ruimte en voeding. Groenekennis wordt dagelijks bijgewerkt en bevat ongeveer 500.000 bronnen.

    Groenekennis is de globale view over diverse deelbestanden. Groenekennis is gevuld met alle informatie uit Groen Kennisnet, de Hydrotheek, Tuinpad, IB archief, ARTIK, bioKennis, Kennisbank Plantaardige bronnen, Kennisbank Zeldzame landbouwhuisdieren en afgesloten documentatiebestanden zoals Land Bodem Water en Consumenten- en huishoudstudies.

    Groen Kennisnet is een zeer belangrijk onderdeel van Groenekennis. De doelstelling van Groen Kennisnet is kennis delen op het gebied van Voedsel en Groen te bevorderen en te faciliteren voor een breed publiek.

    Bronnen in Groenekennis kunnen direct opgevraagd worden via een geavanceerde zoekmachine met een 'google-achtige' interface. Met filters kan ingezoomd worden op diverse aspecten, zoals Trefwoord, Collectie, Jaar en Auteur. Bovendien biedt Groenekennis gebruikers de mogelijkheid om via de E-mail geattendeerd te worden op aanvullingen in specifieke vakgebieden.
    De Tijdschriftenlijst biedt een overzicht van tijdschriften waaruit de artikelen voor Groenekennis worden geselecteerd. Door te klikken op een titel krijgt u alle artikelen uit dat tijdschrift in de Groenekennis database getoond.
    Zoeken op kaart biedt een geografische ingang op de beschikbare publicaties over de binnen dit bestand onderscheiden gebieden.

    Groenekennis is onderdeel van het bibliotheeksysteem van WUR. Praktijkgerichte publicaties en rapporten van WUR komen daardoor automatisch beschikbaar. Daarnaast wordt de database doorlopend gevuld met voor het groen onderwijs bruikbare bronnen en artikelen, video’s en websites. Het percentage online is de laatste jaren gegroeid tot tweederde van de totale aanwas per jaar. Dit percentage groeit nog steeds.

    Over
Record nummer 2233869
Titel Using genomic information to conserve genetic diversity in livestock
toon extra info.
Sonia E. Eynard
Auteur(s) Eynard, Sonia E. (dissertant)
Uitgever Wageningen : Wageningen University
Jaar van uitgave 2018
Pagina's 200 pages figures, diagrams
Pagina's 1 online resource (PDF, 200 pages) figures, diagrams
Annotatie(s) Ph.D. thesis AgroParisTech, 2018  toon alle annotatie(s)
Includes bibliographical references. - With summaries in English and French
ISBN 9789463432276; 9463432272
Tutor(s) Komen, Prof. dr. H. ; Calus, Dr. M.P.L. ; Windig, Dr. J.J. ; Restoux, Dr. G.
Promotiedatum 2018-02-19
Proefschrift nr. 6870
Samenvatting door auteur toon abstract

Concern about the status of livestock breeds and their conservation has increased as selection and small population sizes caused loss of genetic diversity. Meanwhile, dense SNP chips and whole genome sequences (WGS) became available, providing opportunities to accurately quantify the impact of selection on genetic diversity and develop tools to better preserve such genetic diversity for long-term perspectives. This thesis aimed to infer the impact of selection and mitigate its effects on genetic diversity using genomic information. One of the advantages of WGS information, compared to pedigree and SNP chip information, is that it provides information on all variants, including rare ones, and ‘true’ relationships between individuals may be estimated thus being useful for evaluating genetic diversity. Taking into account rare variants had significant effects on estimated relationships. Moreover, optimal contribution (OC) strategy was used to perform selection either in a breeding program, maximising genetic merit while minimising loss of genetic diversity, or to build a gene bank, only maximising the conserved genetic diversity, with the aim to quantify loss of genetic diversity due to selection decisions. More genetic diversity was conserved when genomic information was used for selection decisions instead of pedigree and WGS information revealed a high loss of genetic diversity due to losing rare variants. Ways to reduce the loss of genetic diversity during a genomic selection program were investigated. The choice of individuals to update the reference population was proposed as a promising way to better conserve genetic diversity in a breeding population. In fact, changes in the reference population will lead to changes in prediction equations and thus ultimately to a shift in long-term selection decisions. Differences between reference population design using either random, truncation or OC selection of individuals, on the breeding population were modest but OC achieved conservation of more genetic diversity in the breeding population with only a small reduction in long-term genetic gain. Finally the potential of gene bank material as additional source of genetic diversity in the breeding population was examined, using the Dutch MRY cattle breed as a case study. Including old bulls, containing more genetic diversity than recent bulls, in the population of fathers for the next generation, selected with OC, resulted in both a slightly higher genetic merit and more genetic diversity conserved. The impact of selection on genetic diversity can be monitored by estimating the loss of rare variants over time. For the long-term perspectives of populations it is important to use specialised methods and genomic information to balance between selection response and conservation of genetic diversity.  

Online full textINTERNET
Op papier FORUM ; STACKS ; Toonkast ; Niet uitleenbaar
Publicatie type Proefschrift
Taal Engels
Reacties
Er zijn nog geen reacties. U kunt de eerste schrijven!
Schrijf een reactie
 

To support researchers to publish their research Open Access, deals have been negotiated with various publishers. Depending on the deal, a discount is provided for the author on the Article Processing Charges that need to be paid by the author to publish an article Open Access. A discount of 100% means that (after approval) the author does not have to pay Article Processing Charges.

For the approval of an Open Access deal for an article, the corresponding author of this article must be affiliated with Wageningen University & Research.

U moet eerst inloggen om gebruik te maken van deze service. Login als Wageningen University & Research user of guest user rechtsboven op deze pagina.