Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

Current refinement(s):

Records 1 - 14 / 14

  • help
  • print

    Print search results

  • export

    Export search results

  • alert
    We will mail you new results for this query: keywords==germinability
Check title to add to marked list
Imaging genetics of seed performance
Joosen, R.V.L. - \ 2013
Wageningen University. Promotor(en): Linus van der Plas, co-promotor(en): Henk Hilhorst; Wilco Ligterink. - S.l. : s.n. - ISBN 9789461734976 - 196
zaden - zaadkieming - kiemkracht - genetica - kiemrust - genomica - arabidopsis thaliana - moleculaire genetica - moleculaire biologie - loci voor kwantitatief kenmerk - seeds - seed germination - germinability - genetics - seed dormancy - genomics - molecular genetics - molecular biology - quantitative trait loci

The Netherlands has a long history of plant breeding which has resulted in a leading position in the world with respect to the sales of vegetable seeds. Nowadays high-tech methods are used for crop-production which demands high standards for the quality of the starting materials. While breeding has mainly focused on crop yield and disease resistance in the past, it now becomes equally important to create seeds that rapidly and uniformly germinate under a wide range of production environments. A better understanding of the molecular processes that are underlying seed quality is a crucial first step to enable targeted breeding. In this thesis we describe the results of new methods that were used to map the genetics of seed germination.

For this research we have used the leading plant science model species Arabidopsis thaliana which has a short generation time and a fully sequenced genome. Further, the large scientific community working on this model species is providing a wealth of resources ranging from large collections of worldwide accessions, genetic mapping populations, mutants and knowledge about gene, protein and metabolite action. A disadvantage of using Arabidopsis is the small size of the seeds, which requires evaluation of the germination of individual seeds with the use of magnifying glasses. This problem has been solved by using image analysis to create an automated procedure to obtain detailed information for parameters such as rate, uniformity and maximum germination. This procedure, called ‘the Germinator’, is described in Chapter 2 and has been enthusiastically adopted by the seed community.

Plants cannot walk away from the environment at which the seed is dispersed. To survive and to enable reproduction, plants adapt to the prevailing environment which results in considerable genetic variation. This ‘natural variation’ is a great resource to study the mechanisms of adaptation. In Chapter 3 we have used two distinct Arabidopsis accessions, one originating from Germany (Bayreuth) and the other from high altitude in the Pamiro-Alay Mountains in Tadjikistan (Shahdara). In contrast to the Bayreuth accession, the Shahdara accession is well adapted to survive harsh conditions and is known to be stress tolerant to a range of environments. A genetic mapping (recombinant inbred line; RIL) population, consisting of 165 lines, that was derived from these two accessions is therefore particularly suitable to locate the genomic regions with genetic differences that influence seed germination. Such genomic regions are commonly referred to as quantitative trait loci (QTL). With help of the Germinator system we were able to evaluate germination of this RIL population under many different conditions. This resulted in a description of the ‘genetic landscape of seed performance’ in which we identified many QTLs for Arabidopsis seed germination.

QTL regions are often large and identification of the causal gene requires intensive follow up research. We therefore aimed for a high throughput analysis using modern ‘omics’ techniques to analyze differences in metabolite levels and gene expression between the lines. A method to classify and visualize the vast amount of data derived from such an approach is described in Chapter 4. The so called genetical ‘omics’ experiments are expensive and therefore often force researchers to limit their study to a single developmental stage or environment only. A novel generalized setup overcomes this limitation and was tested for metabolite level changes in Chapter 5. This setup offers a unique reduction of experimental load with minimal effect on statistical power and is of great potential in the field of system genetics. Four different developmental stages of seed germination were tested in the RIL population. This approach resulted in a large dataset for which efficient analytical procedures were lacking. Thus, Chapter 5 also includes a description of a newly developed statistical procedure to analyze this type of data. The same approach and material were used in Chapter 6 to evaluate the genetics of genome wide gene expression.

Another approach to zoom in on the molecular mechanisms underlying seed performance is described in Chapter 7. Here, the genetic diversity was maximized by using 360 different Arabidopsis accessions which had been subjected to ultra-high density genotyping. In potential, such a genome wide association (GWA) study can provide high resolution mapping of genetic variation resulting in only a few candidate genes per association for the phenotype under study. Although we were able to replicate experiments over two years with a high level of heritability, no significant associations were found. This emphasizes the need to critically review the power of such an approach for traits that are expected to be determined by many small effect loci.

Finally, closing in on the molecular mechanisms underlying the seed traits that we studied might be possible by a full integration of the datasets that were described in the different chapters. Two examples that show the potential and the complexity of such integration are described in the General Discussion (Chapter 8). Research focused on seed quality does not end here but has gained an impulse by the described new methods and hypotheses to continue on both the fundamental and applied level in the coming years.

Het onderzoek in 2010
Groot, S.P.C. ; Scholten, O.E. ; Raaijmakers, M. - \ 2010
Wageningen [etc.] : Wageningen UR etc. (BioKennis bericht. Uitgangsmateriaal en veredeling 1 (aug. 2010)) - 4
akkerbouw - zaadproductie - koolsoorten - penen - pompoenen - aardappelen - uien - preien - lupinen - biologische plantenveredeling - vollegrondsgroenten - kiemkracht - arable farming - seed production - cabbages - carrots - pumpkins - potatoes - onions - leeks - lupins - organic plant breeding - field vegetables - germinability
Biologische telers zijn verplicht biologisch uitgangsmateriaal te gebruiken, maar daarvan is niet altijd voldoende beschikbaar. Onderzoek op het gebied van uitgangsmateriaal, gerichte veredeling en samenwerking in de keten moeten het aanbod en het gebruik van biologisch uitgangsmateriaal stimuleren. Dit bioKennisbericht geeft een tussenstand van de lopende onderzoeksprojecten.
Een alcoholtest voor zwakke zaden
Groot, S.P.C. ; Kodde, J. - \ 2009
biologische landbouw - zaadbehandeling - groeikracht - gewasbescherming - analytische methoden - vermeerderingsmateriaal - kiemkracht - organic farming - seed treatment - vigour - plant protection - analytical methods - propagation materials - germinability
Deze poster bevat resultaten uit onderzoek naar een snellere bepaling van de vigour van biologische zaden: alcoholproductie van de zaden
Conservation of tree seeds from tropical dry-lands
Neya, O. - \ 2006
Wageningen University. Promotor(en): Linus van der Plas, co-promotor(en): Folkert Hoekstra. - [S.l.] : S.n. - ISBN 9085045312 - 159
zaden - bomen - plantenfysiologie - azadirachta indica - lannea - sclerocarya birrea - khaya senegalensis - zaadkieming - opslag - burkina faso - kiemkracht - seeds - trees - plant physiology - seed germination - storage - germinability
Effect van de fysiologische ouderdom van het pootgoed op de opbrengst van poot- en zetmeelaardappelen
Wijnholds, K.H. ; Wustman, R. - \ 2003
Kennisakker.nl 2003 (2003)1 juli.
vermeerderingsmateriaal - pootknollen - pootaardappelen - aardappelen - verouderen - koelcellen - aardappelopslagplaatsen - gewasopbrengst - kiemkracht - fabrieksaardappelen - propagation materials - seed tubers - seed potatoes - potatoes - aging - cold stores - potato stores - crop yield - germinability - starch potatoes
In zijn algemeenheid heeft voorkiemen van pootgoed voordelen. Ten opzichte van het "witte puntjesstadium" betekent voorkiemen echter wel, dat het pootgoed fysiologisch iets ouder wordt. Naarmate knollen fysiologisch ouder zijn, worden er minder kiemen en stengels en dus ook minder knollen aangelegd per plant.
Zaadvoorraad en herintroductie: achtergronden, spectra van plantengemeenschappen en voorbeelden uit de praktijk
Bekker, R.M. ; Strykstra, R.J. ; Schaminée, J.H.J. ; Hennekens, S.M. - \ 2002
Stratiotes (2002)24. - ISSN 0928-2297 - p. 27 - 48.
plantengemeenschappen - rassen (planten) - zaden - herstel - geïntroduceerde soorten - kiemkracht - blauwgrasland - ecologie - natuurherstel - plantensociologie - vegetatie - Friesland - Brabant - plant communities - varieties - seeds - rehabilitation - introduced species - germinability
Het effect van toediening van calcium en borium aan de grond op de opbrengst, kwaliteit en minerale samenstelling van pootaardappelen
Velema, R. ; Griend, P. van de - \ 2001
Wageningen : Plant Research International (Nota / Plant Research International 101) - 10
aardappelen - solanum tuberosum - calcium - vermeerderingsmateriaal - veldproeven - akkerbouw - pootaardappelen - kiemkracht - potatoes - propagation materials - field tests - arable farming - seed potatoes - germinability
In het kader van het deelproject 'Nutriëntenvoorziening' van het deelcluster 'Innovatie Aardappelteelt' van Agrobiokon is onderzoek uitgevoerd naar de calciumvoorziening van pootgoed. Calcium speelt een belangrijke rol bij de kieming van pootgoed. Lage calciumgehaltes kunnen leiden tot een verminderde kiemkracht en afsterving van kiemen. Het doel van het onderzoek is na te gaan op welke wijze het calciumgehalte in pootaardappelen kan worden verhoogd. Hiertoe zijn in 1998 twee veldproeven aangelegd. Van deze veldproeven wordt in dit rapport verslag gedaan. De proef is aangelegd op twee locaties, namelijk Valthermond en Rolde
Het effect van het calciumgehalte van pootgoed opm de groei en opbrengst van zetmeelaardappelen
Velema, R. ; Griend, P. van de; Velvis, H. - \ 2001
Wageningen : Plant Research International (Nota / Plant Research International 104) - 14
pootaardappelen - solanum tuberosum - aardappelen - veldproeven - calcium - vermeerderingsmateriaal - gewasopbrengst - akkerbouw - borium - kiemkracht - seed potatoes - potatoes - field tests - propagation materials - crop yield - arable farming - boron - germinability
In het kader van het deelproject ‘Nutriëntenvoorziening’ van de deelcluster ‘Innovatie Aardappelteelt’ van Agrobiokon is door HLB onderzoek uitgevoerd naar de calciumvoorziening in pootaardappelen. In het onderzoek dat in dit rapport wordt beschreven, is gekeken naar het effect van het calciumgehalte in de knollen op de kieming. Daarnaast wordt verslag gedaan van twee veldproeven uit 1999 en 2000. In deze veldproeven is pootgoed gebruikt met verschillen in calciumgehalte. Gekeken is naar de effecten op de opbrengst
Calcium in aardappel
Velvis, H. - \ 2001
Wageningen : Plant Research International - 22
aardappelen - solanum tuberosum - calcium - ziekteresistentie - kiemkracht - potatoes - disease resistance - germinability
Een overzicht wordt gegeven van de literatuur m.b.t. het element calcium in aardappel. Daarbij wordt gekeken naar de functie in de plant, de opname en het interne transport, en de gevolgen van tekorten voor de opbrengst en de vatbaarheid voor pathogenen
Verspreiding van onkruiden en planteziekten met dierlijke mestDissemination of weeds and plant diseases by cattle slurry
Elema, A.G. - \ 1991
In: Jaarboek 1987-1992 : verslagen van in 1987-1992 afgesloten onderzoekprojecten op Regionale Onderzoek Centra en het PAGV Lelystad : Proefstation voor de Akkerbouw en de Groenteteelt in de Vollegrond (Publikatie / Proefstation voor de Akkerbouw en de Groenteteelt in de Vollegrond, Regionale Onderzoekcentra no. 38-64) - p. 226 - 228.
dierlijke meststoffen - distributie - epidemiologie - plantenziekten - plantenplagen - zaadkieming - drijfmest - onkruiden - kiemkracht - animal manures - distribution - epidemiology - plant diseases - plant pests - seed germination - slurries - weeds - germinability
Door mest gedurende vier weken in een afgesloten ruimte te bewaren verliezen onkruiden hun kiemkracht. Ook de meeste planteziektenverwekkers overleven een lang verblijf in dunne mest niet
De overleving van onkruidzaden en -knolletjes in rundermengmest en in een snijmaiskuil
Schokker, A.H. - \ 1988
Wageningen : CABO (CABO-verslag 90) - 34
dierlijke meststoffen - distributie - epidemiologie - kieming - plantenziekten - plantenplagen - kiemrust - zaadkieming - kuilvoer - drijfmest - onkruiden - kiemkracht - animal manures - distribution - epidemiology - germination - plant diseases - plant pests - seed dormancy - seed germination - silage - slurries - weeds - germinability
Het beschreven onderzoek naar de verspreiding van onkruiden door mengmest had tot doel na te gaan hoe lang zaden van onkruiden een verblijf in drijfmest kunnen overleven en wat het effect is van het ensilageproces op de vitaliteit van onkruidzaden. Op basis van de verkregen resultaten kan geconcludeerd worden dat door opslag van mest gedurende ca. 4 maanden (met name tijdens de zomermaanden) en door maiskuilen ca. 4 weken gesloten te houden een risico voor verspreiding van onkruiden met mest flink gereduceerd wordt
Use temperature and short wave radiation to predict the rate of seedling emergence and the harvest date
Bierhuizen, J.F. ; Feddes, R.A. - \ 1973
Wageningen : I.C.W. (Verspreide overdrukken / Instituut voor Cultuurtechniek en Waterhuishouding no. 144) - 9
zaadkieming - oogsttijdstip - luchttemperatuur - kiemkracht - seed germination - harvesting date - air temperature - germinability
De invloed van IPC/CIPC - houdende middelen op de kiemkracht van graszaad : verslag van het onderzoek in 1969/1970
Buitelaar, N. - \ 1970
Wageningen : [s.n.] (Mededelingen / Instituut voor bewaring en verwerking van landbouwproducten no. 373) - 8
plantenvermeerdering - lolium - plantenvoeding - kunstmeststoffen - mest - profam - chloorprofam - voedergrassen - kiemkracht - propagation - plant nutrition - fertilizers - manures - propham - chlorpropham - fodder grasses - germinability
De invloed van IPC/CIPC - houdende middelen op de kiemkracht van graszaad : verslag van het onderzoek in 1968
Buitelaar, N. - \ 1969
Wageningen : [s.n.] (Mededelingen / Instituut voor bewaring en verwerking van landbouwproducten no. 341) - 11
kunstmeststoffen - lolium - mest - plantenvoeding - plantenvermeerdering - profam - chloorprofam - voedergrassen - kiemkracht - fertilizers - manures - plant nutrition - propagation - propham - chlorpropham - fodder grasses - germinability
Check title to add to marked list

Show 20 50 100 records per page

 
Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.