Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

Current refinement(s):

Records 1 - 11 / 11

  • help
  • print

    Print search results

  • export

    Export search results

  • alert
    We will mail you new results for this query: keywords==malus domestica
Check title to add to marked list
Investigating the fruit texture genetic control in apple and its interplay with the production of volatile compounds using multi-family based analysis and genome wide association mapping
Guardo, Mario Di - \ 2017
Wageningen University. Promotor(en): Richard Visser, co-promotor(en): Eric van de Weg; F. Costa. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789463432054 - 177
malus domestica - apples - fruit - fruit growing - genetics - plant breeding - genome analysis - appels - fruitteelt - genetica - plantenveredeling - genoomanalyse

Although varying with context, quality of fresh fruits includes several properties such as color, texture, flavor and health promoting compounds. This thesis focused on two important quality aspects, namely texture and aroma in apple, and defining the genomic regions involved in the control of these two features. The genetic control of texture and VOCs production have been investigated using two marker-trait association analysis approaches: Pedigree Based Analysis (PBA) and Genome Wide Association Study (GWAS). In chapter 2, ASSIsT (Automatic SNP ScorIng Tool), a software dedicated for the efficient calling and filtering of SNPs from Illumina InfiniumÒ arrays is presented. ASSIsT builds on GenomeStudio® derived data and identifies markers showing reliable genotype calls (bi-allelic segregation pattern). In addition, ASSIsT identifies and re-edits SNP calls of markers showing additional alleles (null alleles or additional SNPs in the probe annealing site). Chapter 3 aimed to dissect the genetic control of fruit firmness in apple during storage through PBA and employing 24 bi-parental families (1216 individuals) connected by a common pedigree structure. Ten QTLs were identified encompassing eight linkage groups, which unravelled a QTL dynamics over storage shedding light on the specific genetic control at each time-point. Chapter 4: aimed to comprehensively decipher the genetic control of fruit texture. Two complementing QTL mapping approaches were employed together with a novel and high sophisticated phenotyping device for fruit texture. The PBA was carried out on six full-sib pedigreed families (416 individuals), while the GWAS was performed on a collection of 233 apple accessions. The texture analyser employed (TAXT-AED texture analyser) allowed the measurement of both the mechanical properties (firmness) and the acoustic properties (crispness) of fruit texture. The QTL results indicated chromosome 10 being associated in changes of the mechanical properties of fruit texture, while chromosomes 2 and 14 were more associated to the acoustic response. In Chapter 5 the interplay between texture and volatile organic compounds (VOCs) was investigated in 162 apple accessions. The array of volatile compounds phenotyped was implemented into a GWAS identifying seven chromosomes harbouring important candidate genes for aroma, such as MdAAT1 and MdIGS. Next, volatilome and fruit texture data were integrated revealing a negative correlation between these two features.

Role of MLO genes in susceptibility to powdery mildew in apple and grapevine
Pessina, Stefano - \ 2016
Wageningen University. Promotor(en): Richard Visser, co-promotor(en): Henk Schouten; M. Malnoy; Yuling Bai. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789462576209 - 222 p.
malus domestica - apples - vitis vinifera - grapes - plant pathogenic fungi - podosphaera leucotricha - erysiphe necator - disease resistance - susceptibility - genes - gene expression - gene knock-out - resistance breeding - appels - druiven - plantenziekteverwekkende schimmels - ziekteresistentie - vatbaarheid - genen - genexpressie - inactivering van genen - resistentieveredeling

Powdery mildew (PM) is a major fungal disease that threatens thousands of plant species. PM is caused by Podosphaera leucotricha in apple and Erysiphe necator in grapevine. Powdery mildew is controlled by frequent applications of fungicides, having negative effects on the environment, and leading to additional costs for growers. To reduce the amount of chemicals required to control this pathogen, the development of resistant apple and grapevine varieties should become a priority.

PM pathogenesis is associated with up-regulation of specific MLO genes during early stages of infection, causing down-regulation of plant defense pathways. These up-regulated genes are responsible for PM susceptibility (S-genes) and their knock-out causes durable and broad-spectrum resistance. All MLO S-genes of dicots belong to the phylogenetic clade V. In grapevine, four genes belong to clade V. VvMLO7, 11 and 13 are up-regulated during PM infection, while VvMLO6 is not.

Chapter 2 reports the genome-wide characterization and sequence analysis of the MLO gene family in apple, peach and woodland strawberry, and the isolation of apricot MLO homologs. Twenty-one homologues were found in apple, 19 in peach and 17 in woodland strawberry. Evolutionary relationships between MLO homologs were studied and syntenic blocks constructed. Candidate genes for causing PM susceptibility were inferred by phylogenetic relationships with functionally characterized MLO genes and, in apple, by monitoring their expression following inoculation with the PM causal pathogen P. leucotricha. In apple, clade V genes MdMLO11 and 19 were up-regulated, whereas the two other members of clade V, MdMLO5 and 7, were not up-regulated. The clade VII gene MdMLO18 was also up-regulated upon P. leucotricha infection.

Chapter 3 reports the knock-down, through RNA interference, of MdMLO11 and 19, as well as complementation of the mutant phenotype by expression of the MdMLO18 gene in the Arabidopsis thaliana triple mlo mutant Atmlo2/6/12. The knock-down of MdMLO19 resulted in a reduction of PM disease severity up to 75%, whereas the knock-down of MdMLO11, alone or combined with MdMLO19, did not cause any reduction or additional reduction of susceptibility compared to MdMLO19 alone. Complementation by MdMLO18 did not restore susceptibility. Cell wall appositions (papillae), a response to PM infection, were found in both susceptible plants and PM resistant plants where MdMLO19 was knocked-down, but were larger in resistant lines. The expression analysis of 17 genes related to plant defense, and quantification of phenolic metabolites in resistant lines revealed line-specific changes compared to the control.

Chapter 4 evaluates the presence of non-functional alleles of the MdMLO19 S-gene in apple germplasm. The screening of the re-sequencing data of 63 apple genotypes led to the identification of 627 SNP in five MLO genes (MdMLO5, MdMLO7, MdMLO11, MdMLO18 and MdMLO19). Insertion T-1201 in MdMLO19 caused the formation of an early stop codon, resulting in a truncated protein lacking 185 amino-acids and the calmodulin-binding domain. The presence of the insertion was evaluated in a collection of 159 apple genotypes: it was homozygous in 53 genotypes, 45 of which were resistant or very resistant to PM, four partially susceptible and four not assessed. These results strongly suggest that this insertion is causative for the observed PM resistance. The absence of a clear fitness cost associated to the loss-of-function of MdMLO19, might have contributed to the high frequency of the mutation in breeding germplasm and cultivars. Among the genotypes containing the homozygous insertion, ‘McIntosh’ and ‘Fuji’ are commonly used in apple breeding. After barley and tomato, apple is the third species with a reported natural non-functional mlo allele in its germplasm, with the important difference that the allele is present in a relatively large number of apple genotypes, most of which not related to each other.

Chapter 5 reports the knock-down through RNA interference of four grapevine MLO genes, all members of clade V. VvMLO7, 11 and 13 are up-regulated in early stages of infection, whereas VvMLO6 is not responsive to the pathogen. Knock-down of VvMLO6, 11 and 13, alone or combined, did not decrease PM severity, whereas the knock-down of VvMLO7, alone or in combination with VvMLO6 and VvMLO11, caused a reduction of severity of 77%. Cell wall appositions (papillae), a response to PM attack, were present in both resistant and susceptible lines, but were larger in resistant lines. Thirteen genes involved in defense were less up-regulated in resistant plants, highlighting the reduction of PM disease severity.

In Chapter 6 we discuss the results presented in this thesis. The pivotal role of MLO genes in the interaction of PM pathogens with apple and grapevine is described and further experiments aimed at addressing open questions are proposed. The results described in this thesis open interesting avenues in MLO genes research, particularly the finding that a natural mlo mutation in apple appeared to be more common than expected. This mutation is directly applicable in marker assisted breeding for durable PM resistance in apple.

Alternatieve methoden voor chemische bodemontsmetting voor de appelteelt op zandgrond
Wenneker, M. ; Steeg, P.A.H. van der; Visser, J.H.M. ; Korthals, G.W. - \ 2014
Randwijk : Praktijkonderzoek Plant en Omgeving, Bloembollen, Boomkwekerij & Fruitteelt - 21
malus domestica - appels - bodemmoeheid - plantenparasitaire nematoden - pratylenchus penetrans - grondsterilisatie - biologische grondontsmetting - tagetes patula - biologische bestrijding - biofumigatie - ziektebestrijdende teeltmaatregelen - compost - grondverbeteraars - geïntegreerde plagenbestrijding - veldproeven - nederland - apples - soil sickness - plant parasitic nematodes - soil sterilization - biological soil sterilization - biological control - biofumigation - cultural control - composts - soil amendments - integrated pest management - field tests - netherlands
Met name op zandgronden speelt de problematiek van herinplantziekte. Zonder grondontsmetting lijkt herinplant van fruitbomen niet rendabel. Een van de veroorzakers van herinplantziekte is het wortellesieaaltje (Pratylenchus penetrans). Op een appelperceel met een vrij hoge bodembesmetting van het wortellesieaaltje Pratylenchus penetrans (één van de veroorzakers van bodemmoeheid) zijn na het rooien van de bomen in het voor en najaar van 2007 zeven verschillende behandelingen toegepast: Tagetes (‘Afrikaantje’), Tagetes + biologische grondontsmetting, Japanse haver (Avena strigosa) + late biologische grondontsmetting, biofumigatie met Sarepta mosterd, compost, zwarte braak en natte grondontsmetting (controle behandelingen). De methode met Afrikaantjes en die met Afrikaantjes gecombineerd met Biologische grondontsmetting (BGO) bleken de populaties van Pratylenchus aanzienlijk te reduceren, bijna net zo goed als natte grondontsmetting. Afrikaantjes bestrijden de aaltjes en door de combinatie met BGO worden ook andere (bodemmoeheid veroorzakende) ziekteverwekkers bestreden. Compost en late BGO hadden een vergelijkbaar effect als onbehandelde grond. Na biofumigatie was de aaltjespopulatie toegenomen.
Molecular aspects of columnar growth in apple
Wolters, P.J. - \ 2014
Wageningen University. Promotor(en): Evert Jacobsen, co-promotor(en): P. Baldi; Henk Schouten. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789462570849 - 163
malus domestica - appels - boomvorm - plantenveredeling - moleculaire veredeling - onderstammen - genomica - marker assisted breeding - apples - tree architecture - plant breeding - molecular breeding - rootstocks - genomics
Meer middelen voor schurftbestrijding : proefresultaten van 2009, 2010 en 2011
Vlas, M.J. de; Jong, P.F. de; Balkhoven-Baart, J.M.T. - \ 2012
Randwijk : Praktijkonderzoek Plant & Omgeving, Bloembollen, Boomkwekerij en Fruit (Rapport / PPO 2012-25) - 70
appels - malus domestica - plantenziekteverwekkende schimmels - venturia inaequalis - chemische bestrijding - fungiciden - nederland - apples - plant pathogenic fungi - chemical control - fungicides - netherlands
In de appelteelt is er behoefte aan meer middelen, die werken tegen schurft. Twee aandachtspunten zijn daarbij het verlagen van de kans op resistentie en het verlagen van residu op de vruchten. Van 2009 t/m 2011 zijn op het proefbedrijf van Praktijkonderzoek Plant en Omgeving in Randwijk experimenten uitgevoerd met diverse middelen en strategieën, die werden getoetst tegen schurft. De bespuitingen werden uitgevoerd in het primaire seizoen. Er werden waarnemingen gedaan aan kortlot en langlot bladeren en vruchten. In 2009 werden nieuwe middelen getest, in 2010 en 2011 werden combinaties van nieuwe middelen en strategieën getest. Belangrijk is dat de hier geteste, curatief ingezette nieuwe middelen geen kans geven op resistentie. Bovendien geven deze middelen en de nieuwe stopspray middelen geen residu.
New Insight into the History of Domesticated Apple: Secondary Contribution of the European Wild Apple to the Genome of Cultivated Varieties
Cornille, A. ; Gladieux, P. ; Smulders, M.J.M. ; Roldán-Ruiz, I. ; Laurens, F. ; Cam, B. le; Nersesyan, A. ; Clavel, J. ; Olonova, M. ; Feugey, L. ; Gabrielyan, I. ; Zhang, Xiu-Guo ; Tenaillon, M.I. ; Giraud, T. - \ 2012
Plos Genetics 8 (2012)5. - ISSN 1553-7404
appels - malus domestica - domesticatie - voorouders - wilde verwanten - genetische bronnen van plantensoorten - genetische diversiteit - apples - domestication - ancestors - wild relatives - plant genetic resources - genetic diversity - approximate bayesian computation - multilocus genotype data - allele frequency data - sylvestris l. mill. - population-structure - microsatellite markers - molecular-genetics - spondias-purpurea - genus malus - fruit tree
The apple is the most common and culturally important fruit crop of temperate areas. The elucidation of its origin and domestication history is therefore of great interest. The wild Central Asian species Malus sieversii has previously been identified as the main contributor to the genome of the cultivated apple (Malus domestica), on the basis of morphological, molecular, and historical evidence. The possible contribution of other wild species present along the Silk Route running from Asia to Western Europe remains a matter of debate, particularly with respect to the contribution of the European wild apple. We used microsatellite markers and an unprecedented large sampling of five Malus species throughout Eurasia (839 accessions from China to Spain) to show that multiple species have contributed to the genetic makeup of domesticated apples. The wild European crabapple M. sylvestris, in particular, was a major secondary contributor. Bidirectional gene flow between the domesticated apple and the European crabapple resulted in the current M. domestica being genetically more closely related to this species than to its Central Asian progenitor, M. sieversii. We found no evidence of a domestication bottleneck or clonal population structure in apples, despite the use of vegetative propagation by grafting. We show that the evolution of domesticated apples occurred over a long time period and involved more than one wild species. Our results support the view that self-incompatibility, a long lifespan, and cultural practices such as selection from open-pollinated seeds have facilitated introgression from wild relatives and the maintenance of genetic variation during domestication. This combination of processes may account for the diversification of several long-lived perennial crops, yielding domestication patterns different from those observed for annual species.
PowMil-model helpt bij middelenkeuze voor meeldauwbestrijding : resultaten uit model- en middelenonderzoek van PPO Fruit
Jong, P.F. de; Bruine, J.A. de - \ 2012
De Fruitteelt 102 (2012)12. - ISSN 0016-2302 - p. 14 - 15.
fruitteelt - plantenziekten - meeldauw - plantenziektebestrijding - appels - malus domestica - landbouwkundig onderzoek - pesticiden - fruit growing - plant diseases - mildews - plant disease control - apples - agricultural research - pesticides
In de appelteelt richt de aandacht zich bij schurft en meeldauw vooral op de schurft en voegen telers telers extra fungiciden toe om de meeldauw te bestrijden Deze aanpak is niet altijd effectief. In sommige gevallen ontstaat er onverwacht toch meeldauw. Twee vragen. Valt het optimale bestrijdingsmoment voor meeldauw altijd samen met dat van schurft? Of ligt het aan een verminderde werking van middelen? Bodata en PPO Fruit werkten in 2009-2011 aan de modellering van echte meeldauw in appel. Daarnaast voerde PPO Fruit een middelenvergelijking uit.
Onderzoek naar het verbreken van winterrust bij Malus 'Elstar'
Sluis, B.J. van der; Kers, M. - \ 2006
Lisse : PPO Bomen (PPO rapport 3231105200) - 38
malus domestica - rustbreking - plantenontwikkeling - inoculatie - onderstam-ent relatie - afwijkingen, planten - vruchtbomen - appels - bomen - fruitteelt - dormancy breaking - plant development - inoculation - rootstock scion relationships - plant disorders - fruit trees - apples - trees - fruit growing
In een driejarig onderzoek is aangetoond dat vooral bij Elstar op onderstam M9 sprake is van een ongelijktijdige verbreking van de winterrust. Dit veroorzaakt problemen, zoals `slapers en dromers¿ (niet of slecht uitlopen van de ogen) en bloeden op de knipplaats. De fysiologische ontwikkeling van de onderstam M9 loopt dan teveel voor op die van Elstar die nog gedeeltelijk in winterrust verkeert. Op basis van de Cumulative Cold Degree-Hours (CCDH) ¿ bepaald met een klimaatmodel van Croppings - is het moment van winterrustverbreking bij Malus `Elstar¿ goed vast te stellen. Deze conclusie is vooral gebaseerd op de relatie tussen de CCDH en de uitloopsnelheid van de ogen. De optimale opbouw van de koudesom vindt plaats tussen de 2C en 9ºC. De trajecten 1-2ºC en 9-12ºC dragen in mindere mate bij aan de koudeopbouw. Uit de analyse blijkt dat de winterrustverbreking bij Elstar ligt bij een CCDH van 1.200 eenheden en bij de onderstam M9 op circa 950 eenheden. In de meeste gevallen wordt het moment van de winterrustverbreking van M9 in de tweede helft van januari bereikt. Onder optimale omstandigheden is bij Elstar de winterrust dus ruim 10 dagen later volledig opgeheven. Dit betekent globaal dat gedurende deze 10 dagen de temperatuur niet onder de 1ºC en boven de 12ºC mag komen en dat vorst in deze periode dus niet bijdraagt aan de koudesom. Met winterrustdoorbrekende middelen wordt de ongelijkheid in koudebehoefte opgeheven. Onder geconditioneerde omstandigheden in de kas is aangetoond dat de toepassing van winterrustdoorbrekende middelen het uitlopen van de ogen activeert en het bloeden van de knipbomen beperkt. Dit is met name aangetoond voor het middel Dormex. Op basis van de resultaten uit de eerste proef mag hetzelfde verwacht worden van Armo Break. Cytokinine houdende producten hadden geen effect op het eerder verbreken van de winterrust.
Ondersteuning IRRY in de praktijk : begeleiding van de introductie van het wateradviessysteem IRRY in de teelt van appel en peer in Nederland
Maas, M.P. van der - \ 2004
Randwijk : Praktijkonderzoek Plant & Omgeving, Sector Fruit - 15
irrigatiesystemen - waterbehoefte - fruitteelt - appels - malus domestica - peren - pyrus communis - nederland - irrigation systems - water requirements - fruit growing - apples - pears - netherlands
In veel fruitpercelen in Nederland is het groeiniveau te hoog. Met het verdwijnen van CCC als groeiregulator voor peer is dit probleem nog versterkt. De groei en beurtjarigheid bij Elstar is vaak in mee of minder mate nog een probleem. Daarnaast stellen regionale overheden normen voor het watergebruikt en de milieubelasting. Gecontroleer minder watergeven met behulp van IRRY, een adviessysteem voor de watervoorziening, kan leiden tot groeireductie. Kennisoverdracht van deze methode naar voorlichters en fruitteleers is in dit verband van belang. Het doel van dit onderzoek is het begeleiden van telers en voorlichters bij de introductie het watergeefadviessysteem alsmede het middels onderzoek beantwoorden van regionale vragen.
Minimum kwaliteitsnormen bij appel : consequenties van de Minoltamethode voor overige kwaliteitskenmerken
Jager, A. de; Schoorl, F.W. ; Westerweele, C.G. - \ 2004
Randwijk : Praktijkonderzoek Plant & Omgeving, Sector Fruit - 43
appels - malus domestica - gewaskwaliteit - bepaling - kwalitatieve methoden - fruitteelt - nederland - apples - crop quality - determination - qualitative methods - fruit growing - netherlands
Op Europees niveau vindt overleg plaats met het oog op afspraken over algemeen geldende normen voor kwaliteit van appelen. Daarbij worden lagere minimumnormen overwogen op het gebied van diameter en gewicht en wellicht ook nieuwe minimumnormen voor suiker (%brix). In Nederland wordt al een aantal jaren een methode toegepast op basis van kleurmetingen om bij het begin van het nieuwe seizoen onrijp fruit van de markt te weren. Omdat men in Nederland graag de kleurmethode wil behouden is het van belang om mogelijke conflicten met andere minimumnormen in kaart te brengen. In opdracht van het PT heeft PPO-fruit een analyse uitgevoerd met gebruik van gegevens die vanaf 1989 zijn verzameld in het kader van meerdere projecten. Deze metingen omvatten meestal een langere reeks van metingen gedurende een aantal weken vóór de oogst en tijdens de plukperiode. Bij de kleurmethode wordt gebruik gemaakt van het verband tussen de grondkleur bij pluk en de smaak na één week uitstallen bij kamertemperatuur. De kleurmeting omvat de kenmerken groen (a-waarde), geel (bwaarde) en intensiteit van de kleur (L-waarde). Formules voor het verband tussen kleur bij pluk en smaak na één week zijn ontwikkeld voor de rassen Cox, Elstar, James Grieve, Delcorf, Alkmene en Elan, bij beide laatste rassen slechts op basis van gegevens van één jaar. Met behulp van deze formules is voor alle genoemde rassen, voor alle jaren en voor alle percelen waarvan voldoende gegevens beschikbaar waren, berekend op welk moment de grenswaarde voor smaak van 5,5 (op een schaal van 1-10) werd bereikt. Vervolgens is vastgesteld wat de bijbehorende waarde was van de overige kwaliteitskenmerken vruchtgewicht of –maat, hardheid, zetmeelstadium, %brix, en %zuur. Voor deze analyse waren geschikte gegevens beschikbaar voor Cox van 6 jaren, voor Elstar van 8 jaren, voor James Grieve van 4 jaren, voor Delcorf van 3 jaren en voor Alkmene en Elan van 1 jaar (van Delcorf, Alkmene en Elan naast kleurgegevens alleen gegevens van vruchtgewicht, vruchtmaat en zetmeelstadium)
Verslag van een bespuitingsproef tegen stip in Cox's Orange Pippin appels te Wilhelminadrop in 1978, met de middelen kalksalpeter (Flakes en Prills), calciumchloride, Wuxal suspensie 2 en Ferrocal (calciumvetzuraat)
Delver, P. ; Oele, J. - \ 1979
Haren : Instituut voor Bodemvruchtbaarheid (Nota / Instituut voor Bodemvruchtbaarheid 77) - 19
malus domestica - appels - spuiten - kalksalpeter - stip - apples - spraying - calcium nitrate - bitter pit
Check title to add to marked list

Show 20 50 100 records per page

Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.