Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

Current refinement(s):

Records 1 - 20 / 35

  • help
  • print

    Print search results

  • export

    Export search results

  • alert
    We will mail you new results for this query: keywords==microbial flora
Check title to add to marked list
Influence of pectin supplementation on feed fermentation characteristics in rats and pigs
Tian, L. - \ 2016
Wageningen University. Promotor(en): Harry Gruppen; Henk Schols. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789462577282 - 142 p.
pigs - rats - pectins - feed supplements - dietary fibres - digestion - digestive tract - carbohydrates - microbial flora - nutrition physiology - animal nutrition - food chemistry - varkens - ratten - pectinen - voedersupplementen - voedingsvezels - spijsvertering - spijsverteringskanaal - koolhydraten - microbiële flora - voedingsfysiologie - diervoeding - voedselchemie

The physiological effects of dietary fiber (DFs) depend on several factors including structural features of the DFs, composition and activity of colonic microbiota, and products formed during fermentation. In this thesis, the influence of pectin supplementation to feed fermentation characteristics in rats and pigs was studied. The non-starch polysaccharides (NSP) present in the selected feed ingredient oats were characterized. Distinct populations of arabinoxylans (AXs) were observed in oats, compared to those reported for other cereals like wheat and barley. The fate of cereal AXs and soybean pectin during fermentation and the consequent effects on appetite regulation and fat accumulation were studied in rats as a model. Oat AXs were fermented less rapidly than wheat AXs in the caecum of rats. Soy pectin was fermented more early and efficiently than cereal AXs. A significant inverse correlation between rat retroperitoneal fat-pad weight and concentration and relative SCFA proportion of butyrate was observed. In a following in vivo rat experiment, commercial soy pectin together with three other soluble pectins originating from citrus and sugar beet and differing in their methyl esterification were individually supplemented to the diets. Their effects on the utilization of the different DFs present in the feed and the consequent effect on the microbial community in the colon of rats was studied. All pectins were fermented rapidly and consequently shifted fermentation of other consumed DFs (e.g. cereal AXs) to more distal part of colon, although low-methyl esterified pectin was more efficiently fermented by the microbiota than high-methyl esterified pectin. Results suggested that pectins can confer beneficial health effects through modulation of the gut microbiota. In a last in vivo experiment, citrus pectins together with a hydrothermal treated soybean meal were supplemented to pig diets to study their effect on the digestion and fermentation of carbohydrates in both the small and large intestine. Pectins, and more particularly low-methyl esterified pectin, decreased the ileal digestibility of digestible starch resulting in more starch to be fermentated in the proximal colon of pigs. Consequently, also the fermentation patterns of DFs and the microbiota composition was affected. All pectins tested shaped the colonic microbiota from a Lactobacillus-dominated microbiota to a Prevotella-dominated community, with potential health-promoting effects.

Aantasting afhankelijk van vier factoren: Zijn het de schimmels, de plant of de omstandigheden?
Arkesteijn, M. ; Paternotte, S.J. - \ 2012
Onder Glas 9 (2012)2. - p. 13 - 15.
glastuinbouw - cultuurmethoden - plantenplagen - teeltsystemen - plantenziekteverwekkende schimmels - microbiële flora - weerstand - kasgewassen - greenhouse horticulture - cultural methods - plant pests - cropping systems - plant pathogenic fungi - microbial flora - resistance - greenhouse crops
Alleen onder de juiste omstandigheden, kunnen schimmels en andere ziekten zich ontwikkelen en een plant aantasten. In dit artikel geeft plantenziektekundige Pim Paternotte inzicht in de factoren die een rol spelen bij de ontwikkeling van plantenziekten en hoe deze te voorkomen.
Microbial enrichment of torrefied grass fibers : a novel ingredient of potting soil
Trifonova, R.D. - \ 2008
University of Groningen. Promotor(en): J.D. van Elsas, co-promotor(en): Joeke Postma. - [S.l.] : S.n. - ISBN 9789036736695 - 146
groeimedia - vezels - hooi - grassen - microbiële flora - verrijking - verbeteraars - fytotoxiciteit - growing media - fibres - hay - grasses - microbial flora - enrichment - amendments - phytotoxicity
Interacties tussen plantparasitaire nematoden en hun natuurlijke vijanden in buitenduinen
Piskiewicz, A.M. - \ 2008
Gewasbescherming 39 (2008)2. - ISSN 0166-6495 - p. 67 - 69.
ammophila arenaria - duinen - tylenchorhynchus - plantenparasitaire nematoden - natuurlijke vijanden - gastheer parasiet relaties - verdedigingsmechanismen - microbiële flora - ecosystemen - duingebieden - dunes - plant parasitic nematodes - natural enemies - host parasite relationships - defence mechanisms - microbial flora - ecosystems - duneland
De resultaten van de experimenten van dit promotieonderzoek samen met de beschikbare gegevens van het EcoTrain-project over nematodenonderdrukking in buitenduinen laat zien dat de regulatie van nematoden veel complexer is dan tevoren werd verondersteld. Het regulatiemechanisme hangt niet alleen af van het voedseltype, maar ook van de soort nematode. De conclusie is dat vaak meer dan één factorbetrokken is bij de succesvolle onderdrukking van nematoden. Hoewel nematodenpopulaties succesvol onderdrukt kunnen worden in natuurlijke ecosystemen, is nematode-onderdrukking in de landbouw niet altijd succesvol. De resultaten van het EcoTrain-project doen sterk vermoeden dat een scala aan controlemechanismen nodig zou kunnen zijn voor nematode-onderdrukking in de landbouw en in andere productiesystemen
Managing the developing gut microbiota of growing piglets - novel probiotic and prebiotic strategies
Yao, W. - \ 2008
Wageningen University. Promotor(en): Martin Verstegen, co-promotor(en): Hauke Smidt; W.Y. Zhu. - [S.l.] : S.n. - ISBN 9789085048169 - 168
biggen - spenen - microbiële flora - darmen - spijsverteringskanaal - selectieve bijvoedering - probiotica - polymerase-kettingreactie - voedingsfysiologie - microbiota van het spijsverteringskanaal - prebiotica - piglets - weaning - microbial flora - intestines - digestive tract - creep feeding - probiotics - polymerase chain reaction - nutrition physiology - gastrointestinal microbiota - prebiotics
Keywords: creep feeding, weaning, intestinal microbiota, Lactobacillus sobrius, prebiotics, daidzein, probiotics, 16S rRNA, DGGE, cloning, real-time PCR
Nursing is a major critical period in the life of piglets. On one hand maternal antibodies are not able to cross the placenta, thus piglets are born without circulating antibodies and consequently lack maternal passive protection. On the other hand, creep-feeding and weaning increase susceptibility to gut disorders, infections and diarrhea. Therefore clarification of the composition and function of the normal gut microbiota of piglets is pivotal as a knowledge base for the design of innovative nutritional strategies based on pre- and probiotics to keep piglets healthy. The objectives of this study were to describe the composition and function of the intestinal microbiota of piglets during the nursing period through creep feeding and weaning, to in vivo and in vitro evaluate the effect of daidzein on composition and function of intestinal microbiota of nursing piglets in order to evaluate its prebiotic function, and to investigate the probiotic effect of Lactobacillus sobrius S1 on composition and function of intestinal microbiota of nursing piglets.
The porcine intestinal microbiota development and diversity, the in vivo and in vitro evaluation of prebiotic effect of daidzein and the investigation of probiotic effect of Lactobacillus sobrius S1 on composition and function of intestinal microbiota of piglets during nursing period through creep feeding and weaning was described using real-time PCR, and PCR analysis of 16S ribosomal RNA gene by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and cloning, in combination with analysis of gas production, lactate and VFA yield. The data obtained during the course of the study indicated that 1) Early creep-feeding stabilizes the microbiota of piglets around the weaning period. 2) Lactobacillus communities follow a successional change associated with piglet growth and diet shifting. Creep feeding stabilizes the Lactobacillus community of weaning piglets. Within the Lactobacillus community, some members like L. reuteri and L. amylovorus / L. sobrius might be permanent colonizers, while L. delbruckii, L. acidophilus and L. crispatus are more likely to be transient members of the Lactobacillus communities in the piglet´s GI tract. 3) Both in vitro and in vivo evaluations indicated that daidzein has the potential for use as a prebiotic additive in animal feed. 4) Lactobacillus sobrius S1 has the potential of promoting beneficial bacteria and inhibiting pathogens.
Ziektewerende bodems
Postma, Joeke - \ 2007
cultural methods - plant protection - disease prevention - edaphic factors - soil properties - soil analysis - microbial flora
Interactions of plant parasitic nematodes and their natural enemies in coastal foredunes
Piskiewicz, A.M. - \ 2007
Wageningen University. Promotor(en): Wim van der Putten. - [S.l.] : S.n. - ISBN 9789085047988 - 139
ammophila arenaria - duinen - tylenchorhynchus - plantenparasitaire nematoden - natuurlijke vijanden - gastheer parasiet relaties - verdedigingsmechanismen - microbiële flora - bodemflora - ecosystemen - duingebieden - natuurgebieden - dunes - plant parasitic nematodes - natural enemies - host parasite relationships - defence mechanisms - microbial flora - soil flora - ecosystems - duneland - natural areas
Plant-ectoparasitaire nematoden zijn belangrijke bodembewonende planteneters. Het doel van dit proefschrift was de interacties tussen de ectoparasiet Tylenchorhynchus ventralis, de gastheerplant Ammophila arenaria (helmgras) en de natuurlijke vijanden van de nematode op te helderen. Deze studie was bedoeld om een meer compleet overzicht te krijgen van nematodeonderdrukkingmechanismen in buitenduinen.
Microbiological methods for assessing soil quality
Bloem, J. ; Hopkins, D.W. ; Benedetti, A. - \ 2006
Wallingford (UK) : CABI - ISBN 0851990983 - 307
bodem - micro-organismen - bodembiologie - microbiële flora - microbiologie - methodologie - monitoring - interacties - biodiversiteit - bodemkwaliteit - soil - microorganisms - soil biology - microbial flora - microbiology - methodology - interactions - biodiversity - soil quality
This book provides a selection of microbiological methods that are already applied in regional or national soil quality monitoring programs. It is split into two parts: part one gives an overview of approaches to monitoring, evaluating and managing soil quality. Part two provides a selection of methods, which are described in sufficient detail to use the book as a practical handbook in the laboratory. The methods are described in chapters on soil microbial biomass and numbers, soil microbial activity, soil microbial diversity and community composition, and plant-microbe interactions and soil quality.
Beinvloedt mengteelt de ziektewerendheid van bodems tegen bodempathogenen?
Hiddink, G.A. ; Termorshuizen, A.J. ; Raaijmakers, J.M. ; Bruggen, A.H.C. van - \ 2005
Gewasbescherming 36 (2005)5. - ISSN 0166-6495 - p. 200 - 205.
gewasbescherming - landbouwplantenteelt - cultuurmethoden - ziektepreventie - gemengde teelt - gewasmengsels - monocultuur - bodemschimmels - weerstand - bodem - bodemfactoren - grondanalyse - micro-organismen - microbiële flora - polymerase-kettingreactie - plant protection - crop husbandry - cultural methods - disease prevention - mixed cropping - crop mixtures - monoculture - soil fungi - resistance - soil - edaphic factors - soil analysis - microorganisms - microbial flora - polymerase chain reaction
Mengteelten worden veelal beschouwd als stabiele teeltsystemen met een grotere oogstzekerheid dan monoculturen en minder schade door pathogenen. Uit kasexperimenten waarin de ziektewerendheid tegen drie bodempathogenen werd bepaald van grond afkomstig van een mono- of mengteelt bleek dat de ziektewering niet werd verhoogd door de toepassing van een mengteelt in het veld. De ziektewerendheid van de bodem bleek meer afhankelijk van het gewas dat erop geteeld werd, waarbij de teelt van gerst de meest ziektewerende grond bleek op te leveren. Nitraat- en ammoniumconcentraties van de grond waren niet gecorreleerd met de ziektewerendheid. Ook blijkt dat mengteelt niet of in slechts geringe mate een correlatie heeft met de microbiële populatiesamenstelling buiten de rhizosfeer. Ook de microbiële activiteit in een mengteelt was niet hoger dan die van een monocultuur. Ondanks het feit dat de ziektewerendheid van grondmonsters niet werd verhoogd door het telen van een menggewas heeft de teeltwijze wel positieve effecten zoals een hogere opbrengst aan organische stof en minder problemen met ziekten en onkruiden in de geteelde menggewassen zelf
Lactobacilli in the porcine intestine: from composition to functionality
Konstantinov, S.R. - \ 2005
Wageningen University. Promotor(en): Willem de Vos, co-promotor(en): Hauke Smidt; A.D.L. Akkermans. - Wageningen : S.n. - ISBN 908504233X - 206
lactobacillus - microbiële flora - darmmicro-organismen - varkens - microbial flora - intestinal microorganisms - pigs
Microbial Eco-Physiology of the human intestinal tract: a flow cytometric approach
Amor, K. Ben - \ 2004
Wageningen University. Promotor(en): Willem de Vos, co-promotor(en): Tjakko Abee. - Wageningen : S.n. - ISBN 9085040426 - 166
microbiële activiteiten - darmen - darmmicro-organismen - microbiële flora - fluorescentie - technieken - microbial activities - intestines - intestinal microorganisms - microbial flora - fluorescence - techniques
Melkkwaliteit onvoorspelbaar?
Schuiling, E. - \ 2003
Praktijkkompas. Rundvee 17 (2003)2. - ISSN 1570-8586 - p. 6 - 7.
melkkwaliteit - melk - melkhygiëne - kiemgetal - bacteriën - microbiële flora - antibiotica - antibioticumresiduen - groeiremmers - agrarische bedrijfsvoering - celgetal - bedrijfshygiëne - milk quality - milk - milk hygiene - bacterial count - bacteria - microbial flora - antibiotics - antibiotic residues - growth inhibitors - farm management - somatic cell count - industrial hygiene
Op verzoek van het Productschap Zuivel gaat het Praktijkonderzoek de mogelijke oorzaken van dergelijke uitschieters in kaart brengen. Naast het kiemgetal worden ook kortingen op groeiremming meegenomen, alhoewel de problematiek daar heel anders is.
The Soil Microbial Community and Soil Tillage
Andrade, D.S. ; Colozzi-Filho, A. ; Giller, K.E. - \ 2003
In: Soil Tillage in Agroecosystems / El Titi, A., Boca Raton : CRC Press - ISBN 0849312280 - p. 51 - 81.
bodembiologie - microbiële flora - grondbewerking - biodiversiteit - soil biology - microbial flora - tillage - biodiversity
Bruikbaarheid van Biolog voor de bepaling van de functionele diversiteit van de microbiële populatie in grond
Velvis, H. ; Veninga, M. ; Bolhuis, P. - \ 1998
Haren [Gn] : AB-DLO - 13
microbiologie - bodemflora - microbiële flora - meting - afmetingen - microbiology - soil flora - microbial flora - measurement - dimensions
Ordination techniques for analysing response of biological communities to toxic stress in experimental ecosystems.
Wijngaarden, R.P.A. van; Brink, P.J. van den; Oude Voshaar, J.H. ; Leeuwangh, P. - \ 1995
Ecotoxicology 4 (1995). - ISSN 0963-9292 - p. 66 - 77.
microbiële flora - persistentie - pesticidenresiduen - pesticiden - gewasbescherming - bodemflora - bioaccumulatie - ecotoxicologie - microbial flora - persistence - pesticide residues - pesticides - plant protection - soil flora - bioaccumulation - ecotoxicology
The ordination techniques Principal Component Analysis (PCA) and Redundancy Analysis (RDA) are considered to be useful tools for evaluating community responses in experimental ecotoxicology. Concepts and interpretation of these techniques are summarized. Application of PCA and RDA is illustrated in a case-study.
Themadag Stikstofstromen in de Vollegrondsgroenteteelt
Haverkort, A.J. ; Zwart, K.B. ; Struik, P.C. ; Dekker, P.H.M. ; Bosch, H.K.J. - \ 1994
Lelystad : PAGV (Themaboekje / Proefstation voor de Akkerbouw en de Groenteteelt in de Vollegrond 18) - 111
groenten - groenteteelt - mineralen - boekhouding - microbiologie - bodemflora - microbiële flora - bodemchemie - anorganische verbindingen - stikstof - bodem - uitspoelen - nederland - vollegrondsteelt - vegetables - vegetable growing - minerals - accounting - microbiology - soil flora - microbial flora - soil chemistry - inorganic compounds - nitrogen - soil - leaching - netherlands - outdoor cropping
Population dynamics and nitrogen mineralization rates in soil as influenced by bacterial grazing nematodes and mites
Brussaard, L. ; Kools, J.P. ; Bouwman, L.A. - \ 1991
In: Advances in management and conservation of soil fauna : [10th International Soil Zoology Colloquium held during August 7-13, 1988, at Bangalore, India] / Veeresh, G.K., Rajagopal, D., Viraktamath, C.A., Oxford & IBH - p. 517 - 523.
microbiële flora - microbiologie - mineralisatie - bodemflora - microbial flora - microbiology - mineralization - soil flora
Themadag bodemgebonden plagen en ziekten van aardappelen
Anonymous, - \ 1991
Lelystad : PAGV [etc.] (Themaboekje / Proefstation voor de Akkerbouw en de Groenteteelt in de Vollegrond nr.12) - 78
microbiële flora - micro-organismen - plantenziekten - plantenziekteverwekkende bacteriën - plantenziekteverwekkende schimmels - plantenziektekunde - plantenvirussen - aardappelen - bodemfauna - bodemflora - solanum tuberosum - microbial flora - microorganisms - plant diseases - plant pathogenic bacteria - plant pathogenic fungi - plant pathology - plant viruses - potatoes - soil fauna - soil flora
Onderzoek naar het kiemgetal en de aard van de microflora van snijbloemstengels en naar de invloed van deze microflora op het vaasleven van vers geoogste snijbloemen
Put, H.M.C. - \ 1985
Wageningen : Sprenger Instituut (Nota / Sprenger Instituut no. 21) - 7
micro-organismen - microbiële flora - snijbloemen - houdbaarheid (kwaliteit) - vaasleven - microorganisms - microbial flora - cut flowers - keeping quality - vase life
Het effect van melkzuur op de microflora van pluimveevlees
Bolder, N.M. ; Broex, N.J.G. - \ 1985
Wageningen : RIKILT (Rapport / RIKILT 85.51) - 4
pluimveevlees - melkzuur - microbiële flora - voedselmicrobiologie - poultry meat - lactic acid - microbial flora - food microbiology
Check title to add to marked list
<< previous | next >>

Show 20 50 100 records per page

Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.