Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

Records 1 - 20 / 31

  • help
  • print

    Print search results

  • export

    Export search results

  • alert
    We will mail you new results for this query: q=Knaapen
Check title to add to marked list
Impact of oral vancomycin on gut microbiota, bile acid metabolism, and insulin sensitivity
Vrieze, A. ; Out, C. ; Fuentes Enriquez de Salamanca, S. ; Jonker, L. ; Reuling, I. ; Kootte, R.S. ; Nood, E. van; Holleman, F. ; Knaapen, M. ; Romijn, J.A. ; Soeters, M.R. ; Blaak, E.E. ; Dallinga-Thie, G.M. ; Reijnders, D. ; Ackermans, M.T. ; Serlie, M.J. ; Knop, F.K. ; Holst, J.J. ; Ley, C.V. ; Kema, I.P. ; Zoetendal, E.G. ; Vos, W.M. de; Hoekstra, J.B. ; Stroes, E.S. ; Groen, A.K. ; Nieuwdorp, M. - \ 2014
Journal of Hepatology 60 (2014)4. - ISSN 0168-8278 - p. 824 - 831.
salt hydrolase activity - diet-induced obesity - intestinal microbiota - energy-expenditure - mice - resistance - adiposity - glucagon - capacity - humans
BACKGROUND: Obesity has been associated with changes in the composition and function of the intestinal microbiota. Modulation of the microbiota by antibiotics also alters bile acid and glucose metabolism in mice. Hence, we hypothesized that short term administration of oral antibiotics in humans would affect fecal microbiota composition and subsequently bile acid and glucose metabolism. METHODS: In this single blinded randomized controlled trial, 20 male obese subjects with metabolic syndrome were randomized to 7 days of amoxicillin 500mg t.i.d. or 7 days of vancomycin 500mg t.i.d. At baseline and after 1 week of therapy, fecal microbiota composition (Human Intestinal Tract Chip phylogenetic microarray), fecal and plasma bile acid concentrations as well as insulin sensitivity (hyperinsulinemic euglycemic clamp using [6,6-2H2]-glucose tracer) were measured. RESULTS: Vancomycin reduced fecal microbial diversity with a decrease of gram-positive bacteria (mainly Firmicutes) and a compensatory increase in gram-negative bacteria (mainly Proteobacteria). Concomitantly, vancomycin decreased fecal secondary bile acids with a simultaneous postprandial increase in primary bile acids in plasma (p
Obesity, non-alcoholic fatty liver disease, and atherothrombosis: a role for the intestinal microbiota?
Knaapen, M. ; Kootte, R.S. ; Zoetendal, E.G. ; Vos, W.M. de; Dallinga-Thie, G.M. ; Levi, M. ; Stroes, E.S. ; Nieuwdorp, M. - \ 2013
Clinical Microbiology and Infection 19 (2013)4. - ISSN 1198-743X - p. 331 - 337.
lipopolysaccharide-binding protein - gut microbiota - insulin-resistance - vitamin-k - metabolic syndrome - cardiovascular-disease - innate immunity - global burden - germfree-mice - high-density
Whereas the association between intestinal microorganisms and health has been widely accepted in the area of infectious disease, recent advances have now implied a role for the intestinal microbiota in human energy balance. In fact, numerous studies support an intricate relationship between the intestinal microbiota and obesity, as well as subsequent insulin resistance and non-alcoholic fatty liver disease. Intestinal microorganisms also seem to be involved in haemostatic tone and atherogenesis. However, as most of the findings stem from observational data, intervention studies in humans using interventions selectively aimed at altering the composition and activity of the intestinal microbiota are crucial to prove causality. If substantiated, this could open the arena for modulation of the intestinal microbiota as a future target in obesity-associated disease, both as a diagnostic test for personalized algorithms and for selective therapeutic strategies
B-Carotene metabolites enhance inflammation-induced oxidative DNA damage in lung epithelial cells
Helden, Y.G.J. ; Keijer, J. ; Knaapen, J.P. ; Heil, S.G. ; Briedé, J.J. ; Schooten, F.J. van; Godschalk, R.W.L. - \ 2009
Free Radical Biology and Medicine 46 (2009)2. - ISSN 0891-5849 - p. 299 - 304.
nonsteroidal antiinflammatory drugs - retinoic acid - respiratory-tract - epidemiologic evidence - cancer prevention - alpha-tocopherol - free-radicals - myeloperoxidase - risk - neutrophils
ß-Carotene (BC) intake has been shown to enhance lung cancer risk in smokers and asbestos-exposed subjects (according to the ATBC and CARET studies), but the mechanism behind this procarcinogenic effect of BC is unclear. Both smoking and asbestos exposure induce an influx of inflammatory neutrophils into the airways, which results in an increased production of reactive oxygen species and formation of promutagenic DNA lesions. Therefore, the aim of our study was to investigate the effects of BC and its metabolites (BCM) on neutrophil-induced genotoxicity. We observed that the BCM vitamin A (Vit A) and retinoic acid (RA) inhibited the H2O2-utilizing enzyme myeloperoxidase (MPO), which is released by neutrophils, thereby reducing H2O2 conversion. Moreover, BC and BCM were able to increase ·OH formation from H2O2 in the Fenton reaction (determined by electron spin resonance spectroscopy). Addition of Vit A and RA to lung epithelial cells that were co-incubated with activated neutrophils resulted in a significant increase in the level of oxidized purines assessed by the formamidopyrimidine DNA glycosylase-modified comet assay. These data indicate that BCM can enhance neutrophil-induced genotoxicity by inhibition of MPO in combination with subsequent increased formation of hydroxyl radicals.
Ecologische landschapsindex (ELI); een nadere uitwerking van de: graadmeter ruimtelijke samenhang & graadmeter hydrologische relaties
Eupen, M. van; Gaast, J.W.J. van der; Knaapen, J.P. - \ 2001
Wageningen : Alterra (Alterra-rapport 432) - 88
landschapsecologie - landschapsbescherming - monitoring - verandering - duurzaamheid (sustainability) - landgebruik - hydrologie - graadmeter - grondwater - oppervlaktewater - landscape ecology - landscape conservation - change - sustainability - land use - hydrology
Het Meetnet Landschap beoogt een systematische monitoring van de effecten van veranderingen in het landschap op de identiteit en de duurzaamheid in het licht van het streven naar het behoud van landschappelijke kwaliteit. In totaal zijn negen meetdoelen omschreven. Het meetdoel 6 betreft de landschapsecologische kwaliteit van het landschap. Ter operationalisatie van dit meetdoel is in opdracht van het Expertisecentrum LNV het project Ecologische landschapsIndex (ELI) gestart. Het project wordt uitgevoerd door het Alterra en Bureau Vista. Als eerste resultaat heeft het project een theoretische verkenning van aspecten van landschappelijke kwaliteit opgeleverd. In deze verkenning worden vier mogelijke graadmeters voor landschapsecologische kwaliteit onderscheiden, op het gebied van ruimtelijke samenhang, hydrologische relaties, stofstromen en landschappelijke heterogeniteit. Dit rapport is een nadere uitwerking van de graadmeters ruimtelijke samenhang en hydrologische relaties.
Versnippering en de toekomstige ontwikkeling van infrastructuur
Cuperus, R. ; Fliervoet, L. ; Grift, E.A. van der; Hoogeveen, Y.R. ; Jaarsma, C.F. ; Kamphorst, D.A. ; Knaapen, J.P. ; Piepers, A.A.G. ; Snep, R.P.H. ; Soesbergen, M. ; Wit, A.J.W. de - \ 2001
In: Infrastructuur en natuur; versnippering en ontsnippering. Nationaal overzicht in het kader van COST-actie 341. DWW Ontsnipperingsreeks Deel 39 / Piepers, A.A.G., Delft : Rijkswaterstaat - p. 113 - 132.
infrastructuur - landschapsecologie - natuur - simulatiemodel - versnippering
HACOBERM-II; eindrapport van een haalbaarheidsstudie naar de habitat- en corridorfunctie van wegbermen
Eupen, M. van; Knaapen, J.P. - \ 2000
Wageningen : Alterra (Alterra-rapport 24) - 167
wegbermplanten - wegbermen - vegetatie - wegbeplantingen - habitats - monitoring - fauna - verspreiding - bedrijfsvoering - nederland - netwerken - roadside plants - roadsides - vegetation - roadside plantations - dispersal - management - netherlands - networks
Dit rapport betreft een haalbaarheidsstudie naar de mogelijkheden om bij aanleg, inrichting en beheer van rijkswegen bij te dragen aan de habitat- en corridorfunctie van wegbermen voor dieren. Er wordt een overzicht gegeven van beschikbare kennis, mogelijkheden voor de toepassing daarvan en bruikbare gegevensbestanden. Voorgesteld wordt om een beslissingondersteunend systeem te ontwikkelen op basis van bestaande informatie. Allereerst komen hiervoor in aanmerking soorten waarvoor de berm optimaal habitat kan vormen: een aantal soorten kleine zoogdieren, amfibiel reptielen, dagvlinders, loopkevers en sprinkhanen/krekels. In tweede instantie komen ook andere soorten in aanmerking, waarvoor de berm marginaal habitat of functiegebied is.
Biologische kwaliteit van rivierecotopen : een methodische verkenning
Knaapen, J.P. - \ 1999
Wageningen : DLO-Staring Centrum (Rapport / DLO-Staring Centrum 649) - 151
ecosystemen - rivieren - wetlands - natuurbescherming - nederland - ecohydrologie - ecosystems - rivers - nature conservation - netherlands - ecohydrology
Ecologische Landschaps Index : graadmeter hydrologische relaties
Knaapen, J.P. ; Gaast, J.W.J. van der; Eupen, M. van - \ 1999
Wageningen : DLO-Staring Centrum (SC-Rapport 702) - 31
Ecologische Landschaps Index : graadmeter ruimtelijke samenhang
Knaapen, J.P. ; Eupen, M. van; Jansen, S. - \ 1999
Wageningen : DLO-Staringcentrum (Onderzoekreeks Nota Landschap nr. 15) - 35
landschap - landschapsecologie - kwaliteit - ecosystemen - monitoring - beleid - vegetatie - nederland - landscape - landscape ecology - quality - ecosystems - policy - vegetation - netherlands
Landschapsecologische modellen: instrumentarium
Knaapen, J.P. - \ 1999
In: Landschapsecologie; natuur en landschap in een veranderende samenleving / van Dorp, D., Canters, K.J., Kalkhoven, J.T.R., Laan, P.,
Biologische kwaliteit van rivierecotopen; een methodische verkenning
Knaapen, J.P. ; Knol, W.C. ; Runhaar, J. ; Roosenschoon, O. - \ 1999
Wageningen : SC-DLO (Rapport 649) - 151 p.
Een methode wordt ontwikkeld voor de beoordeling en toetsing van de biologische kwaliteit van rivierecotopen, op basis van monitoringgegevens. De volledigheid van aanwezige kenmerkende soorten wordt gekozen als basiskenmerk. Dit wordt uitgewerkt tot een graadmeter, voor het niveau van een afzonderlijke ecotoop en dat van een gebied. Methodische en theoretische aspecten hiervan worden besproken. Kenmerkende soorten worden geselecteerd uit de groepen hogere planten, zoogdieren, vogels, amfibieën en reptielen, vissen, dagvlinders en macrofauna. De methode wordt getoetst aan veldgegevens van het gebied De Duursche Waarden. De methode lijkt het meest kansrijk, het minst problematisch en het goedkoopst bij toepassing op gebiedniveau.
Ecologische landschapsindex (E.L.I.); graadmeter ruimtelijke samenhang
Knaapen, J.P. ; Eupen, M. van - \ 1999
Wageningen : SC-DLO (Rapport 687) - 35 p.
Ecologische Landschapsindex (E.L.I.); graadmeter hydrologische relaties
Knaapen, J.P. ; Gaast, J.W.J. van der; Eupen, M. van - \ 1999
Wageningen : SC-DLO (Rapport 702) - 31 p.
Veerkracht van zoete en brakke wateren; een benadering vanuit ecologie en ruimte
Knaapen, J.P. ; Klijn, J. ; Eupen, M. van - \ 1999
Wageningen : Staring Centrum - 64
watersystemen - duurzaamheid (sustainability) - ecosystemen - biodiversiteit - veerkracht van de natuur - water systems - sustainability - ecosystems - biodiversity - resilience of nature
Veerkracht wordt behandeld als ecologisch concept, met nadruk op de theoretische ecologie en ruimtelijke aspecten daarvan. Geconstateerd wordt dat het begrip beleidsmatig aantrekkelijk is. De betekenis ervan hangt echter af van de functies en waarden van de betrokken systemen. De relatie met ecologische begrippen als stabiliteit, evenwicht, weerstand en duurzaamheid wordt verkend. Gesteld wordt dat veerkracht vermoedelijk een grote rol speelt in - vooral dynamische - systeemtypen. Veerkracht wordt opgevat als een mechanisme dat bijdraagt aan het voortbestaan van de natuur. Andere mechanismen zijn weerstand, buffering en afscherming/isolatie. Voorbeelden van veerkrachtige processen worden besproken, alsmede implicaties voor beleid en beheer.
Vergelijking landschapsoecologische modellen van het Instituut voor Bos en Natuuronderzoek (IBN-DLO) en het Staring Centrum, Instituut voor Onderzoek van het Landelijk Gebied (SC-DLO)
Graveland, J. ; Knaapen, J.P. - \ 1998
Wageningen : IBN-DLO - 51
landschap - landschapsecologie - modellen - onderzoek - onderzoeksinstituten - proefstations - nederland - technische informatie - landscape - landscape ecology - models - research - research institutes - experimental stations - netherlands - technical information
Conceptueel raamwerk voor een ecologische landschapsindex : Vista, eindrapportage, 20 december 1997
Jansen, S.R.J. ; Harms, W.B. ; Knaapen, J.P. - \ 1998
Wageningen : DLO-Staring Centrum (Rapport / DLO-Staring Centrum 624) - 45
landschapsecologie - biogeografie - transport - voedingsstoffen - platteland - patronen - landscape ecology - biogeography - nutrients - rural areas - patterns
Conceptueel raamwerk voor een ecologische landschapsindex
Jansen, S.R.J. ; Harms, W.B. ; Knaapen, J.P. - \ 1998
Wageningen : SC-DLO (Rapport 624) - 45 p.
Applying ecological knowledge in landscape planning: a simulation model as a tool to evaluate scenarios for the badger in the Netherlands.
Apeldoorn, R.C. van; Knaapen, J.P. ; Schippers, J. ; Verboom, J. ; Engen, H. van; Meeuwsen, H. - \ 1998
Landscape and Urban Planning 41 (1998). - ISSN 0169-2046 - p. 57 - 69.
The distribution of the Eurasian badger (Meles meles, L.) in the Netherlands is fragmented and adult mortality is high in many places because of traffic casualties. Both these facts affect the survival and dispersal of badgers in a negative way and are suggested to be the main causes of the decline of this species. For this reason the species receives special attention from the government in the national Nature Policy Plan and also from the lower administration in the provinces in their policy on physical planning and nature conservation. To evaluate changes in land use by means of spatial scenarios and conservation strategies in favour of the species, an individual-based simulation model was built that describes population dynamics in space and time. The model was used to evaluate three scenarios. The results indicate that the survival of groups benefits strongly from measures directed at lowering adult mortality. Also the (re)colonization of suitable but not inhabited areas increases the survival and is favoured by measures that encourage dispersal. The results indicate that simulation models as described are useful tools for establishing the comparative effectiveness of plans or measures aimed at increasing the viability of the species.
Connectivity analysis and evaluation of measures by means of fauna dispersal modelling
Bakker, J. ; Knaapen, J.P. ; Schippers, P. - \ 1997
In: Habitat fragmentation & infrastructure / Canters, K.J., Piepers, A.A.G., Hendriks-Heersma, D., - p. 354 - 361.
Fauna dispersal modelling: a spatial approach
Bakker, J. ; Knaapen, J.P. ; Schippers, P. - \ 1997
In: Habitat fragmentation & infrastructure / Canters, K.J., Piepers, A.A.G., Hendriks-Heersma, D., - p. 183 - 192.
Check title to add to marked list
<< previous | next >>

Show 20 50 100 records per page

Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.