Informatie voor professionals in voedsel en groen

Informatie voor professionals in voedsel en groen

  • externe gebruiker (Let opwarning)
  • Log in as
  • Over Groenekennis


    Groenekennis - Informatie voor professionals in voedsel en groen

    Groenekennis bevat artikelen uit vaktijdschriften, rapporten, video’s, presentaties, posters en websites op het gebied van landbouw, visserij, groene ruimte en voeding. Groenekennis wordt dagelijks bijgewerkt en bevat ongeveer 500.000 bronnen.

    Groenekennis is de globale view over diverse deelbestanden. Groenekennis is gevuld met alle informatie uit Groen Kennisnet, de Hydrotheek, Tuinpad, IB archief, ARTIK, bioKennis, Kennisbank Plantaardige bronnen, Kennisbank Zeldzame landbouwhuisdieren en afgesloten documentatiebestanden zoals Land Bodem Water en Consumenten- en huishoudstudies.

    Groen Kennisnet is een zeer belangrijk onderdeel van Groenekennis. De doelstelling van Groen Kennisnet is kennis delen op het gebied van Voedsel en Groen te bevorderen en te faciliteren voor een breed publiek.

    Bronnen in Groenekennis kunnen direct opgevraagd worden via een geavanceerde zoekmachine met een 'google-achtige' interface. Met filters kan ingezoomd worden op diverse aspecten, zoals Trefwoord, Collectie, Jaar en Auteur. Bovendien biedt Groenekennis gebruikers de mogelijkheid om via de E-mail geattendeerd te worden op aanvullingen in specifieke vakgebieden.
    De Tijdschriftenlijst biedt een overzicht van tijdschriften waaruit de artikelen voor Groenekennis worden geselecteerd. Door te klikken op een titel krijgt u alle artikelen uit dat tijdschrift in de Groenekennis database getoond.
    Zoeken op kaart biedt een geografische ingang op de beschikbare publicaties over de binnen dit bestand onderscheiden gebieden.

    Groenekennis is onderdeel van het bibliotheeksysteem van WUR. Praktijkgerichte publicaties en rapporten van WUR komen daardoor automatisch beschikbaar. Daarnaast wordt de database doorlopend gevuld met voor het groen onderwijs bruikbare bronnen en artikelen, video’s en websites. Het percentage online is de laatste jaren gegroeid tot tweederde van de totale aanwas per jaar. Dit percentage groeit nog steeds.

    Over
Record nummer 1936594
Titel artikel Estimating genetic diversity across the neutral genome with the use of dense marker maps
Auteur(s) Engelsma, K.A. ; Calus, M.P.L. ; Bijma, P. ; Windig, J.J.
Tijdschrifttitel Genetics, selection, evolution
Deel(Jaar)Nummer 42(2010)12
Online full text
Trefwoorden (cab) populatiegenetica / computersimulatie / genetische diversiteit / merkergenen
Rubrieken Kwantitatieve- en populatiegenetica
Publicatie type Artikel
Taal Engels
Toelichting (Engels) With the advent of high throughput DNA typing, dense marker maps have become available to investigate genetic diversity on specific regions of the genome. The aim of this paper was to compare two marker based estimates of the genetic diversity in specific genomic regions lying in between markers: IBD-based genetic diversity and heterozygosity. A computer simulated population was set up with individuals containing a single 1-Morgan chromosome and 1665 SNP markers and from this one, an additional population was produced with a lower marker density i.e. 166 SNP markers. For each marker interval based on adjacent markers, the genetic diversity was estimated either by IBD probabilities or heterozygosity. Estimates were compared to each other and to the true genetic diversity. The latter was calculated for a marker in the middle of each marker interval that was not used to estimate genetic diversity. The simulated population had an average minor allele frequency of 0.28 and an LD (r2) of 0.26, comparable to those of real livestock populations. Genetic diversities estimated by IBD probabilities and by heterozygosity were positively correlated, and correlations with the true genetic diversity were quite similar for the simulated population with a high marker density, both for specific regions (r = 0.19-0.20) and large regions (r = 0.61-0.64) over the genome. For the population with a lower marker density, the correlation with the true genetic diversity turned out to be higher for the IBD-based genetic diversity. Genetic diversities of ungenotyped regions of the genome (i.e. between markers) estimated by IBD-based methods and heterozygosity give similar results for the simulated population with a high marker density. However, for a population with a lower marker density, the IBD-based method gives a better prediction, since variation and recombination between markers are missed with heterozygosity.
Reacties
Er zijn nog geen reacties. U kunt de eerste schrijven!
Schrijf een reactie
 

To support researchers to publish their research Open Access, deals have been negotiated with various publishers. Depending on the deal, a discount is provided for the author on the Article Processing Charges that need to be paid by the author to publish an article Open Access. A discount of 100% means that (after approval) the author does not have to pay Article Processing Charges.

For the approval of an Open Access deal for an article, the corresponding author of this article must be affiliated with Wageningen University & Research.

U moet eerst inloggen om gebruik te maken van deze service. Login als Wageningen University & Research user of guest user rechtsboven op deze pagina.