Staff Publications

Refereed article in a journal

2014

• Deciphering microbial landscapes of fish eggs to mitigate emerging diseases
  Liu, Y. ; Bruijn, I. de; Jack, A.L.H. ; Drynan, K. ; Berg, A.H. van den; Thoen, E. ; Sandoval-Sierra, V. ; Skaar, I. ; West, P. van; Diéguez-Uribeondo, J. ; Voort, M. van der; Mendez, R. ; Mazzola, M. ; Raaijmakers, J.M. (2014)
  ISME Journal 8 . - p. 2002 - 2014.

2013

• Distinctive expansion of potential virulence genes in the genome of the oomycete fish pathogen Saprolegnia parasitica
  Jiang, R.H.Y. ; Bruijn, I. de; Haas, B.J. ; Belmonte, R. ; Löbach, L. ; Christie, J. ; Ackerveken, G. van den; Bottin, A. ; Bulone, V. ; Díaz-Moreno, S.M. ; Dumas, B. ; Fan, L. ; Gaulin, E. ; Govers, F. ; Grenville-Briggs, L.J. ; Horner, N.R. ; Levin, J.Z. ; Mammella, M. ; Meijer, H.J.G. ; Morris, P. ; Nusbaum, C. ; Oome, S. ; Phillips, A.J. ; Rooyen, D. van; Rzeszutek, E. ; Saraiva, M. ; Secombes, C.J. ; Seidl, M.F. ; Snel, B. ; Stassen, J.H.M. ; Sykes, S. ; Tripathy, S. ; Berg, H. ; Vega-Arreguin, J.C. ; Wawra, S. ; Young, S.K. ; Zeng, Q. ; Dieguez-Uribeondo, J. ; Russ, C. ; Tyler, B.M. ; West, P. van (2013)
  Plos Genetics 9 (6). - 20 p.

2011

• Presence/absence, differential expression and sequence polymorphisms between PiAVR2 and PiAVR2-like in Phytophthora infestans determine virulence on R2 plants
  Gilroy, E.M. ; Breen, S. ; Whisson, S.C. ; Squires, J. ; Hein, I. ; Kaczmarek, M. ; Turnbull, D. ; Boevink, P.C. ; Lokossou, A.A. ; Cano, L.M. ; Morales, J. ; Avrova, A.O. ; Pritchard, L. ; Randall, E. ; Lees, A. ; Govers, F. ; West, P. van; Kamoun, S. ; Vleeshouwers, V.G.A.A. ; Cooke, D.E.L. ; Birch, P.R.J. (2011)
  New Phytologist 191 (3). - p. 763 - 776.

2010

• Genome sequence of the necrotrophic plant pathogen Pythium ultimum reveals original pathogenicity mechanisms and effector repertoire
  Lévesque, C.A. ; Brouwer, H. ; Cano, L. ; Hamilton, J.P. ; Holt, C. ; Huitema, E. ; Raffaele, S. ; Robideau, G.P. ; Thines, M. ; Win, J. ; Zerillo, M.M. ; Beakes, G.W. ; Boore, J.L. ; Busam, D. ; Dumas, B. ; Ferriera, S. ; Fuerstenberg, S.I. ; Gachon, C.M.M. ; Gaulin, E. ; Govers, F. ; Grenville-Briggs, L. ; Horner, N. ; Hostetler, J. ; Jiang, R.H.Y. ; Johnson, J. ; Krajaejun, T. ; Lin, H. ; Meijer, H.J.G. ; Moore, B. ; Morris, P. ; Phuntmart, V. ; Puiu, D. ; Shetty, J. ; Stajich, J.E. ; Tripathy, S. ; Wawra, S. ; West, P. van; Whitty, B.R. ; Coutinho, P.M. ; Henrissat, B. ; Martin, F. ; Thomas, P.D. ; Tyler, B.M. ; Vries, R.P. de; Kamoun, S. ; Yandell, M. ; Tisserat, N. ; Buell, C.R. (2010)
  Genome Biology 11 (7). - 22 p.

2009

• Genome sequence and analysis of the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans
  Haas, B.J. ; Kamoun, S. ; Zody, M.C. ; Jiang, R.H.Y. ; Handsaker, R.E. ; Cano, L.M. ; Grabherr, M. ; Kodira, C.D. ; Raffaele, S. ; Torto-Alalibo, T. ; Bozkurt, T.O. ; Ah-Fong, A.M.V. ; Alvarado, L. ; Anderson, V.L. ; Armstrong, M.R. ; Avrova, A. ; Baxter, L. ; Beynon, J. ; Boevink, P.C. ; Bollmann, S.R. ; Bos, J.I.B. ; Bulone, V. ; Cai, G. ; Cakir, C. ; Carrington, J.C. ; Chawner, M. ; Conti, L. ; Costanzo, S. ; Ewan, R. ; Fahlgren, N. ; Fischbach, M.A. ; Fugelstad, J. ; Gilroy, E.M. ; Gnerre, S. ; Green, P.J. ; Grenville-Briggs, L.J. ; Griffith, J. ; Grunwald, N.J. ; Horn, K. ; Horner, N.R. ; Hu, C.H. ; Huitema, E. ; Jeong, D.H. ; Jones, A.M.E. ; Jones, J.D.G. ; Jones, R.W. ; Karlsson, E.K. ; Kunjeti, S.G. ; Lamour, K. ; Liu, Z. ; Ma, L. ; Maclean, D. ; Chibucos, M.C. ; McDonald, H. ; McWalters, J. ; Meijer, H.J.G. ; Morgan, W. ; Morris, P.F. ; Munro, C.A. ; O'Neill, K. ; Ospina-Giraldo, M. ; Pinzon, A. ; Pritchard, L. ; Ramsahoye, B. ; Ren, Q. ; Restrepo, S. ; Roy, S. ; Sadanandom, A. ; Savidor, A. ; Schornack, S. ; Schwartz, D.C. ; Schumann, U.D. ; Schwessinger, B. ; Seyer, L. ; Sharpe, T. ; Silvar, C. ; Song, J. ; Studholme, D.J. ; Sykes, S. ; Thines, M. ; Vondervoort, P.J.I. van de; Phuntumart, V. ; Wawra, S. ; Weide, R. ; Win, J. ; Young, C. ; Zhou, S. ; Fry, W. ; Meyers, B.C. ; West, P. van; Ristaino, J. ; Govers, F. ; Birch, P.R.J. ; Whisson, S.C. ; Judelson, H.S. ; Nusbaum, C. (2009)
  Nature 461 . - p. 393 - 398.

2008

• Gene expression profiling during asexual development of the late blight pathogen Phytophthora infestans reveals a highly dynamic transcriptome
  Judelson, H.S. ; Ah-Fong, A.M.V. ; Aux, G. ; Avrova, A.O. ; Bruce, C. ; Cakir, C. ; Cunha, L. da; Grenville-Briggs, L. ; Latijnhouwers, M. ; Ligterink, W. ; Meijer, H.J.G. ; Roberts, S. ; Thurber, C.S. ; Whisson, S.C. ; Birch, P.R.J. ; Govers, F. ; Kamoun, S. ; West, P. van; Windass, J. (2008)
  Molecular Plant-Microbe Interactions 21 (4). - p. 433 - 447.

• Internuclear gene silencing in Phytophthora infestans is established through chromatin remodelling
  West, P. van; Shepherd, S.J. ; Walker, C.A. ; Li, S. ; Appiah, A.A. ; Grenville-Briggs, L. ; Govers, F. ; Gow, N.A.R. (2008)
  Microbiology 154 (5). - p. 1482 - 1490.

2005

• Large-scale gene discovery in the oomycete Phytophthora infestans reveals likely components of phytopathogenicity shared with true fungi
  Randall, T.A. ; Dwyer, R.A. ; Huitema, E. ; Beyer, K. ; Cvitanich, C. ; Kelkar, H. ; Ah Fong, A.M.V. ; Gates, K. ; Roberts, S. ; Yatzkan, E. ; Gaffney, T. ; Law, M. ; Testa, A. ; Torto-Alalibo, T. ; Zhang Meng, ; Zheng Li, ; Mueller, E. ; Windass, J. ; Binder, A. ; Birch, P.R.J. ; Gisi, U. ; Govers, F. ; Gow, N.A. ; Mauch, F. ; West, P. van; Waugh, M.E. ; Yu Jun, ; Boller, T. ; Kamoun, S. ; Lam, S.T. ; Judelson, H.S. (2005)
  Molecular Plant-Microbe Interactions 18 (3). - p. 229 - 243.

2004

• A G alpha subunit controls zoospore motility and virulence in the potato late blight pathogen Phytophthora infestans
  Latijnhouwers, M. ; Ligterink, J.W. ; Vleeshouwers, V.G.A.A. ; West, P. van; Govers, F. (2004)
  Molecular Microbiology 51 (4). - p. 925 - 936.

Non-refereed book chapters

2004

• The Phytophthora infestans - potato interaction
  West, P. van; Vleeshouwers, V.G.A.A. (2004)
  In: Plant Pathogen Interactions Blackwell Scientific Publishers, (Annual plant reviews 11) - p. 219 - 242.

Abstract

2011

• Presence/absence polymorphism and differential expression of two diverged forms of PiAVR2 in Phytophthora infestans determine virulence on R2 plants
  Gilroy, E.M. ; Breen, S. ; Whisson, S.C. ; Squires, J. ; Hein, I. ; Lokossou, A.A. ; Boevink, P.C. ; Morales, J. ; Avrova, A.O. ; Pritchard, L. ; Turnbull, D. ; Kaczmarek, M. ; Cano, L. ; Randall, E. ; Govers, F. ; West, P. van; Kamoun, S. ; Vleeshouwers, V. ; Cooke, D.E.L. ; Birch, P.R.J. (2011)
  In: Book of Abstracts Oomycete Molecular Genetics Network Meeting, Asilomar, Pacific Grove, California, USA, 13-15 March 2011. - - p. 14 - 14.