Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

    Current refinement(s):

    Records 1 - 20 / 145

    • help
    • print

      Print search results

    • export

      Export search results

    Check title to add to marked list
    Glass eel monitoring in the Netherlands
    Griffioen, A.B. ; Vries, P. de; Twijnstra, R.H. ; Graaf, M. de - \ 2017
    IJmuiden : Wageningen Marine Research (Wageningen Marine Research rapport C010/17) - 41
    anguilla - european eels - eels - monitoring - netherlands - anguilla - european eels - palingen - monitoring - nederland
    In general there are three subjects described in this report: 1. Overview and brief evaluation of glass eel monitoring projects along the Dutch coast 2. Exploration of a national glass eel index based on multiple datasets along the Dutch Coast 3. Analysis of the relation between tidal currents and glass eel monitoring at Den Oever. The aim of this report is to evaluate the glass eel monitoring in the Netherlands, explore the possibility to produce a national glass eel index and to give advice on monitoring glass eel and selecting new locations.
    Report on the eel stock and fishery in the Netherlands 2015/2016
    Graaf, Martin de; Bos, Oscar G. - \ 2017
    IJmuiden : Wageningen Marine Research (Wageningen Marine Research rapport C003/17) - 59
    eels - anguilla - fish stocks - fisheries - netherlands - palingen - anguilla - visstand - visserij - nederland
    Aanpassing programma monitoring aal ter ondersteuning beleidskader open/gesloten gebieden
    Kotterman, Michael - \ 2016
    IJmuiden : Wageningen Marine Research (Wageningen Marine Research rapport C084/16) - 34
    palingen - monitoring - visserij - toxicologie - visserijbeleid - eels - monitoring - fisheries - toxicology - fishery policy
    Dit rapport beschrijft een aanpassing van het bestaande aalmonitoringsprogramma dat ingezet kan worden voor het te ontwikkelen beleidskader. De aanpassingen zijn op basis van bestaande data. Dit nieuwe protocol is voor het eerst toegepast op het aal monitoringsprogramma in 2016.
    Dioxines, dioxineachtige- en niet dioxineachtige PCB’s in rode aal uit Nederlandse binnenwateren : resultaten van 2016
    Leeuwen, S.P.J. van; Hoogenboom, L.A.P. ; Kotterman, M.J.J. - \ 2016
    Wageningen : RIKILT Wageningen University & Research (RIKILT-rapport 2016.016) - 33
    palingen - osteichthyes - monitoring - dioxinen - polychloorbifenylen - binnenwateren - besmetting - nederland - eels - osteichthyes - monitoring - dioxins - polychlorinated biphenyls - inland waters - contamination - netherlands
    In 2016 zijn in het kader van het monitoringsprogramma “Monitoring contaminanten ten behoeve van de Nederlandse sportvisserij” 14 zoetwaterlocaties en één zoutwater locatie bemonsterd. Hiervan liggen twaalf locaties binnen het voor aalvisserij gesloten gebied en voor de overige 3 locaties is de aalvisserij toegestaan. Alle locaties zijn in voorgaande jaren al bemonsterd, behalve de Weespertrekvaart, die voor het eerst is bemonsterd in 2016. Dit jaar is voor de bemonstering van grote alen rekening gehouden met het zwaartepunt van de beroepsmatige vangst, waardoor meestal iets grotere aal is bemonsterd (>53 cm) dan in voorgaande jaren (was >45 cm).
    Literatuurstudie watertemperatuur en glasaaluitzetting
    Schram, Edward ; Graaf, Martin de - \ 2016
    IJmuiden : Wageningen Marine Research (Wageningen Marine Research rapport C086/16) - 20
    palingen - temperatuur - watertemperatuur - eels - temperature - water temperature
    De doelen van deze studie zijn: - Het verkrijgen van inzicht in de richtlijnen voor de watertemperatuur in de protocollen voor het uitzetten van glasaal in andere Europese landen; - Nagaan of er sinds 2009 nieuwe onderzoeksresultaten zijn gepubliceerd in de wetenschappelijke literatuur die relevant zijn voor temperatuurrichtlijnen voor het uitzetten van glasaal in het buitenwater.
    Persistent organic pollutants : aberrant DNA methylation underlying potential health effects
    Dungen, M.W. van den - \ 2016
    Wageningen University. Promotor(en): Tinka Murk; Ellen Kampman, co-promotor(en): Wilma Steegenga; Dieuwertje van Gils-Kok. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789462577893 - 207
    persistent organic pollutants - dna methylation - molecular genetics - epigenetics - health hazards - toxic substances - endocrine disruptors - eels - fish consumption - toxicology - persistente organische verontreinigende stoffen - dna-methylering - moleculaire genetica - epigenetica - gezondheidsgevaren - toxische stoffen - hormoonverstoorders - palingen - visconsumptie - toxicologie

    Wild caught fish, especially marine fish, can contain high levels of persistent organic pollutants (POPs). In the Netherlands, especially eel from the main rivers have high POP levels. This led to a ban in 2011 on eel fishing due to health concerns. Many of the marine POPs have been related to adverse health effects such as endocrine disruption, neurodevelopmental problems, immune suppression and cancer. Although some mechanisms of action of POPs are clear, like dioxins binding to the aryl hydrocarbon receptor and OH-PCBs binding to thyroid transport proteins, not all adverse health effects can be explained by these mechanisms of action. Epigenetic phenomena, such as DNA methylation, have been proposed as a possible molecular mechanism underlying adverse health effects. DNA methylation is a heritable modification, which refers to the addition of a methyl group to cytosine in a CpG dinucleotide. Observational studies have indeed shown that POPs can affect global DNA methylation, although results are inconsistent. Some animal studies as well as in vitro experiments suggest that POPs can affect gene-specific DNA methylation, however, the biological significance and relevance for humans is not clear. Therefore, this thesis aimed to 1) study the accumulation of POPs in men consuming eel from high-polluted areas 2) elucidate whether seafood-related POPs can induce aberrant DNA methylation and 3) to determine whether DNA methylation is related to functional endpoints and gene expression in vitro.

    For this purpose eight POPs that are abundantly present in seafood were chosen, namely 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD), polychlorobiphenyl (PCB) 126 and 153, perfluorooctanesulfonic acid (PFOS), hexabromocyclododecane (HBCD), 2,2′,4,4′- tetrabromodiphenyl ether (BDE-47), tributyltin (TBT), and methylmercury (MeHg). Chapter 2 describes the in vitro effects of these POPs and mixtures thereof in H295R adrenocortical carcinoma cells. Relative responses for 13 steroid hormones and 7 genes involved in the steroidogenic pathway, and CYP1A1, were analysed. PFOS induced the most pronounced effects on steroid hormone levels by significantly affecting 9 out of 13 hormone levels measured, with the largest increases found for 17β-estradiol, corticosterone, and cortisol. Furthermore, TCDD, both PCBs, and TBT significantly altered steroidogenesis. Increased steroid hormone levels were accompanied by related increased gene expression levels. The differently expressed genes were MC2R, CYP11B1, CYP11B2, and CYP19A1 and changes in gene expression levels were more sensitive than changes in hormone levels. The POP mixtures tested showed mostly additive effects, especially for DHEA and 17β-estradiol levels. This study shows that some seafood POPs are capable of altering steroidogenesis in H295R cells at concentrations that mixtures might reach in human blood, suggesting that adverse health effects cannot be excluded. DNA methylation was not measured in this study due to the short exposure time, which was expected not to be sufficient for long-term epigenetic marks. Therefore, in chapters 3A and 3B a differentiation experiment was performed enabling long-term exposure to POPs. Human mesenchymal stem cells (hMSCs) were differentiated into mature adipocytes over a time-course of 10 days. The transcriptional regulatory cascade involved in adipocyte differentiation has been extensively studied, however the mechanisms driving the transcription are poorly understood. In chapter 3A we therefore first explored the involvement of DNA methylation in transcriptional regulation during adipocyte differentiation. Genome-wide changes in DNA methylation were measured as well as the expression of adipogenic genes. The majority of these genes showed significant expression changes during the differentiation process. There were, however, only a couple of these differentially expressed genes that were differentially methylated. Genome-wide DNA methylation changes were most often located in intergenic regions, and underrepresented close to the transcription start site. This suggested that changes in DNA methylation are not the underlying mechanism regulating gene expression during adipocyte differentiation. Nevertheless, we explored DNA methylation differences after continuous exposure to POPs to investigate whether this could be an underlying mechanism by which POPs affect adipocyte differentiation. TCDD and PFOS decreased lipid accumulation, while TBT increased lipid accumulation. TCDD and TBT induced opposite gene expression profiles, whereas after PFOS exposure gene expression remained relatively stable. Genome-wide DNA methylation analysis showed that all three POPs affected DNA methylation patterns in adipogenic and other genes, but without concomitant gene expression changes. Differential methylation was again predominantly detected in intergenic regions, where the biological relevance of alterations in DNA methylation is unclear. This study demonstrated that POPs, at environmentally relevant levels, are able to induce differential DNA methylation in differentiating adipocytes. However, the biological relevance of this aberrant DNA methylation remains unclear.

    The in vitro results showed a proof of principle that POPs could be capable of altering DNA methylation. To this date, no human studies were performed investigating the relationship between POP levels and genome-wide DNA methylation. In order to investigate this, we first measured POP levels in eel consumers from the high-polluted areas (areas with a ban on eel fishing) and compared these levels to men consuming eel from low-polluted areas or aquaculture (chapter 4). We aimed to investigate the accumulation of these POPs and determine whether the predictions made in an earlier risk assessment were valid. This was indeed the case as levels of dioxins and dioxin-like compounds were on average 2.5 times higher in men consuming eel from high-polluted areas. Furthermore, PCBs with their hydroxylated metabolites, and perfluoroalkyl substances (PFASs) were, up to ten times, higher in these consumers. Especially the high levels of dioxins and dioxin-like compounds as well as the OH-PCBs are expected to be of health concern. We continued this research in chapter 5 by associating all the measured POPs to clinical parameters related to e.g. thyroid hormones and liver enzymes, but found no relationship. Subsequently, we investigated the association between dioxins and dioxin-like compounds, the sum of seven indicator PCBs, and PFOS with genome-wide DNA methylation. We detected a number of differentially methylated regions (DMRs) related to genes involved in carcinogenesis (e.g. BRCA1, MAGEE2, HOXA5), the immune system (e.g. RNF39, HLA-DQB1), in retinol homeostasis (DHRS4L2), or in metabolism (CYP1A1). In contrast to the in vitro data, most significant effects were detected in CpG islands and were annotated close to the promoter region. This suggests that the differential methylation might be related to differential expression and possibly induce adverse health effects. The hypermethylation of some of these gene related to cancer could be an explanation of the carcinogenic effects that are observed with POP exposure.

    Based on the results of this thesis we can conclude that the consumption of eel from high-polluted areas lead to accumulation of POPs above safe levels and that POP levels are associated with gene-specific DNA methylation in vitro as well as in environmentally exposed men. More research, however, is needed to fully elucidate the biological implications of this aberrant DNA methylation. A first step can be to measure histone modifications, as these two epigenetic marks together are likely better in predicting gene expression. The second step can be to investigate the potential health effects related to these epigenetic marks and to determine whether there is a causal relationship. Although at this point there is a lack of knowledge with regard to health effects caused by DNA methylation, the consumption of eel from these high-polluted areas is ill- advised, because adverse health effects cannot be excluded based on our results and can even be expected based on literature.

    Dioxines, dioxineachtige- en niet dioxineachtige PCB's in rode aal uit Nederlandse binnenwateren 2015
    Kotterman, M.J.J. ; Dam, G. ten; Hoogenboom, L.A.P. ; Leeuwen, Stefan van - \ 2016
    IMARES (Rapport / IMARES C016/16) - 28
    palingen - osteichthyes - monitoring - dioxinen - polychloorbifenylen - binnenwateren - besmetting - nederland - eels - osteichthyes - monitoring - dioxins - polychlorinated biphenyls - inland waters - contamination - netherlands
    In 2015 zijn in het kader van het monitoringsprogramma “Monitoring contaminanten ten behoeve van de Nederlandse sportvisserij” 15 zoetwaterlocaties en één zoutwater locatie in Nederland bemonsterd. Elf locaties liggen binnen het voor aalvisserij gesloten gebied, op de andere vijf locaties is de aalvisserij toegestaan. Van de gevangen rode alen zijn mengmonsters samengesteld voor de lengteklassen 30-40 cm en >45 cm en geanalyseerd op de aanwezigheid van dioxines, dioxineachtige-PCBs (dl-PCB’s) en niet-dioxineachtige PCB’s (ndl-PCB’s).
    Puberende paling wil niet volwassen worden
    Palstra, Arjan - \ 2016
    eels - eel culture - captive animals - fish culture - reproduction

    In gevangenschap planten palingen zich nog niet voort. Wageningen UR kan al wel opgekweekte paling in de puberteit brengen.

    Decentraal aalbeheer in Friesland : een economische analyse
    Prins, H. ; Zaalmink, W. - \ 2015
    LEI Wageningen UR (Report / LEI Wageningen UR 2015-157) - 81
    binnenvisserij - palingen - european eels - anguilla - visserij - visvangsten - quota - visserijbeheer - economische ontwikkeling - friesland - nederland - binnenwateren - freshwater fisheries - eels - european eels - anguilla - fisheries - fish catches - quotas - fishery management - economic development - friesland - netherlands - inland waters
    Within the framework of the eel recovery plan, restrictive measures have been in force in Dutch eel fisheries since 2009. Since 2011, Frisian inland fishers, associated through the Frisian association of inland fishers (Friese Bond van Binnenvissers), have been experimenting with fishing quotas for eel. This approach is also known as 'decentralised eel management' (decentraal aalbeheer). This quota is in lieu of the statutory eel fisheries system, which includes a three-month period in which no eel may be fished. This report will explore the economic development of Frisian inland fisheries since 2007, as well as the question whether fishing quotas are economically viable.
    Het effect van een verhoogde ammoniak concentratie in het water op fysiologie, groei en voeropname van Europese paling (Anguilla anguilla)
    Abbink, W. ; Blom, E. ; Pelgrim, Thamar ; Vries, P. de; Vis, J.W. van de; Schram, E. - \ 2015
    Yerseke : IMARES (Rapport / IMARES C187/15) - 18
    european eels - ammoniak - dierfysiologie - groei - voeropname - visteelt - aquacultuur - dierenwelzijn - dierlijke productie - kweekvis - palingen - huisvesting, dieren - diergezondheid - european eels - ammonia - animal physiology - growth - feed intake - fish culture - aquaculture - animal welfare - animal production - farmed fish - eels - animal housing - animal health
    Paling op straat
    Palstra, A.P. - \ 2015
    Visionair : het vakblad van sportvisserij Nederland 10 (2015)38. - ISSN 1569-7533 - p. 34 - 36.
    palingen - visconsumptie - japan - palingteelt - aquacultuur - eels - fish consumption - japan - eel culture - aquaculture
    Japanners eten graag paling. Het land kent zelfs speciale palingrestaurants. Het is daarom niet vreemd dat in Japan op grote schaal glasaal wordt opgekweekt.
    ICES palingkwaliteit Workshop in Brussel
    Haenen, O.L.M. ; Belpaire, C. - \ 2015
    Aquacultuur 30 (2015)2. - ISSN 1382-2764 - p. 25 - 26.
    workshops (programma - palingen - palingteelt - protocollen - kwaliteitscontroles - kwaliteitszorg - visbestand - workshops (programs) - eels - eel culture - protocols - quality controls - quality management - fishery resources
    Van 20 t/m 22 januari 2015 kwam een ICES ad hoc werkgroep van palingexperts bijeen in Brussel, bij het INBO (Instituut voor Natuur en Bosonderzoek). De afkorting ICES staat voor International Council for the Exploration of the Sea en is een wereldwijde organisatie, die op wetenschappelijke basis advies geeft aan overheden voor een duurzaam gebruik van de oceanen. Aan ICES werken meer dan 4000 wetenschappers vanuit meer dan 350 mariene instituten in 20 lidstaten en andere landen mee.
    Obese kweekvissen krijgen zwemtraining
    Voorde, M. ter; Palstra, A.P. - \ 2015
    De Volkskrant Magazine (2015). - p. 50 - 52.
    kweekvis - aquacultuurtechnieken - obesitas - lichaamsbeweging - experimenten - fitheid - aquacultuur - diergezondheid - palingen - dierenwelzijn - farmed fish - aquaculture techniques - obesity - exercise - experiments - fitness - aquaculture - animal health - eels - animal welfare
    Vis moet zwemmen, is het adagiumvan visfysioloog Arjan Palstra, maar kweekvissen doen dat te weinig. Dus dwingt hij ze in zijn lab in Yerseke. Ze knappen ervan op en –belangrijk voor de kwekers – ze groeien harder.
    Aanpassing rekenmodel "percentage aal onder de som-TEQ norm"
    Kotterman, M.J.J. ; Vries, P. de - \ 2015
    IJmuiden : IMARES (Rapport / IMARES Wageningen UR C104/15) - 27
    anguillidae - palingen - voedselveiligheid - normen - voedselkwaliteit - berekening - geslachtsverhouding - anguillidae - eels - food safety - standards - food quality - calculation - sex ratio
    Naast het bestaande rekenmodel voor de schatting van het deel van de aalvangst met gehalten som-TEQ onder de voedselveiligheidsnorm (“percentage aal onder de norm”) is nu een rekenmodel gemaakt zodat ook voor de som van niet-dioxine achtige PCBs (som-ndl-PCB) het percentage van de vangst onder de voedselveiligheidsnorm kan worden geschat. De gehalten som-TEQ en som-ndl-PCB in aal zijn aan elkaar gerelateerd, maar een eventuele overschrijding van de norm in aal kan van de som-TEQ, van de somndl-PCB óf van beide normen zijn. Dit kan per locatie verschillen. De norm voor som-ndl-PCBs wordt in de aal uit de onderzochte locaties het vaakst overschreden. Beide normen wegen wettelijk even zwaar; het laagste geschatte percentage aal onder de norm uit beide modellen wordt genomen als hét “percentage aal onder de norm”. Door het gebruik van de norm voor som-TEQ én som-ndl-PCBs wordt het geschatte percentage aal onder de norm in het gesloten gebied lager. Daarnaast zijn de beide modellen aangepast zodat de gemeten man-vrouw verhouding in het gebruikte mengmonster aal in de berekening wordt meegenomen.
    Evaluation of the Dutch Eel Management Plan 2015: status of the eel population in the periods 2005 - 2007, 2008 - 2010 and 2011 - 2013
    Wolfshaar, K.E. van de; Tien, N.S.H. ; Griffioen, A.B. ; Winter, H.V. ; Graaf, M. de - \ 2015
    IJmuiden : IMARES Wageningen UR (Report / IMARES Wageningen UR C078/15) - 104
    european eels - palingen - visserijbeheer - nederland - visbestand - overleving - visvangsten - ecologisch herstel - eu regelingen - anguillidae - european eels - eels - fishery management - netherlands - fishery resources - survival - fish catches - ecological restoration - eu regulations - anguillidae
    Evaluatie van het Nederlandse aalbeheerplan: maatregelen hebben in eerste instantie geleid tot een substantiële verbetering van de overleving tussen de perioden 2005-2007 en 2008-2010 gevolgd door een bescheiden verbetering in overleving tussen de perioden 2008-2010 en 2011-2013; positieve effecten op de aalpopulatie kunnen pas na vele jaren zichtbaar worden en blijven onzeker, omdat de aal pas na vele jaren terug zwemt naar zee om zich voort te planten en omdat niet goed bekend is welke de oorzaken zijn van de achteruitgang in de aalpopulatie.
    Report on the eel stock and fishery in the Netherlands 2013
    Graaf, M. de; Deerenberg, C.M. - \ 2015
    IJmuiden : IMARES (Report / IMARES Wageningen UR C003/15) - 55
    palingen - anguillidae - visserij - nederland - viskwekerijen - vissers - visvangsten - methodologie - visstand - eels - anguillidae - fisheries - netherlands - fish farms - fishermen - fish catches - methodology - fish stocks
    This report covers among others time-series data, fishing capacity, fishing effort, catches and landings concerning eels in the Netherlands. During the development of the current models for the evaluation of the eel management plan in the Netherlands, the main weaknesses of the current methodology surfaced quickly. The main recommendations to improve the quality of the assessment before the next evaluation in 2015 are listed.
    Schram, Edward - \ 2014
    fisheries - aquaculture - water quality - feed intake - pike perch - silurus glanis - eels - fishes - diversity - nitrate - ammonia
    Gezocht : chemische sporen van palingconsumptie
    Ramaker, R. ; Dungen, M.W. van den - \ 2014
    Resource: nieuwssite voor studenten en medewerkers van Wageningen UR 9 (2014)9. - ISSN 1389-7756 - p. 8 - 8.
    palingen - visconsumptie - voedselveiligheid - verontreinigd water - epigenetica - dioxinen - eels - fish consumption - food safety - polluted water - epigenetics - dioxins
    Onderzoeker wil honderd palingvissers voor onderzoek. Frequente palingeters geven mogelijk informatie over effect vervuiling.
    Wettelijke Onderzoek Taken WOT-05 Visserijonderzoek: Werksafspraken en werkplan 2015
    Verver, S.W. - \ 2014
    IJmuiden : Centrum voor Visserijonderzoek (CVO rapport 14.006)
    visserijbeleid - visserij - zeevisserij - kustwateren - aquacultuur - binnenwateren - visserijbeheer - visstand - bijvangst - statistiek - monitoring - onderzoek - duurzaamheid (sustainability) - recreatieactiviteiten - palingen - schaaldieren - fishery policy - fisheries - marine fisheries - coastal water - aquaculture - inland waters - fishery management - fish stocks - bycatch - statistics - monitoring - research - sustainability - recreational activities - eels - shellfish
    Dit rapport beschrijft het werkplan voor 2015 van cluster WOT-05 Visserijonderzoek van Wageningen UR. Wageningen UR voert voor het Ministerie van Economische Zaken (EZ) een aantal programma’s met Wettelijke Onderzoek Taken (WOT) uit. Binnen WOT-05 worden Wettelijke Onderzoek Taken uitgevoerd die betrekking hebben op het beheer van de visserij op zee, in Nederlandse kust- en binnenwateren en de aquacultuur. Het werkplan is een uitwerking van de Uitvoeringsovereenkomst tussen het Ministerie van EZ en de Stichting Dienst Landbouwkundig Onderzoek (DLO), onderdeel van Wageningen UR, voor diensten vanwege wettelijke taken op het terrein van visserijonderzoek voor de periode 2011-2015. Bij deze uitvoerings-overeenkomst zijn voor deze periode werkafspraken gemaakt welke de basis vormen voor de jaarlijkse werkplannen. Daarnaast zijn in deze overeenkomst afspraken gemaakt over de KennisBasis (KBWOT) die specifiek aan dit programma is gekoppeld.
    Glasaalonderzoek Den Oever als onderdeel van het project Glasaal over de dijk
    Foekema, E.M. ; Keeken, O.A. van; Rippen, A.D. - \ 2014
    Den Helder : IMARES (Rapport / IMARES Wageningen UR C110/14) - 17
    rioolwater - afvoerwater - palingen - aquatische ecologie - monitoring - kop van noord-holland - sewage - effluents - eels - aquatic ecology - monitoring - kop van noord-holland
    Uit onderzoek verricht in het voorjaar van 2013 blijkt, dat grote hoeveelheden glasaal zich concentreerden rond het lozingspunt van de rioolwaterzuivering in Den Oever. Het is mogelijk dat onder de geconcentreerde glasalen verhoogde sterfte plaatsvindt vanwege gerichte predatie. In een onderzoek van beperkte opzet werd in het voorjaar van 2014 onderzocht of de rwzi-uitlaat in Den Oever als knelpunt voor de glasaalintrek geldt. Het onderzoek werd uitgevoerd door monitoring van met kleurstof gemerkte glasalen, waarnemingen met een akoestische onderwatercamera (DIDSON) en maagonderzoek van lokaal aanwezige potentiele predator vissen.
    Check title to add to marked list
    << previous | next >>

    Show 20 50 100 records per page

    Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.