Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

    Current refinement(s):

    Records 1 - 20 / 84

    • help
    • print

      Print search results

    • export

      Export search results

    Check title to add to marked list
    Virulence contribution and recognition of homologs of the Verticillium dahliae effector Ave1
    Boshoven, Jordi C. - \ 2017
    Wageningen University. Promotor(en): B.P.H.J. Thomma; P.J.G.M. de Wit. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789463436441 - 183
    verticillium dahliae - plant pathogenic fungi - plant pathogens - disease resistance - virulence factors - virulence - immunity - host parasite relationships - plant-microbe interactions - symbiosis - mutagenesis - resistance breeding - verticillium dahliae - plantenziekteverwekkende schimmels - plantenziekteverwekkers - ziekteresistentie - virulente factoren - virulentie - immuniteit - gastheer parasiet relaties - plant-microbe interacties - symbiose - mutagenese - resistentieveredeling

    Disease resistance in crops is an important aspect of securing global food security. Resistant plants carry immune receptors that sense pathogen invasion often through the recognition of important pathogen virulence factors, known as effectors. Thus, identification and characterization of effectors is important for the fundamental understanding of virulence mechanisms and to aid in resistance breeding. In this thesis the VdAve1 effector of the soil-borne fungal pathogen Verticillium dahliae is studied that is recognized by tomato immune receptor Ve1. Homologs were found in other plant pathogens and the role in virulence in these pathogens was analyzed. Ave1 homologs are differentially recognized by Ve1 and with a combination of domain swaps and truncations a surface exposed patch was identified that contributes to the recognition by Ve1. Knowledge of specific effector-receptor combinations and knowledge of effectors in general can be exploited to aid in breeding for durable resistance in crops.

    Resistentieveredeling - Resistentieveredeling in de praktijk : Kennisclip Bogo-project e-learning
    Hop, M.E.C.M. - \ 2016
    Groen Kennisnet
    resistentieveredeling - overblijvende planten - boomkwekerijen - ziekteresistentie - selectiemethoden - vasteplantenkwekerijen - plantenveredeling - gewasbescherming - lesmaterialen - resistance breeding - perennials - forest nurseries - disease resistance - selection methods - perennial nurseries - plant breeding - plant protection - teaching materials
    Deze kennisclip maakt onderdeel uit van de lesmodule Resistentie Veredeling van het CIV T&U.
    Resistentieveredeling - Stressfactoren en verschillende typen belagers : Kennisclip Bogo-project e-learning.
    Hop, M.E.C.M. - \ 2016
    Groen Kennisnet
    resistance breeding - stress factors - plant breeding - selection methods - disease resistance - plant protection - teaching materials - detection - pathogens - resistentieveredeling - stressfactoren - plantenveredeling - selectiemethoden - ziekteresistentie - gewasbescherming - lesmaterialen - detectie - pathogenen
    Deze kennisclip maakt onderdeel uit van de lesmodule Resistentie Veredeling van het CIV T&U.
    Resistentieveredeling - Veredeling gericht op resistentie : Kennisclip Bogo-project e-learning
    Hop, M.E.C.M. ; Looman, B.H.M. - \ 2016
    Groen Kennisnet
    resistance breeding - plant breeding - selection - selection methods - breeding programmes - breeding methods - plant protection - genetic resistance - teaching materials - resistentieveredeling - plantenveredeling - selectie - selectiemethoden - veredelingsprogramma - veredelingsmethoden - gewasbescherming - genetisch bepaalde resistentie - lesmaterialen
    Deze kennisclip maakt onderdeel uit van de lesmodule Resistentie Veredeling van het CIV T&U.
    Resistentieveredeling - Overerving van resistentie : Kennisclip Bogo-project e-learning
    Hop, M.E.C.M. - \ 2016
    Groen Kennisnet
    resistance breeding - disease resistance - genetic resistance - partial resistance - plant genetics - plant protection - teaching materials - resistentieveredeling - ziekteresistentie - genetisch bepaalde resistentie - partiële resistentie - plantengenetica - gewasbescherming - lesmaterialen
    Deze kennisclip maakt onderdeel uit van de lesmodule Resistentie Veredeling van het CIV T&U.
    Resistentieveredeling - Verdedigingsmechanisme : Kennisclip Bogo-project e-learning
    Hop, M.E.C.M. - \ 2016
    Groen Kennisnet
    resistance breeding - susceptibility - resistance - tolerance - host pathogen interactions - plant protection - teaching materials - disease resistance - resistentieveredeling - vatbaarheid - weerstand - tolerantie - gastheer-pathogeen interacties - gewasbescherming - lesmaterialen - ziekteresistentie
    Deze kennisclip maakt onderdeel uit van de lesmodule Resistentie Veredeling van het CIV T&U.
    Role of MLO genes in susceptibility to powdery mildew in apple and grapevine
    Pessina, Stefano - \ 2016
    Wageningen University. Promotor(en): Richard Visser, co-promotor(en): Henk Schouten; M. Malnoy; Yuling Bai. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789462576209 - 222
    malus domestica - apples - vitis vinifera - grapes - plant pathogenic fungi - podosphaera leucotricha - erysiphe necator - disease resistance - susceptibility - genes - gene expression - gene knock-out - resistance breeding - malus domestica - appels - vitis vinifera - druiven - plantenziekteverwekkende schimmels - podosphaera leucotricha - erysiphe necator - ziekteresistentie - vatbaarheid - genen - genexpressie - inactivering van genen - resistentieveredeling

    Powdery mildew (PM) is a major fungal disease that threatens thousands of plant species. PM is caused by Podosphaera leucotricha in apple and Erysiphe necator in grapevine. Powdery mildew is controlled by frequent applications of fungicides, having negative effects on the environment, and leading to additional costs for growers. To reduce the amount of chemicals required to control this pathogen, the development of resistant apple and grapevine varieties should become a priority.

    PM pathogenesis is associated with up-regulation of specific MLO genes during early stages of infection, causing down-regulation of plant defense pathways. These up-regulated genes are responsible for PM susceptibility (S-genes) and their knock-out causes durable and broad-spectrum resistance. All MLO S-genes of dicots belong to the phylogenetic clade V. In grapevine, four genes belong to clade V. VvMLO7, 11 and 13 are up-regulated during PM infection, while VvMLO6 is not.

    Chapter 2 reports the genome-wide characterization and sequence analysis of the MLO gene family in apple, peach and woodland strawberry, and the isolation of apricot MLO homologs. Twenty-one homologues were found in apple, 19 in peach and 17 in woodland strawberry. Evolutionary relationships between MLO homologs were studied and syntenic blocks constructed. Candidate genes for causing PM susceptibility were inferred by phylogenetic relationships with functionally characterized MLO genes and, in apple, by monitoring their expression following inoculation with the PM causal pathogen P. leucotricha. In apple, clade V genes MdMLO11 and 19 were up-regulated, whereas the two other members of clade V, MdMLO5 and 7, were not up-regulated. The clade VII gene MdMLO18 was also up-regulated upon P. leucotricha infection.

    Chapter 3 reports the knock-down, through RNA interference, of MdMLO11 and 19, as well as complementation of the mutant phenotype by expression of the MdMLO18 gene in the Arabidopsis thaliana triple mlo mutant Atmlo2/6/12. The knock-down of MdMLO19 resulted in a reduction of PM disease severity up to 75%, whereas the knock-down of MdMLO11, alone or combined with MdMLO19, did not cause any reduction or additional reduction of susceptibility compared to MdMLO19 alone. Complementation by MdMLO18 did not restore susceptibility. Cell wall appositions (papillae), a response to PM infection, were found in both susceptible plants and PM resistant plants where MdMLO19 was knocked-down, but were larger in resistant lines. The expression analysis of 17 genes related to plant defense, and quantification of phenolic metabolites in resistant lines revealed line-specific changes compared to the control.

    Chapter 4 evaluates the presence of non-functional alleles of the MdMLO19 S-gene in apple germplasm. The screening of the re-sequencing data of 63 apple genotypes led to the identification of 627 SNP in five MLO genes (MdMLO5, MdMLO7, MdMLO11, MdMLO18 and MdMLO19). Insertion T-1201 in MdMLO19 caused the formation of an early stop codon, resulting in a truncated protein lacking 185 amino-acids and the calmodulin-binding domain. The presence of the insertion was evaluated in a collection of 159 apple genotypes: it was homozygous in 53 genotypes, 45 of which were resistant or very resistant to PM, four partially susceptible and four not assessed. These results strongly suggest that this insertion is causative for the observed PM resistance. The absence of a clear fitness cost associated to the loss-of-function of MdMLO19, might have contributed to the high frequency of the mutation in breeding germplasm and cultivars. Among the genotypes containing the homozygous insertion, ‘McIntosh’ and ‘Fuji’ are commonly used in apple breeding. After barley and tomato, apple is the third species with a reported natural non-functional mlo allele in its germplasm, with the important difference that the allele is present in a relatively large number of apple genotypes, most of which not related to each other.

    Chapter 5 reports the knock-down through RNA interference of four grapevine MLO genes, all members of clade V. VvMLO7, 11 and 13 are up-regulated in early stages of infection, whereas VvMLO6 is not responsive to the pathogen. Knock-down of VvMLO6, 11 and 13, alone or combined, did not decrease PM severity, whereas the knock-down of VvMLO7, alone or in combination with VvMLO6 and VvMLO11, caused a reduction of severity of 77%. Cell wall appositions (papillae), a response to PM attack, were present in both resistant and susceptible lines, but were larger in resistant lines. Thirteen genes involved in defense were less up-regulated in resistant plants, highlighting the reduction of PM disease severity.

    In Chapter 6 we discuss the results presented in this thesis. The pivotal role of MLO genes in the interaction of PM pathogens with apple and grapevine is described and further experiments aimed at addressing open questions are proposed. The results described in this thesis open interesting avenues in MLO genes research, particularly the finding that a natural mlo mutation in apple appeared to be more common than expected. This mutation is directly applicable in marker assisted breeding for durable PM resistance in apple.

    Groene Veredeling : nieuwe rassen voor verduurzaming van gangbare en biologische teelt : projectenoverzicht 2015 - 2019
    Scholten, O.E. ; Lammerts Van Bueren, E. - \ 2015
    - 2
    plantenveredeling - biologische plantenveredeling - biologische landbouw - resistentieveredeling - rassen (planten) - akkerbouw - tuinbouw - plant breeding - organic plant breeding - organic farming - resistance breeding - varieties - arable farming - horticulture

    Biologische telers hebben grote behoefte aan meer robuuste rassen. Dat kunnen rassen zijn met een brede weerstand tegen ziekten en plagen, rassen die met minder bemesting toch voldoende opbrengst geven, en rassen die zijn aangepast aan veranderende klimaatomstandigheden. De ontwikkeling van dergelijke robuuste rassen is voor de hele agrarische sector van belang. Robuuste rassen dragen namelijk bij aan verdere verduurzaming van zowel gangbare als biologische teelt. In het onderzoeksprogramma Groene Veredeling dragen Wageningen UR, het Louis Bolk Instituut en andere kennisinstellingen sinds 2010 bij aan de ontwikkeling van deze robuuste rassen. Drie gewassen staan centraal: aardappel, prei, en spinazie. Daarnaast is ook onderzoek gedaan in tomaat, lupine, kool, tarwe, ui en paprika. Eind 2014 is de eerste fase van het programma afgerond, en is een nieuwe ronde van projecten van start gegaan voor 2015-2019. Het onderzoek in aardappel (phytophthoraresistentie) en prei (tripsresistentie) loopt door, en nieuwe projecten in spinazie, appel en paprika zijn opgestart. Deze folder biedt een overzicht van de belangrijkste onderzoekslijnen.
    Resistente aardappel hoopt op genade
    Hoog, A. van 't; Haverkort, A.J. - \ 2015
    WageningenWorld (2015)4. - ISSN 2210-7908 - p. 10 - 15.
    akkerbouw - aardappelen - resistentieveredeling - rassen (planten) - schimmelbestrijding - phytophthora infestans - gewasbescherming - arable farming - potatoes - resistance breeding - varieties - fungus control - phytophthora infestans - plant protection
    Met Wageningse gentechnologie zijn aardappels te ontwikkelen die amper bestrijdingsmiddelen nodig hebben tegen de aardappelziekte Phytophthora. Toepassing zou binnen vijf jaar resistente aardappelrassen kunnen opleveren, maar genetische modificatie ligt gevoelig en iedereen wacht met smart op bericht uit Brussel. ‘We hebben nog vier maanden voordat het pootgoed begint te verrotten.’
    Weerbare bij : Verkenning van initiatieven en wetenschappelijke literatuur over natuurlijke afweer van bijenvolken tegen ziekten en plagen
    Blacquière, T. - \ 2015
    Wageningen : Wageningen UR Plant Research International - 67
    apis - bijenhouderij - natuurlijke immuniteit - diergezondheid - insectenpathogenen - resistentieveredeling - aanpassingsvermogen - apis - beekeeping - natural immunity - animal health - entomopathogens - resistance breeding - adaptability
    Grofweg lijken er twee stromingen te bestaan om de weerbaarheid van de bijenvolken te vergroten. De ene stroming selecteert op specifieke eigenschappen (vooral resistentie gericht). De andere stroming selecteert op verbeterde/natuurlijke aanpassing(en) aan de lokale ziekte/plaagdruk of zelfs de algemene lokale omstandigheden (zowel resistentie als tolerantie gericht). Sommige initiatieven passen heel duidelijk in een van deze stromingen, anderen hangen er meer tussen in. Als uitvloeisel van deze studie wordt eind 2015 een internationale workshop georganiseerd waar een doorsnede van deze initiatieven wordt uitgenodigd om gezamenlijk de state of the art vast te stellen en internationale afstemming te zoeken.
    The Sw-5 gene cluster : analysis of tomato resistance against tospoviruses
    Silva de Oliveira, A. - \ 2015
    Wageningen University. Promotor(en): Monique van Oers; R. de Oliveira Resende, co-promotor(en): Richard Kormelink. - Wageningen : Wageningen University - ISBN 9789462575769 - 158
    solanum lycopersicum - tomaten - ziekteresistentie - plantenvirussen - tospovirus - genen - tomatenbronsvlekkenvirus - plantenveredeling - resistentieveredeling - solanum lycopersicum - tomatoes - disease resistance - plant viruses - tospovirus - genes - tomato spotted wilt virus - plant breeding - resistance breeding
    Opportunities of New Plant Breeding Techniques
    Schaart, Jan ; Riemens, M.M. ; Wiel, C.C.M. van de; Lotz, L.A.P. ; Smulders, M.J.M. - \ 2015
    Wageningen : Wageningen UR - 24
    plantenveredeling - plantenveredelingsmethoden - resistentieveredeling - cisgenese - intragenic recombination - mutagenese - dna-methylering - bloei - plant breeding - plant breeding methods - resistance breeding - cisgenesis - intragenic recombination - mutagenesis - dna methylation - flowering
    This brochure gives an overview of new plant breeding techniques. This overview is based on a more technical review of the scientific literature, published in a separate report. The overview presents the opportunities and limitations of these techniques from the point of view of potential applications in plant breeding with promising results for improving agricultural sustainability.
    Praktijk past onderzoeksresultaten Green challenge meeldauw gretig toe : onderzoek meeldauwbeheersing wegens succes verbreed
    Staalduinen, J. van; Hofland-Zijlstra, J.D. - \ 2015
    Onder Glas 12 (2015)4. - p. 36 - 37.
    glastuinbouw - meeldauw - plantenziekten - ziektebestrijdende teeltmaatregelen - infectie - controle - systemische werking - vermeerderingsmateriaal - potplanten - resistentieveredeling - landbouwkundig onderzoek - greenhouse horticulture - mildews - plant diseases - cultural control - infection - control - systemic action - propagation materials - pot plants - resistance breeding - agricultural research
    Onder de noemer Green Challenge Meeldauw startte vorig jaar een door het Productschap Tuinbouw en bedrijfsleven gefinancierd en door LTO Glaskracht Nederland begeleid masterplan, dat meer inzicht en oplossingen moet bieden bij het voorkomen en bestrijden van echte meeldauw. De aanvankelijke focus op siergewassen is inmiddels verbreed met vruchtgroenten. Onderzoekster Jantineke Hofland-Zijlstra van Wageningen UR Glastuinbouw doet verslag van de voorlopige resultaten.
    Resistente biologische aardappelrassen in de etalage
    Sikkema, A. ; Lammerts Van Bueren, E. - \ 2015
    Resource: nieuwssite voor studenten en medewerkers van Wageningen UR 9 (2015)14. - ISSN 1389-7756 - p. 10 - 10.
    aardappelen - rassen (planten) - biologische landbouw - akkerbouw - phytophthora - resistentieveredeling - resistentie van variëteiten - plaagresistentie - biologische plantenveredeling - gewasbescherming - potatoes - varieties - organic farming - arable farming - phytophthora - resistance breeding - varietal resistance - pest resistance - organic plant breeding - plant protection
    Er zijn zes nieuwe biologische aardappelrassen gepresenteerd die resistent zijn tegen phytophthora.
    Aanwezigheid van een gen is nog lang geen garantie : Moleculaire en genetische kennis maakt sprongen
    Angenent, G.C. ; Kierkels, T. ; Heuvelink, E. - \ 2014
    Onder Glas 11 (2014)9. - p. 18 - 19.
    glastuinbouw - plantenveredeling - genetica - rassen (planten) - resistentieveredeling - dna - transcriptiefactoren - genexpressie - eiwitten - greenhouse horticulture - plant breeding - genetics - varieties - resistance breeding - dna - transcription factors - gene expression - proteins
    Plantenveredeling staat tegenwoordig heel ver van de teler af. De reden is dat de moleculaire en genetische kennis enorme sprongen heeft gemaakt. Er is bovendien een hele geheimtaal ontstaan, waardoor de veredelaar vooral goed kan praten met vakgenoten en veel minder met de teler. Hier een aantal recente inzichten op een rij.
    Ieperdepiep, hoera!
    Hiemstra, J.A. - \ 2013
    Bomen, het vakblad voor de boomverzorging (2013)22. - p. 4 - 11.
    ulmus - rassen (planten) - plantenziekten - resistentieveredeling - resistentie van variëteiten - nieuwe soorten - heraanplanten - ornamentele waarde - landbouwkundig onderzoek - nederland - ulmus - varieties - plant diseases - resistance breeding - varietal resistance - new species - replanting - ornamental value - agricultural research - netherlands
    De iep, en dan met name de ‘Belgica’, was aan het begin van de 20ste eeuw in grote delen van Nederland de beeldbepalende boom. De opkomst van de iepziekte leidde tot het verdwijnen van zeer veel van deze Hollandse iepen. Door de voortdurende problemen met de iepziekte kreeg de iep in de tweede helft van de 20ste eeuw bovendien een slechte naam en nam het relatieve belang van deze boom sterk af. De iep is echter een ideale boom, zowel in de moderne stad als in het buitengebied, en kan slecht gemist worden. Onderzoek laat zien dat de iep nu echter weer volop toekomst heeft. De nieuwe iepen die inmiddels op de markt zijn hebben een zeer hoge mate van resistentie en zijn algemeen bruikbaar, ook in de huidige situatie met de nog alom aanwezige iepziekte.
    Duuzame landbouw: met of zonder gentech?
    Lotz, L.A.P. ; Bekkem, H. van - \ 2013
    GMP / Greenpeace 12 (2013). - ISSN 2213-4964 - p. 10 - 11.
    genetische modificatie - landbouw - resistentieveredeling - innovaties - interviews - duurzame landbouw - plantenveredelingsmethoden - landbouwkundig onderzoek - universitair onderzoek - particuliere organisaties - kennisoverdracht - genetic engineering - agriculture - resistance breeding - innovations - sustainable agriculture - plant breeding methods - agricultural research - university research - private organizations - knowledge transfer
    Genetische modificatie blijft onderwerp van debat. Greenpeacecampagneleider Herman van Bekkem en onderzoeker Bert Lotz van Wageningen UR beantwoorden elkaars vragen over gentech.
    Green breeding : bioimpuls programme 2009-2013: perspectives on Phytophthora-resistant potato varieties
    Scholten, O.E. ; Lammerts Van Bueren, E. - \ 2013
    Wageningen UR etc.
    biologische plantenveredeling - plantenveredeling - resistentieveredeling - aardappelen - phytophthora infestans - genetisch bepaalde resistentie - onderzoeksprojecten - biologische landbouw - akkerbouw - organic plant breeding - plant breeding - resistance breeding - potatoes - phytophthora infestans - genetic resistance - research projects - organic farming - arable farming
    The heavy outbreaks of Phytophthora in 2007, and again in 2012, reconfirmed the need for resistant potato varieties for the organic sector. Until recently no such varieties were available. In 2009 the Bioimpulsprogramme was launched to give more priority to breeding organic, Phytophthora-resistant varieties. In this 10-year programme, wild potato species are crossed with cultivated potato to develop new resistant varieties. Although this classical breeding strategy is a long road, the advantage is that you can select for multiple traits along the way. This brochure presents the results of the first four years of the programme.
    Groene Veredeling ; Veredelingsonderzoek tripsresistentie in prei
    Scholten, O.E. ; Henken, B. ; Burger, K. ; Vosman, B. - \ 2013
    resistentieveredeling - thrips - plaagresistentie - preien - vollegrondsgroenten - plantenveredeling - biologische plantenveredeling - genetisch bepaalde resistentie - resistance breeding - thrips - pest resistance - leeks - field vegetables - plant breeding - organic plant breeding - genetic resistance
    Brochure met onderzoeksinformatie. Het Groene Veredelings-onderzoek naar tripsresistentie in prei levert een bijdrage aan de ontwikkeling van prei met een hoger niveau van tripsresistentie; voor zowel de biologische als de gangbare sector.
    Verticillium : Status quo van een miljoenenverslindende bodemziekte : Kansen en oplossingen bij bestrijding en beheer van verwelkingsziekte
    Hiemstra, J.A. ; Sluis, B.J. van der - \ 2013
    Boom in business 4 (2013)6. - ISSN 2211-9884 - p. 20 - 23.
    boomkwekerijen - houtachtige planten - sierplanten - verwelkingsziekten - verticillium - schimmelziekten - landbouwkundig onderzoek - resistentieveredeling - bestrijdingsmethoden - bodemschimmels - forest nurseries - woody plants - ornamental plants - wilts - verticillium - fungal diseases - agricultural research - resistance breeding - control methods - soil fungi
    Verwelkingsziekte bedreigt al jaren de boomkwekerij, m.n. in de teelt van laanbomen en rozen. Onderzoek naar deze bodemziekte is daarom hard nodig. Jelle Hiemstra en Bart van der Sluis geven in dit artikel een overview van de stand van zaken met betrekking tot onderzoek naar dit probleem.
    Check title to add to marked list
    << previous | next >>

    Show 20 50 100 records per page

    Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.