Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

    Current refinement(s):

    Records 1 - 11 / 11

    • help
    • print

      Print search results

    • export

      Export search results

    Check title to add to marked list
    The role of Mallard (Anas platyrhynchos) in the spread of avian influenza: genomics, population genetics, and flyways
    Kraus, R.H.S. - \ 2011
    Wageningen University. Promotor(en): Herbert Prins; Ron Ydenberg, co-promotor(en): Pim van Hooft. - [S.l.] : S.n. - ISBN 9789461730282 - 143
    aviaire influenzavirussen - aviaire influenza - anas platyrhynchos - ziekteoverdracht - vogeltrek - genomica - populatiegenetica - evolutionaire genetica - zoögeografie - bioveiligheid - ziekteoverzichten - epidemiologie - avian influenza viruses - avian influenza - anas platyrhynchos - disease transmission - bird migration - genomics - population genetics - evolutionary genetics - zoogeography - biosafety - disease surveys - epidemiology

    Birds, in particular poultry and ducks, are a source of many infectious diseases, such as those caused by influenza viruses. These viruses are a threat not only to the birds themselves but also to poultry farming and human health, as forms that can infect humans are known to have evolved. It is believed that migratory birds in general play an important role in the global spread of avian influenza (AI). However, it is still debated how large this role precisely is and whether other modes of spread may be more important. The mallard (Anas platyrhynchos) is the world’s most abundant and well-studied waterfowl species. Besides being an important game and agricultural species, it is also a flagship species in wetland conservation and restoration. Waterfowl (Anseriformes: Anatidae) and especially ducks currently are the focal bird group in long distance dispersal of Avian Influenza in the wild, and the mallard has been identified as the most likely species to transport this virus.

    In my thesis I report aspects of the biology of this important host species of AI by molecular ecological means. As molecular marker system I established a genome-wide set of more than 100,000 SNPs of which I developed a subset of 384 SNPs into an assay to genotype about 1,000 ducks. This subset was employed to study the evolutionary history and speciation processes in the Anas genus. Further investigations into the world-wide mallard population structure on a species level were based not only on this set of 384 SNPs but also on mitochondrial DNA sequences. Last but not last, I investigated an option of AI sampling and detection from duck faeces by technology that is safe from a biohazard perspective, and solves transportation issues related to cold chains.

    The main results of my thesis include the development of a generally applicable improved analysis pipeline to develop genome-wide SNP sets for non-model organisms. Further, my results show that, from a migration system perspective, mallard flyways/populations can hardly be delineated from a biological point of view. Detailed phylogenetic, population genetic and coalescent analyses of a data set of samples spanning the whole northern hemisphere leads me to conclude that the only firm population boundaries that I can draw are between Eurasia and North America, within which panmixia is almost achieved. Mallards’ and other Anas-ducks’ whole continental to global distribution brings them together in sympatry. I can show that a combination of sympatric distribution, conflicting genetically determined and learned mate recognition mechanisms, and genomic compatibility between species helps to explain the long-standing puzzle of waterfowl hybridisation and introgression of genes from one duck species into another. Besides obvious management implications I propose that this fact can be part of the explanation why ducks are so well adaptable and successful, as well as why they show extraordinary abilities to withstand AI infections, or its consequences for health status.

    Avian influenza and migratory birds : a spatial - ecological perspective
    Si, Y. - \ 2011
    University of Twente. Promotor(en): Andrew Skidmore; Herbert Prins; T. Wang. - Enschede : University of Twente Faculty of Geo-Information and Earth Observation ITC - ISBN 9789061643081 - 129
    aviaire influenzavirussen - watervogels - vogeltrek - ruimtelijke ecologie - virologie - epidemiologie - milieufactoren - avian influenza viruses - waterfowl - bird migration - spatial ecology - virology - epidemiology - environmental factors
    Factoren die van invloed zijn op de ontwikkeling van weidevogelpopulaties : belangrijke factoren tijdens de trek, de invloed van waterpeil op voedselbeschikbaarheid en graslandcultuur op kuikenoverleving
    Teunissen, W. ; Wymenga, E. ; Hooijmeijer, J. ; Bruinzeel, L. ; Kamp, J. van der; Piersma, Th. - \ 2011
    Wageningen : Alterra (Alterra rapport 2187) - 101 p.
    weidevogels - limosa limosa - onvolwassenheid - voedingsgedrag - bodemecologie - bodemwater - graslanden - vogeltrek - agrarisch natuurbeheer - grassland birds - limosa limosa - juvenility - feeding behaviour - soil ecology - soil water - grasslands - bird migration - agri-environment schemes
    De Kenniskring Weidevogellandschap heeft SOVON, Bureau Altenburg & Wymenga en Alterra gevraagd onderzoek te doen naar sturende factoren die de populatie van weidevogels kan beïnvloeden. Toegespitst op de aspecten: Trek van de Grutto naar Afrika (via satellietzenders, i.s.m. RU Groningen); Waterpeil (in relatie tot foerageren van Grutto's); en de vegetatiestructuur. Conclusies zijn o.a. dat de trekroutes veilig gesteld dienen te worden; in Nederland zal het waterbeheer dusdanig moeten zijn, dat het vochtgehalte van de bodem niet onder de 30% zal dalen, zodat de voedselbeschikbaarheid optimaal is.
    African winter population trends of European waterbirds : the identification of critical sites and the effectiveness of Ramsar and IBA site designation for the conservation of migratory waterbirds
    Kleijn, D. ; Nagy, S. ; Delany, S. ; Nasirwa, O. ; Dodman, T. ; Goedhart, P.W. - \ 2011
    Wageningen : Alterra (Alterra-report 2148) - 30
    watervogels - winter - vogeltrek - wildbescherming - populatiedynamica - afrika - europa - vogels - monitoring - waterfowl - winter - bird migration - wildlife conservation - population dynamics - africa - europe - birds - monitoring
    IBA = important bird area
    Black-tailed Godwits in West African winter staging areas : habitat use and hunting-related mortality
    Kleijn, D. ; Kamp, J. van der; Monteiro, H. ; Ndiaye, I. ; Wymenga, E. ; Zwarts, L. - \ 2010
    Wageningen : Alterra (Alterra-report 2058) - 32
    vogels - limosa limosa - overwintering - natte rijst - wildbescherming - habitats - bevolkingsafname - jagen - west-afrika - guinee-bissau - gambia - senegal - nederland - weidevogels - vogeltrek - birds - limosa limosa - overwintering - flooded rice - wildlife conservation - habitats - population decrease - hunting - west africa - guinea-bissau - gambia - senegal - netherlands - grassland birds - bird migration
    The persistence of the Dutch Black-tailed Godwit population depends largely on high adult survival. Adult survival may be influenced by hunting pressure and land use change in the wintering area, the West African coastal zone. Here we examine hunting pressure on and habitat use of Black-tailed Godwits in West African rice-growing areas. The Black-tailed Godwit is exposed to hunting throughout the core wintering area in West Africa but hunting related mortality does not seem to be the main driver of the ongoing population decline. Habitat use of godwits seems to be governed by the availability of their preferred habitat: (man-made) bare wet soil which is consecutively available in different parts of West Africa throughout the entire wintering period.
    An Atlas of Wader Populations in Africa and Western Eurasia
    Delany, S. ; Scott, D. ; Helmink, A.T.F. ; Dodman, T. ; Flink, S. ; Stroud, D. ; Haanstra, L. - \ 2009
    London : Wetlands International - ISBN 9789058820471 - 524
    populatie-ecologie - conservering - zoögeografie - afrika - europa - waadvogels - vogeltrek - population ecology - conservation - zoogeography - africa - europe - waders - bird migration
    This publication is a compilation of current knowledge of the numbers, distribution and movements of one of the most remarkable groups of birds in the region covered by the African-Eurasian Migratory Waterbird Agreement (AEWA). Long-term waterbird count data have been combined with an extensive literature review, especially published results of bird ringing and national bird atlases, to produce maps showing the population boundaries that are used as a basis of the conservation of these species. The maps are supported by informative species accounts that highlight the movements, population status and conservation of waders in the AEWA region.
    De betekenis van lichtverontreiniging voor vogels in kustgebieden en de Noordzee
    Smit, C.J. ; Baptist, M.J. ; Mesel, I.G. de; Ysebaert, T. - \ 2009
    Texel : IMARES (Rapport / IMARES Wageningen UR C122/09) - 30
    vogels - mariene gebieden - kunstlicht - nadelige gevolgen - verontreiniging - offshore - waddenzee - vogeltrek - birds - marine areas - artificial light - adverse effects - pollution - offshore - wadden sea - bird migration
    Elk jaar maken 10-12 miljoen vogels gebruik van de internationale Waddenzee, als pleisterplaats op hun jaarlijkse heen- en terugreis tussen de broedgebieden en de overwinteringsgebied. Deze vogels gebruiken de Waddenzee voor een korte stop, als opvetgebied om langduriger bij te tanken voor een langere etappe, als ruigebied en als overwinteringsgebied. De Waddenzee vormt daarmee een essentiële halte voor het voortbestaan voor deze vogels. Een deel van de in de Waddenzee pleisterende vogels bereikt dit gebied via een route over de Noordzee. Lichtverontreiniging alhier, als gevolg van verlichting door boorplatforms, zou een negatief effect kunnen hebben op de oriëntatiemogelijkheden van vogels die ’s nachts over de Noordzee trekken. Ook zou verlichting in het Waddengebied zelf van invloed kunnen zijn op de leefwijze van wadvogels en op de mogelijkheden om voedsel te zoeken. Kennis over de mogelijke effecten van lichtverontreiniging is daarom van belang voor de beheer van de trekkende vogelpopulaties in dit gebied.
    Samen op reis op de rug van... : Educatiemodule Ganzentrek voor VMBO Groen
    Mulder, S. ; Vliet, A.J.H. van; Bron, W.A. - \ 2008
    Wageningen : Wageningen Universiteit, Leerstoelgroep Milieusysteemanalyse - 27
    lesmaterialen - agrarisch onderwijs - voortgezet onderwijs - ganzen - vogeltrek - teaching materials - agricultural education - secondary education - geese - bird migration
    In de educatiemodule “Samen op reis door de natuur op de rug van….” staat de kolganzentrek van Nederland naar Siberië centraal. Aan de hand hiervan moeten leerlingen vragen beantwoorden en opdrachten maken over onder andere de ecologie van de ganzen en de topografie van hun trekroute. Het doel van deze module is om leerlingen aan de hand van ganzentrek kennis te laten maken met het gebruik van geo-informatie, de jaarlijkse trek van beesten door de natuur, het effect van klimaatverandering op de natuur en de betekenis van natuur in hun eigen omgeving
    The arctic pulse : timing of breeding in long-distance migrant shorebrids [i.e.] shorebirds
    Tulp, I.Y.M. - \ 2007
    University of Groningen. Promotor(en): T. Piersma, co-promotor(en): G.H. Visser. - [S.l.] : S.n. - ISBN 9789090222288 - 259
    vogels - diergedrag - migratie - veredelen - broedplaatsen - nesten - dierecologie - oevers - vogeltrek - birds - animal behaviour - migration - breeding - breeding places - nests - animal ecology - shores - bird migration
    Veel steltlopers zijn lange-afstandtrekkers: ze brengen de winter door in gematigde of tropische streken en trekken in het voorjaar noordwaarts om te broeden in de Arctis. Hier is de zomer kort en wordt gekenmerkt door een koud en grillig klimaat. Bovendien vertoont het voedselaanbod, dat voor zowel ouders als kuikens uit insecten bestaat, een gepiekt verloop en een sterke weersvariatie. De timing van broeden kan daarom van grote invloed zijn op het broedsucces. Om te onderzoeken welke factoren deze timing beïnvloeden hebben we het seizoenspatroon in het aanbod van insecten gemeten en dit vergeleken met de energetische behoeften en prestaties van ouders en kuikens door het seizoen. We zagen dat de groeisnelheid van kuikens afhankelijk is van het weer, maar ook van het voedselaanbod, en dat vroeg geboren kuikens beter groeien dan latere kuikens. In de drie jaren van het onderzoek werden de kuikens relatief laat geboren ten opzichte van de voedselpiek en vanuit de kuikens bekeken begonnen de ouders dus te laat met broeden. Die moeten echter niet alleen rekening houden met het belang van de kuikens. Ze arriveren op de toendra na een lange trekvlucht met een beperkte hoeveelheid lichaamsreserves, hooguit voldoende om een paar dagen te overleven mocht de toendra nog met sneeuw bedekt zijn. Te vroeg aankomen brengt daarom risico¿s mee, en de vogels hebben ook tijd nodig om nieuwe reserves op te doen voor de aanmaak van eieren. Daarnaast moeten ze tijdens het broeden, dat energie maar vooral veel tijd vergt, ook zelf genoeg voedsel kunnen vinden. Dat geldt het sterkst voor soorten die de eieren zonder hulp van een partner uitbroeden, die een afweging moeten maken tussen foerageren en het bebroeden van de eieren. De incubatieperiode is voor hen daardoor energetisch gezien stressvoller dan de kuikenperiode, terwijl dat voor samen broedende soorten niet zo is. In overeenstemming hiermee komen alleen broedende soorten later aan op de toendra en beginnen ze later met leggen. Onder invloed van recente klimaatveranderingen lijkt de voedselpiek naar voren te verschuiven, en daarmee ook het beste moment om eieren te leggen.
    Pristine wilderness of the Taimyr peninsula; 2005 report
    Ebbinge, B.S. ; Mazurov, Y.L. - \ 2006
    Moscow (Russia) : Heritage Institute - ISBN 9785864431382 - 180
    wildernis - vogels - ganzen - laridae - zoogdieren - landschap - vegetatie - fauna - watervogels - ecotoerisme - lemmingen - siberië - vogeltrek - expedities - wilderness - birds - geese - laridae - mammals - landscape - vegetation - fauna - waterfowl - ecotourism - lemmings - siberia - bird migration - expeditions
    Treedt er stuwing op tijdens nachtelijke seizoenstrek van vogels over de Afsluitdijk? Veldonderzoek naar hoogteverdelingen en horizontale gradiënten
    Poot, M.J.M. ; Winden, J. van der; Schekkerman, H. ; Lieshout, S.M.J. van; Dirksen, S. - \ 2002
    Culemborg : Bureau Waardenburg (Rapport 02-005) - 75 p.
    ecologie - fauna - ornithologie - vogeltrek - Afsluitdijk - IJsselmeer - fauna
    Check title to add to marked list

    Show 20 50 100 records per page

     
    Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.