Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

    Records 1 - 20 / 37

    • help
    • print

      Print search results

    • export

      Export search results

    Check title to add to marked list
    The damage-associated molecular pattern HMGB1 is released early after clinical hepatic ischemia/reperfusion
    Golen, Rowan F. van; Reiniers, Megan J. ; Marsman, Gerben ; Alles, Lindy K. ; Rooyen, Derrick M. van; Petri, Björn ; Mark, Vincent A. Van der; Beek, Adriaan A. van; Meijer, Ben ; Maas, Martinus A. ; Zeerleder, Sacha ; Verheij, Joanne ; Farrell, Geoffrey C. ; Luken, Brenda M. ; Teoh, Narci C. ; Gulik, Thomas M. van; Murphy, Michael P. ; Heger, Michal - \ 2019
    Biochimica et Biophysica Acta. Molecular Basis of Disease 1865 (2019)6. - ISSN 0925-4439 - p. 1192 - 1200.
    Antioxidants - Damage-associated molecular patterns - Intravital microscopy - Liver resection - Mitochondrial DNA - Sterile inflammation

    Objective and background: Activation of sterile inflammation after hepatic ischemia/reperfusion (I/R) culminates in liver injury. The route to liver damage starts with mitochondrial oxidative stress and cell death during early reperfusion. The link between mitochondrial oxidative stress, damage-associate molecular pattern (DAMP) release, and sterile immune signaling is incompletely understood and lacks clinical validation. The aim of the study was to validate this relation in a clinical liver I/R cohort and to limit DAMP release using a mitochondria-targeted antioxidant in I/R-subjected mice. Methods: Plasma levels of the DAMPs high-mobility group box 1 (HMGB1), mitochondrial DNA, and nucleosomes were measured in 39 patients enrolled in an observational study who underwent a major liver resection with (N = 29) or without (N = 13) intraoperative liver ischemia. Circulating cytokine and neutrophil activation markers were also determined. In mice, the mitochondria-targeted antioxidant MitoQ was intravenously infused in an attempt to limit DAMP release, reduce sterile inflammation, and suppress I/R injury. Results: In patients, HMGB1 was elevated following liver resection with I/R compared to liver resection without I/R. HMGB1 levels correlated positively with ischemia duration and peak post-operative transaminase (ALT) levels. There were no differences in mitochondrial DNA, nucleosome, or cytokine levels between the two groups. In mice, MitoQ neutralized hepatic oxidative stress and decreased HMGB1 release by ±50%. MitoQ suppressed transaminase release, hepatocellular necrosis, and cytokine production. Reconstituting disulfide HMGB1 during reperfusion reversed these protective effects. Conclusion: HMGB1 seems the most pertinent DAMP in clinical hepatic I/R injury. Neutralizing mitochondrial oxidative stress may limit DAMP release after hepatic I/R and reduce liver damage.

    Hypothermic perfusion with retrograde outflow during right hepatectomy is safe and feasible
    Reiniers, Megan J. ; Olthof, Pim B. ; Golen, Rowan F. van; Heger, Michal ; Beek, Adriaan A. van; Meijer, Ben ; Leen, René ; Kuilenburg, André B.P. van; Mearadji, Banafsche ; Bennink, Roelof J. ; Verheij, Joanne ; Gulik, Thomas M. van - \ 2017
    Surgery 162 (2017)1. - ISSN 0039-6060 - p. 48 - 58.

    Background: In situ hypothermic perfusion during liver resection performed under vascular inflow occlusion decreases hepatic ischemia-reperfusion injury, but technical limitations have restricted its widespread use. In situ hypothermic perfusion with retrograde outflow circumvents these impediments and thus could extend the applicability of in situ hypothermic perfusion. The safety and feasibility of in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow were analyzed in selected patients undergoing right (extended) hepatectomy and compared to intermittent vascular inflow occlusion, the gold standard method, in this randomized pilot study. Methods: Patients were first screened for parenchymal liver disease (exclusion criteria: steatosis ≥30%, cirrhosis, or cholestasis). Study participants were randomized intraoperatively to undergo in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow (n = 9) or intermittent vascular inflow occlusion (n = 9). The target liver core temperature during in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow was 28°C. The primary end point was ischemia-reperfusion injury (expressed by peak postoperative transaminase levels). Secondary outcomes included functional liver regeneration (assessed by hepatobiliary scintigraphy) and clinical outcomes. Results: Peak transaminase levels, total bilirubin, and the international normalized ratio were similar between both groups, although a trend toward more rapid normalization of bilirubin levels was noted for the in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow group. Functional liver regeneration as evaluated by hepatobiliary scintigraphy was improved on postoperative day 3 following in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow but not after intermittent vascular inflow occlusion. Furthermore, in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow (requiring continuous ischemia) was comparable to intermittent vascular inflow occlusion for all clinical outcomes, including postoperative complications and hospital stay. Conclusion: The use of in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow appears to be safe and feasible in selected patients with healthy liver parenchyma and may benefit early functional liver regeneration. Future applications of in situ hypothermic perfusion with retrograde outflow include patients with damaged liver parenchyma who would require major hepatic resection with a prolonged vascular inflow occlusion duration.

    Warm ischemia time-dependent variation in liver damage, inflammation, and function in hepatic ischemia/reperfusion injury
    Olthof, Pim B. ; Golen, Rowan F. van; Meijer, Ben ; Beek, Adriaan A. van; Bennink, Roelof J. ; Verheij, Joanne ; Gulik, Thomas M. van; Heger, Michal - \ 2017
    Biochimica et Biophysica Acta. Molecular Basis of Disease 1863 (2017)2. - ISSN 0925-4439 - p. 375 - 385.

    Background Hepatic ischemia/reperfusion (I/R) injury is characterized by hepatocellular damage, sterile inflammation, and compromised postoperative liver function. Generally used mouse I/R models are too severe and poorly reflect the clinical injury profile. The aim was to establish a mouse I/R model with better translatability using hepatocellular injury, liver function, and innate immune parameters as endpoints. Methods Mice (C57Bl/6J) were subjected to sham surgery, 30 min, or 60 min of partial hepatic ischemia. Liver function was measured after 24 h using intravital microscopy and spectroscopy. Innate immune activity was assessed at 6 and 24 h of reperfusion using mRNA and cytokine arrays. Liver inflammation and function were profiled in two patient cohorts subjected to I/R during liver resection to validate the preclinical results. Results In mice, plasma ALT levels and the degree of hepatic necrosis were strongly correlated. Liver function was bound by a narrow damage threshold and was severely impaired following 60 min of ischemia. Severe ischemia (60 min) evoked a neutrophil-dominant immune response, whereas mild ischemia (30 min) triggered a monocyte-driven response. Clinical liver I/R did not compromise liver function and displayed a cytokine profile similar to the mild I/R injury model. Conclusions Mouse models using ≤ 30 min of ischemia best reflect the clinical liver I/R injury profile in terms of liver function dynamics and type of immune response. General significance This short duration of ischemia therefore has most translational value and should be used to increase the prospects of developing effective interventions for hepatic I/R.

    Transport and metabolism of fumaric acid in Saccharomyces cerevisiae in aerobic glucose-limited chemostat culture
    Shah, Mihir V. ; Mastrigt, Oscar van; Heijnen, Joseph J. ; Gulik, Walter M. van - \ 2016
    Yeast 33 (2016)4. - ISSN 0749-503X - p. 145 - 161.
    Fumaric acid - Futile cycling - Metabolism - Permeability coefficient - saccharomyces cerevisiae - Transport mechanism

    Currently, research is being focused on the industrial-scale production of fumaric acid and other relevant organic acids from renewable feedstocks via fermentation, preferably at low pH for better product recovery. However, at low pH a large fraction of the extracellular acid is present in the undissociated form, which is lipophilic and can diffuse into the cell. There have been no studies done on the impact of high extracellular concentrations of fumaric acid under aerobic conditions in S. cerevisiae, which is a relevant issue to study for industrial-scale production. In this work we studied the uptake and metabolism of fumaric acid in S. cerevisiae in glucose-limited chemostat cultures at a cultivation pH of 3.0 (pH

    Inhibition of NF-kB in tumor cells exacerbates immune celll activation following photodynamic therapy
    Broekgaarden, M. ; Kos, M. ; Jurg, F.A. ; Beek, A.A. van; Gulik, M. van; Heger, M. - \ 2015
    International Journal of Molecular Sciences 16 (2015)8. - ISSN 1661-6596 - p. 19960 - 19977.
    Although photodynamic therapy (PDT) yields very good outcomes in numerous types of superficial solid cancers, some tumors respond suboptimally to PDT. Novel treatment strategies are therefore needed to enhance the efficacy in these therapy-resistant tumors. One of these strategies is to combine PDT with inhibitors of PDT-induced survival pathways. In this respect, the transcription factor nuclear factor ¿B (NF-¿B) has been identified as a potential pharmacological target, albeit inhibition of NF-¿B may concurrently dampen the subsequent anti-tumor immune response required for complete tumor eradication and abscopal effects. In contrast to these postulations, this study demonstrated that siRNA knockdown of NF-¿B in murine breast carcinoma (EMT-6) cells increased survival signaling in these cells and exacerbated the inflammatory response in murine RAW 264.7 macrophages. These results suggest a pro-death and immunosuppressive role of NF-¿B in PDT-treated cells that concurs with a hyperstimulated immune response in innate immune cells.
    Het nieuwe Telen bij tulpenbroei
    Gulik, T. van der; PPO BBF Bloembollen, - \ 2013
    BloembollenVisie 2013 (2013)264. - ISSN 1571-5558 - p. 24 - 25.
    In juni 2008 heeft de KAVB het Convenant Schone & Zuinige Agrosectoren ondertekend, waarbij het doel is: een energiebesparing van 2,2 % per jaar. De ambitie is om in 2020 bij nieuw te starten bloembollenbedrijven klimaatneutraal en economisch rendabel te kunnen telen/broeien. In dit artikel de stand van zaken.
    State-of-the-Art bewaarsysteem tulpenbollen : Resultaten 2011
    Wildschut, J. ; Dam, M.F.N. van; Kok, M. ; Gulik, T. van der - \ 2012
    Lisse : Praktijkonderzoek Plant & Omgeving, Bollen en Bomen - 33 p.
    bloembollen - tulpen - opslag - ventilatie - temperatuur - energiebesparing - landbouwkundig onderzoek - ornamental bulbs - tulips - storage - ventilation - temperature - energy saving - agricultural research
    Resultaten van het op 5e jaar State-of-Art bewaren van tulpenbollen op 12 bedrijven waarvan de energie- en achtergrondgegevens verzameld zijn. De 12 bedrijven hadden allen dit jaar een zeer laag berekend percentage zure bollen (0.06 % tot maximaal 1,3%). Door geheel of gedeeltelijk de ventilatie op ethyleenmetingen te sturen en ook de circulatie hierop aan te passen kon hierdoor veel energie bespaard worden. Op gas is er gemiddeld 27% bespaard, variërend van -15% (op het bedrijf dat de ventilatie niet stuurt op basis van de ethyleenmeting) tot 80%. Bij volledige sturing van de ventilatie op basis van een ethyleengrens van 100 ppb had de gemiddelde besparing 79% kunnen zijn. Op elektra is door terugtoeren gemiddeld 53% bespaard, variërend van -17% (op het bedrijf dat continue op voltoeren circuleert) tot 95%. Bij terugtoeren evenredig met verminderde ventilatie a.g.v. de lage ethyleenproductie, maar met een minimum frequentie-instelling van 15 Hz, had gemiddeld 84% bespaard kunnen worden. Op elektra is dus meer bespaard dan op gas. Op het totale energieverbruik (gas voor het opwarmen van buitenlucht voor ventilatie + elektra voor circulatieventilatoren) is bij de bewaring gemiddeld 44% bespaard, variërend van -17% tot 76%.
    Ontsmetten met Easy Ice Clean ("Coldblast") "Proof of principle"
    Ludeking, D.J.W. ; Hamelink, R. ; Gulik, M.W. van; Diepenhorst, T. - \ 2012
    Bleiswijk : Wageningen UR Glastuinbouw (Rapporten GTB 1156) - 22
    glastuinbouw - hygiëne - decontaminatie - hogedruktechnologie - koudeshock - ontsmettingsmiddelen - nederland - greenhouse horticulture - hygiene - decontamination - high pressure technology - cold shock - disinfectants - netherlands
    In dit onderzoek is er gekeken naar de potentie en het proof of principle van de Cold Jet techniek van Easy Ice Clean in de tuinbouw. Met dit onderzoek is getracht te beantwoorden of de Cold Jet techniek potentie heeft als alternatieve ontsmettingstechniek voor chemische middelen. De techniek die in dit onderzoek een rol speelde is een techniek die gebruik maakt van droogijs (bevroren CO2). Droogijspellets worden onder grote druk op een te reinigen oppervlak gestraald. Als gevolg van de koude shock en de kracht van de straal kunnen oppervlakken worden gereinigd en misschien wel worden ontsmet. Deze techniek kan een milieuvriendelijke oplossing zijn voor het reinigen van oppervlakken zoals tafels, vloeren, materialen en kassen bij uiteenlopende glastuinbouwteelten. Op basis van het uitgevoerde experiment kan worden geconcludeerd dat de droogijsstraal techniek een onvoldoende ontsmettend effect heeft om een alternatief te zijn voor chemische ontsmettingsmiddelen. De techniek heeft potentie in de glastuinbouw bij het schoonmaken van ernstig vervuilde oppervlakken en complexe apparatuur en installaties. Ook installaties en apparatuur die gevoelig zijn voor water (corrosie) kunnen met deze methode wel grondig worden schoon gemaakt. Ook kan de techniek in combinatie met andere aanvullende technieken wel leiden tot een schoon én ontsmet oppervlak.
    State-of-the-Art bewaarsysteem tulpenbollen : Resultaten 2010
    Wildschut, J. ; Putten, K. van der; Dam, M.F.N. van; Sapounas, A. ; Gulik, T. van der; Diepen, G. van - \ 2011
    Lisse : PPO Bloembollen en Bomen - 43 p.
    bloembollen - tulpen - opslag - ventilatie - temperatuur - energiebesparing - duurzame energie - landbouwkundig onderzoek - ornamental bulbs - tulips - storage - ventilation - temperature - energy saving - sustainable energy - agricultural research
    Het project State-of-the-Art bewaren van tulpenbollen is in 2007 opgestart om te demonstreren wat er met behoud of verbetering van productkwaliteit, met de huidige stand der techniek aan energiebesparing mogelijk is. En om met aanvullend onderzoek op de deelnemende bloembollenbedrijven in de toekomst nog meer te kunnen besparen. Voor het 4de jaar op rij is er door de nu 10 deelnemers fors bespaard op energie: gemiddeld 30% op gas en 44% op elektra. Op het bedrijf dat het meest op gas bespaarde was dat zelfs 72% en op het bedrijf dat het meest op elektra bespaarde was dat 80%. Het doel van het project is tweeledig: Spoor 1) demonstreren wat er met behoud of verbetering van de productkwaliteit met de huidige stand der techniek aan energiebesparing in de bewaring bij tulp mogelijk is. Spoor 2) aanvullend onderzoek & ontwikkeling om hierbij in de toekomst nog meer energie te kunnen besparen.
    State-of-the-Art bewaarsysteem tulpenbollen - Resultaten 2009
    Wildschut, J. ; Gude, H. ; Dam, M. van; Sapounas, A. ; Kok, M. ; Gulik, T. van der - \ 2010
    Lisse : PPO Bloembollen, Boomkwekerij en Fruit (PPO-rapport ) - 47 p.
    Energiebesparingen in het project Energiek geregeld : drogen met kaslucht en andere maatregelen
    Wildschut, J. ; Kok, M. ; Gulik, T. van der - \ 2010
    Lisse : PPO Bloembollen en Bomen
    State-fo-the-Art bewaren van tulpenbollen, resultaten 2009
    Wildschut, J. ; Sapounas, A. ; Kok, M. ; Gulik, T. van der - \ 2010
    BloembollenVisie 2010 (2010)209. - ISSN 1571-5558 - p. 24 - 25.
    duurzaamheid (sustainability) - bloembollen - tulpen - opslagkwaliteit - energiebehoud - besparingen - sustainability - ornamental bulbs - tulips - storage quality - energy conservation - savings
    Het project State-of-the Art bewaren van tulpenbollen' is in 2007 met vier bloembollenbedrijven van start gegaan. Hoofddoel van het project was vooral het demonstreren van energiebesparingsmogelijkheden. Uiteraart met behoud van de kwaliteit van het product, of beter nog, met verbetering van de kwaliteit. Doel twee was te onderzoeken hoe er in de toekomst nog meer energie kan worden bespaard. Dat blijkt aardig wat te kunnen zijn.
    State-of-the-Art bewaarsysteem tulpenbollen
    Wildschut, J. ; Gude, H. ; Sapounas, A. ; Kok, M. ; Gulik, T. van der - \ 2010
    Lisse : PPO Bloembollen, Boomkwekerij en Fruit (PPO-rapport ) - 47 p.
    State/of/the/Art 2009 : Verbetering luchtverdeling één-laagssysteem
    Wildschut, J. ; Gulik, T. van der; Wit, G. de - \ 2010
    beluchting - landbouwtechniek - systeemontwikkeling - systeeminnovatie - aeration - agricultural engineering - system development - system innovation
    Poster over de verbetering van de luchtverdeling, een één-laagssysteem.
    State-of-the-Art bewaarsysteem tulpenbollen - Resultaten 2008
    Wildschut, J. ; Gude, H. ; Kok, M. ; Gulik, T. van der; Bisschops, B. - \ 2009
    Lisse : PPO Bloembollen, Boomkwekerij en Fruit (PPO-rapport ) - 36 p.
    State-of-the-Art 2009 : Verbetering luchtverdeling één-laagssysteem
    Wildschut, J. ; Gulik, T. van der; Wit, G. de - \ 2009
    State-of-the-Art 2008 : Resultaten Energiebesparing
    Wildschut, J. ; Gude, H. ; Kok, M. ; Gulik, T. van der - \ 2008
    Hakselen strodek op klei alleen effectief tegen graanopslag
    Zuilichem, J.A.A. van; Gulik, T.I.N. van der - \ 2005
    Landbouwmechanisatie 56 (2005)10. - ISSN 0023-7795 - p. 15 - 15.
    bloembollen - tulpen - tulipa - alternatieve landbouw - biologische landbouw - onkruidbestrijding - mulchen - stromulches - hakselen - strooisel - ornamental bulbs - tulips - tulipa - alternative farming - organic farming - weed control - chopping - litter (plant) - mulching - straw mulches
    Het hakselen van een dik strodek op tulpen in het najaar blijkt op zavel- en kleigrond alleen effectief te zijn tegen graanopslag. Er werd geen effect gevonden van het hakselen op het aantal onkruiden dat door het strodek kwam, zo is uit onderzoek van PPO en DLV bij een biologische teler gebleken
    Onderzoek in de pijplijn: onkruidbeheersing op zware grond en vreemde bladvlekkenziekte in bol- en knolgewassen
    Gulik, T. van der; Zuilichem, J.A.A. van - \ 2005
    BloembollenVisie (2005)70. - ISSN 1571-5558 - p. 22 - 22.
    tulpen - cultuurmethoden - biologische landbouw - strooisel - afdekken - onkruidbestrijding - bodemtypen (naar textuur) - bloembollen - bladvlekkenziekte - afwijkingen, planten - schimmelziekten - landbouwkundig onderzoek - tulips - cultural methods - organic farming - litter (plant) - casing - weed control - soil types (textural) - ornamental bulbs - leaf spotting - plant disorders - fungal diseases - agricultural research
    Aandacht voor toepassing van strodek tegen onkruidgroei in de biologische teelt van tulp en onderzoek naar gewasmonsters van bollen en knollen met vreemde bladaantastingen
    Effects of soil fumigation and flooding on suppression of Pythium root rot in ornamental bulb culture
    Os, G.J. van; Wijnker, J.P.M. ; Gulik, W.J.M. van - \ 1999
    European Journal of Plant Pathology 105 (1999). - ISSN 0929-1873 - p. 791 - 800.
    Check title to add to marked list
    << previous | next >>

    Show 20 50 100 records per page

     
    Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.