Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

    Records 1 - 20 / 2725

    • help
    • print

      Print search results

    • export
      A maximum of 250 titles can be exported. Please, refine your queryYou can also select and export up to 30 titles via your marked list.
    Check title to add to marked list
    Genotype by environment interaction between aerated and non-aerated ponds and the impact of aeration on genetic parameters in Nile tilapia (Oreochromis niloticus)
    Mengistu, Samuel B. ; Mulder, Han A. ; Benzie, John A.H. ; Khaw, Hooi Ling ; Megens, Hendrik Jan ; Trinh, Trong Quoc ; Komen, Hans - \ 2020
    Aquaculture 529 (2020). - ISSN 0044-8486
    Dissolved oxygen - Genotype by environment interaction - Harvest weigh - Nile tilapia - Survival - Thermal growth coefficient

    A major problem in smallholder Nile tilapia (Oreochromis niloticus) farms is that the achieved production is much lower than under optimal management. One of the main environmental factors contributing to lower production is dissolved oxygen (DO), because the majority of Nile tilapia production takes place under smallholder farms with no aeration of ponds which leads to large DO fluctuations. On the contrary, breeding programs select fish in aerated ponds. Aerating ponds is currently not an option for smallholder farmers because either it is too expensive or they lack access to cheap electricity supply. Therefore, it is crucial to know the genetic correlation between aerated and non-aerated ponds to optimize breeding programs to select fish that perform well in ponds with fluctuating DO levels. The objectives of this study were 1) to investigate the presence of genotype by environment (GxE) interaction between aerated and non-aerated earthen ponds using a design that minimized common environmental effects and 2) the impact of (non-)aeration on genetic parameters. The experimental fish were mass-produced using natural group spawning and nursed in four 30m2 hapas. A random sample of fingerlings from each hapa was tagged and randomly distributed to aerated and non-aerated ponds for a grow-out period of 217 and 218 days. Body weight and photographs were taken on five consecutive time points during grow-out. Of the stocked fish, 2063 were genotyped-by-sequencing. A genomic relationship matrix was built using 11,929 SNPs to estimate genetic parameters with ASReml. No-aeration significantly reduced mean harvest weight (HW), survival and thermal growth coefficient (TGC) compared to aeration. Substantial heritabilities (0.14–0.45) were found for HW, TGC, surface area (SA) and body shape, expressed as ellipticity, and low heritabilities (0.03–0.04) for survival in aerated and non-aerated ponds. In both ponds, the environmental effect common to full sibs was not significant. Genetic coefficients of variation were 20–23% lower and heritabilities were 19–25% lower in the non-aerated pond compared to the aerated pond, for HW, TGC and survival. Genetic correlations between ponds for HW, standard length, height, SA and TGC were 0.81, 0.80, 0.74, 0.78 and 0.78, respectively. In summary, some GxE interaction between aerated and non-aerated ponds was found and no-aeration decreased genetic coefficients of variation and heritabilities compared to aerated ponds. Breeding programs are recommended to use half sib information from non-aerated farms or to set up a reference population for genomic selection in a non-aerated environment either on-station or in farms.

    Swimming Performance and Oxygen Consumption as Non-lethal Indicators of Production Traits in Atlantic Salmon and Gilthead Seabream
    Palstra, Arjan P. ; Kals, Jeroen ; Böhm, Thijs ; Bastiaansen, John W.M. ; Komen, Hans - \ 2020
    Frontiers in Physiology 11 (2020). - ISSN 1664-042X
    aquaculture - feed conversion ratio - metabolic rate - selective breeding - starvation-refeeding - swim-tunnel respirometry

    The aim of this study was to investigate swimming performance and oxygen consumption as non−lethal indicator traits of production parameters in Atlantic salmon Salmo salar L. and Gilthead seabream Sparus aurata L. A total of 34 individual fish of each species were subjected to a series of experiments: (1) a critical swimming speed (Ucrit) test in a swim-gutter, followed by (2) two starvation-refeeding periods of 42 days, and (3) swimming performance experiments coupled to respirometry in swim-tunnels. Ucrit was assessed first to test it as a predictor trait. Starvation-refeeding traits included body weight; feed conversion ratio based on dry matter; residual feed intake; average daily weight gain and loss. Swim-tunnel respirometry provided oxygen consumption in rest and while swimming at the different speeds, optimal swim speed and minimal cost of transport (COT). After experiments, fish were dissected and measured for tissue weights and body composition in terms of dry matter, ash, fat, protein and moist, and energy content. The Ucrit test design was able to provide individual Ucrit values in high throughput manner. The residual Ucrit (RUcrit) should be considered in order to remove the size dependency of swimming performance. Most importantly, RUcrit predicted filet yield in both species. The minimal COT, the oxygen consumption when swimming at Uopt, added predictive value to the seabream model for feed intake.

    Ook planten worden ziek
    Gommers, Charlotte - \ 2020
    In: Cahier Biowetenschappen & Maatschappij / Govers, F., Pieterse, C., Termorshuizen, A., Smit, A., Den Haag : Stichting Biowetenschappen en Maatschappij (BWM) (Cahier Biowetenschappen & Maatschappij 2) - ISBN 9789073196988 - p. 8 - 11.
    We zijn veel met onze eigen gezondheid bezig, zeker als we geïnfecteerd raken met een virus of anderszins door een ziekte worden overvallen. Maar ook de gezondheid van planten moeten we goed bewaken, want akkergewassen, bomen en sierplanten worden continu belaagd door ziekteverwekkers en insecten. Soms zijn die belagers er jarenlang niet, om dan opeens weer toe te slaan. Waar komen ze vandaan, wat is hun impact en hoe worden ze geïdentificeerd door de plantendokters van nu?
    Voorkómen is beter
    Rossing, W.A.H. - \ 2020
    In: Cahier Biowetenschappen & Maatschappij / Govers, F., Pieterse, C., Termorshuizen, A., Smit, A., Den Haag : Stichting Biowetenschappen en Maatschappij (BWM) (Cahier Biowetenschappen & Maatschappij 2) - ISBN 9789073196988 - p. 35 - 37.
    Preventie is het codewoord in de plantgezondheid: hoe kunnen we ziektes vóór zijn, hoe kunnen we voorkomen dat het gewas wordt belaagd? Aanpassing van de omgeving van de plant is één manier: zorgen dat de barrières om bij de plant te komen, hoog zijn. Ook ín de plant kunnen we barricades opwerpen, door resistente planten te selecteren en te veredelen. Verder kunnen we met voorbehandeling van het zaad de plant een goede start geven en wapenen tegen indringers. En dan hebben we tegenwoordig ook nog apps die alarm slaan zodra de omstandigheden bevorderlijk zijn voor ziekteverwekkers.
    Optimizing design to estimate genetic correlations between environments with common environmental effects
    Lozano-Jaramillo, Maria ; Komen, Hans ; Wientjes, Yvonne C.J. ; Mulder, Han A. ; Bastiaansen, John W.M. - \ 2020
    Journal of Animal Science 98 (2020)2. - ISSN 0021-8812
    breeding programs - genetic correlation - genotype by environment interaction - population structure

    Breeding programs for different species aim to improve performance by testing members of full-sib (FS) and half-sib (HS) families in different environments. When genotypes respond differently to changes in the environment, this is defined as genotype by environment (G × E) interaction. The presence of common environmental effects within families generates covariance between siblings, and these effects should be taken into account when estimating a genetic correlation. Therefore, an optimal design should be established to accurately estimate the genetic correlation between environments in the presence of common environmental effects. We used stochastic simulation to find the optimal population structure using a combination of FS and HS groups with different levels of common environmental effects. Results show that in a population with a constant population size of 2,000 individuals per environment, ignoring common environmental effects when they are present in the population will lead to an upward bias in the estimated genetic correlation of on average 0.3 when the true genetic correlation is 0.5. When no common environmental effects are present in the population, the lowest standard error (SE) of the estimated genetic correlation was observed with a mating ratio of one dam per sire, and 10 offspring per sire per environment. When common environmental effects are present in the population and are included in the model, the lowest SE is obtained with mating ratios of at least 5 dams per sire and with a minimum number of 10 offspring per sire per environment. We recommend that studies that aim to estimate the magnitude of G × E in pigs, chicken, and fish should acknowledge the potential presence of common environmental effects and adjust the mating ratio accordingly.

    Aanzet Kennisprogramma Circulair Terreinbeheer : Landbouwkundig relevante eigenschappen van maaisel, bokashi en compost
    Romkens, P.F.A.M. ; Rietra, R.P.J.J. ; Spijker, J.H. - \ 2020
    Wageningen : Wageningen Environmental Research (Wageningen Environmental Research rapport 3006) - 45
    Toepassing van maaisel uit bermen, openbaar groen en natuurgebieden voor een betere bodemkwaliteit sluit aan op de doelen van circulair terreinbeheer.In dit rapport zijn zowel de positieve effecten op bodemkwaliteit als de potentiële risico’s van drie bewerkingswijzen verkend: rechtstreeks onderwerken van maaisel, toepassing van bokashi en van compost. De beschouwde positieve effecten van het gebruik van organische bodemverbeteraars zijn onder meer koolstofvastlegging in de bodem na toepassing, nutriënten-leverend vermogen, ziektewerendheid en stimulering van de bodembiodiversiteit. Aan de andere kant komen aspecten als emissie van broeikasgassen, risico’s van accumulatie van zware metalen en onkruiddruk aan de orde. Voorts is aangegeven welke kennis nog ontbreekt. Het rapport sluit af met aanbevelingen voor een kennisagenda.
    Konijnen in de duinen van Meijendel : vier verschillende telmethoden om de konijnendichtheid te schatten
    Bankert, D. ; Groen, K.C.G. in 't - \ 2020
    Holland's Duinen (2020)42. - ISSN 1389-7373 - p. 5 - 11.
    rabbits - monitoring - zoogeography - duneland - zuid-holland
    De transectmethode is een methode die gebruikt wordt om konijnenpopulaties te monitoren. De methode wordt uitgevoerd door beheerders van alle duingebieden aan de Nederlandse vastelandskust. Onderstaand onderzoek is uitgevoerd om meer duidelijkheid te krijgen over de betekenis van de aantallen konijnen die geteld worden met deze methode. In hoeverre komen de getelde aantallen overeen met de aantallen konijnen aanwezig in delen waar niet geteld wordt?
    Natuurinclusieve landbouw: wat mogen we ervan verwachten?
    Melman, T.C.P. - \ 2020
    Vakblad Natuur Bos Landschap 17 (2020)164. - ISSN 1572-7610 - p. 4 - 7.
    De term natuurinclusieve landbouw stamt uit de Rijksvisie Natuurlijk Verder (2014). Het staat voor het verlangen om landbouw en natuur weer bij elkaar te brengen, om landbouw duurzaam te maken. Het begrip is opzettelijk niet strak gedefinieerd omdat het een uitnodiging was om mee te denken hoe de negatieve effecten van landbouw kunnen worden verminderd door meer gebruik te maken van natuur. Met het ecosysteem als basis voor de landbouw zou er wellicht ook meer ruimte komen voor biodiversiteit, was de gedachte. Natuur en landbouw, die vaak op zeer gespannen voet met elkaar staan, zouden zo weer kunnen worden verenigd. Heeft dit kans van slagen of is het idealistische luchtfietserij?
    Evaluatie trekvisonderzoeken Noordzeekanaal en ommelanden : onderzoek in het kader van samenwerkingsverband Ecologische Verbindingszone Noordzeekanaal en Ommelanden Fase 1
    Winter, H.V. ; Griffioen, A.B. ; Bruijn, P. de - \ 2020
    IJmuiden : Wageningen Marine Research (Wageningen Marine Research rapport C015/20) - 88
    De doelstelling van deze rapportage is het integreren en evalueren van de onderzoeken die zijn uitgevoerd in de jaren 2016-2018 naar de migratie van de trekvissen aal en driedoornige stekelbaars. In de rapportage worden de diverse deelgebieden met kengetallen, migratieknooppunten en aanbevelingen besproken, waarbij ook andere relevante kennis wordt betrokken en gepresenteerd. Het doel van de evaluatie is het samenbrengen van de verworven kennis, het komen tot concrete aanbevelingen voor beheer en het identificeren van kennisleemtes. De onderzoeken hebben interessante biologische kennis opgeleverd van de onderzochte trekvissoorten, die wordt ook gepresenteerd in een kennisbeschouwing.
    Inventarisatie leegstand agrarisch vastgoed Overijssel : Ontwikkeling aard en omvang agrarisch vastgoed in provincie Overijssel tussen 2012 en 2018 en prognose ontwikkeling tot 2030
    Gies, T.J.A. ; Smidt, R. - \ 2020
    Wageningen : Wageningen Environmental Research (Wageningen Environmental Research rapport 2992) - 27
    Jaarlijks stoppen er agrarische bedrijven in Overijssel en komen de agrarische bedrijfsgebouwen vrij. In 2016 heeft Wageningen Environmental Research (toen Alterra geheten) voor de provincie Overijssel een analyse gemaakt van de aard en omvang van leegstand van agrarisch vastgoed in de provincie Overijssel in de periode 2012-2030. Inmiddels zijn we een aantal jaar verder en worden de cijfers in deze publicatie geactualiseerd.
    Microbiome-derived carnitine mimics as previously unknown mediators of gut-brain axis communication
    Hulme, Heather ; Meikle, Lynsey M. ; Strittmatter, Nicole ; Hooft, Justin J.J. van der; Swales, John ; Bragg, Ryan A. ; Villar, Victor H. ; Ormsby, Michael J. ; Barnes, Stephanie ; Brown, Sheila L. ; Dexter, Alex ; Kamat, Maya T. ; Komen, Jasper C. ; Walker, Daniel ; Milling, Simon ; Osterweil, Emily K. ; MacDonald, Andrew S. ; Schofield, Chris J. ; Tardito, Saverio ; Bunch, Josephine ; Douce, Gillian ; Edgar, Julia M. ; Edrada-Ebel, Ru Angelie ; Goodwin, Richard J.A. ; Burchmore, Richard ; Wall, Daniel M. - \ 2020
    Science Advances 6 (2020)11. - ISSN 2375-2548

    Alterations to the gut microbiome are associated with various neurological diseases, yet evidence of causality and identity of microbiome-derived compounds that mediate gut-brain axis interaction remain elusive. Here, we identify two previously unknown bacterial metabolites 3-methyl-4-(trimethylammonio)butanoate and 4-(trimethylammonio)pentanoate, structural analogs of carnitine that are present in both gut and brain of specific pathogen-free mice but absent in germ-free mice. We demonstrate that these compounds are produced by anaerobic commensal bacteria from the family Lachnospiraceae (Clostridiales) family, colocalize with carnitine in brain white matter, and inhibit carnitine-mediated fatty acid oxidation in a murine cell culture model of central nervous system white matter. This is the first description of direct molecular inter-kingdom exchange between gut prokaryotes and mammalian brain cells, leading to inhibition of brain cell function.

    Bestandsopname van mosselen op mosselkweekpercelen in de Waddenzee in december 2019
    Capelle, Jakob J. ; Stralen, Marnix R. van - \ 2020
    Yerseke : Wageningen Marine Research (Wageningen Marine Research rapport C017/20) - 26
    Een van de uitgangspunten bij de mosselzaadvisserij is dat de omvang van het mosselbestand in de Waddenzee en daarmee het voedselaanbod voor vogels niet minder is dan in een situatie waar niet wordt gekweekt en gevist. Dat betekent dat in het najaar een zekere hoeveelheid mosselen op de kweekpercelen in de Waddenzee aanwezig dient te zijn. In 2019 (peildatum 1 december) is deze hoeveelheid vastgesteld op 31,8 miljoen kg netto versgewicht. Na de voorjaarsvisserij wordt met een bestandsopname een schatting gemaakt van het bestand op de kweekpercelen (de zogenaamde ‘starthoeveelheid’) en wordt vervolgens bijgehouden hoeveel mosselen afgevoerd worden en hoeveel mosselen erbij komen. Een tweede bestandsopname is bedoeld om te kunnen valideren of de eerder genoemde hoeveelheid mosselen aan het begin van de winter inderdaad op de percelen aanwezig is. Voorliggende rapportage betreft de bestandsopname van mosselen op percelen in de Waddenzee in december 2019, om te valideren of het bestand van 31,8 miljoen kg op 1 december 2019 op de percelen aanwezig was. Hiertoe zijn in de Waddenzee alle kweekpercelen of delen van kweekpercelen waar mosselen verwacht worden eind november en begin december 2019 bemonsterd. Het totale bestand op de percelen in december 2019 is hiermee geschat op 89,7 miljoen kg versgewicht. Op basis van deze schatting kan geconcludeerd worden dat de benodigde minimale hoeveelheid mosselen op 1 december 2019 ruimschoots op de percelen aanwezig was.
    Tussenrapportage monitoring off-bottom oesterkweek experimenten in de Oosterschelde : Resultaten BOKX project 2016-2019
    Kamermans, Pauline ; Tonk, Linda ; Ysebaert, Tom - \ 2020
    Yerseke : Wageningen Marine Research (Wageningen Marine Research rapport C029/20) - 45
    De oesterkweek in de Oosterschelde ondervindt een probleem met niet inheemse oesterboorders die tot sterfte leiden van oesters op kweekpercelen. Daarnaast is sinds 2010 aangetoond dat er in de Oosterschelde een oester herpes virus voorkomt waardoor er met name bij de jonge oesters een veel hogere sterfte optreedt dan voorheen. Om te komen tot herstel van de oesterproductie hebben de Nederlandse Oestervereniging (NOV), de Provincie Zeeland en het ministerie van LNV een Plan van Aanpak opgesteld om, onder andere met behulp van voor Nederland nieuwe technieken, de problemen te beheersen. Door op verschillende locaties ervaring op te doen met nieuwe technieken kunnen de resultaten met elkaar worden vergeleken. Een dergelijke vergelijking geeft de kwekers meer inzicht in de voor- en nadelen van het gebruik van verschillende locaties en methoden in de Oosterschelde. De nieuwe technieken hebben allemaal betrekking op off-bottom kweek van oesters. De kweekactiviteiten worden begeleid door Wageningen Marine Research met onderzoek naar de effectiviteit en de effecten op de natuur. De resultaten laten zien dat de nieuwe techniek van off-bottom teelt goede groei van oesters laat zien. Off-bottom teelt van oesters heeft geen effect op het slibgehalte van het sediment. Voor het bepalen van effecten op de aanwezigheid van bodemdiatomeeën zijn nog onvoldoende gegevens beschikbaar. Op off-bottom percelen is de aanwezigheid van de Wulp en ganzen lager (en dan met name in de wintermaanden), vergelijkbaar voor eenden en hoger voor reigers. De aantallen Steenloper, Zilverplevier, Bergeend, Scholekster, Grutto, Strandloper, Tureluur, Smient, Pijlstaart, Middelste zaagbek, Lepelaar, Visdiefje, Kleine zilverreiger, Kauw, Aalscholver en Fuut zijn te laag om uitspraken te kunnen doen over het effect van off-bottom teelt op aanwezigheid van deze vogelsoorten. De aanbevelingen voor vervolgonderzoek betreffen: • Vergelijken van slib- en chlorofylgehalte van het sediment van off-bottom percelen met dat van referentiepercelen. • Uitbreiden van analyse met foto’s camera’s om meer inzicht te krijgen in aanwezigheid van vogelsoorten tijdens zomermaanden en van vogelsoorten met lagere dichtheden over het hele jaar (Steenloper, Zilverplevier, Bergeend, Scholekster, Grutto, Strandloper, Tureluur, Smient, Pijlstaart, Middelste zaagbek, Lepelaar, Visdiefje, Kleine zilverreiger, Kauw, Aalscholver en Fuut). • Analyseren met foto’s camera’s van het eventuele effect van de aanwezigheid van kwekers op de aanwezigheid van vogels.
    Improving growth and survival of tilapia in brackish water
    Aththar, Farid ; Bastiaansen, J.W.M. ; Komen, J. - \ 2020
    In: Wias Annual Conference 2020 WIAS - p. 77 - 77.
    Global shrimp farming faces numerous problem related to environmental and climate change such as, disease outbreaks, rising of sea level and seawater intrusion. Those effects on shrimp farming are linked with livelihood security of small-scale shrimp farmers. In Indonesia,half a million households are involved directly in brackish water pond aquaculture producing mainly shrimp. Disease outbreaks in shrimp ponds have recurrently caused serious crop failures. As a result, many small-scale farmers face severe financial difficulties and are looking for alternative crops to secure their livelihoods. An economically promising alternative is to culture shrimp with tilapia in a so-called polyculture system. Salinity levels in shrimp ponds, however, vary greatly and cause large mortalities and poor growth in currently available strains of tilapia. What is needed is a strain of tilapia that has good growth and survival over a range of (fluctuating) salinities. For these traits, estimation of genetic parameters and accurate selection for salinity tolerance is needed. The starting material for research and breeding of salinity tolerance tilapia are available however the breeding program is needed. Objectives of the research are: 1) new fundamental knowledge about genetics of growth and survival under fluctuating salinities in tilapia, and 2) to develop an optimised breeding strategy to improve growth rate and survival of tilapia grown in brackish water ponds. There are several steps to reach the objectives: 1) obtain genetic parameters for growth rate and survival and calculate genotype by environment interaction of Nile tilapia in freshwater and brackish water, 2) obtain genetic parameter for tilapia reproduction, 3) identify physiological trait for salinity adaptation and 4) design an optimal breeding program for increased growth and survival in shrimp-tilapia systems. Results from the project are expected to allow the development of a sustainable breeding program for tilapia that supports an aquaculture production system that is accessible, affordable and applicable for farmers with brackish water ponds in Indonesia and elsewhere.
    Integrating selective breeding into commercial production of aquaculture species
    Gulzari, Benan ; Bastiaansen, J.W.M. ; Komen, J. - \ 2020
    In: Wias Annual Conference 2020 WIAS - p. 58 - 58.
    Family-based nucleus fish breeding programs are expensive operations. The cost of such fish breeding programs is not justified for many fish species cultured globally. An alternative to nucleus breeding programs is to integrate selective breeding into commercial aquaculture production. In integrated breeding programs the selection is performed on animals that are kept under commercial production circumstances using the data collected in the production environment.The objective of this PhD project is to understand the principles of and develop methods to optimise the design of integrated breeding programs for fish species.The first step is developing data collection strategies for economically important traitsdirectly from the commercial production environment to uniformly represent all individuals within the production system. Second step is developing precise and high-through put measurement techniques to phenotype large numbers of animals in the commercial environment in a fast and accurate way in combination with prediction of slaughter traits for alive fish (e.g. fillet yield) using computer vision. Third are methods for making a selection decision as soon as a fish is phenotyped by combining data collection, statistical analysis and selection of animals into one single step using computer vision and machine learning.Final step is designing and optimising an integrated breeding program, based on novel phenotyping and single-step selection techniques. Phenotypic data collection, imaging and genotyping of fish will be performed within the context of experiments in different EU projects. Throughout the PhD project, the analyses will be carried out and simulations will be performed based on commercial production data of gilthead seabream and parameters of various breeding companies.
    The genetic correlation between feed conversion ratio and growth rate affects the design of a breeding program for more sustainable fish production
    Besson, Mathieu ; Komen, Hans ; Rose, Gus ; Vandeputte, Marc - \ 2020
    Genetics, Selection, Evolution 52 (2020)1. - ISSN 0999-193X

    Background: Most fish breeding programs aim at improving growth rate and include feed conversion ratio (FCR) neither in the breeding goal nor in the selection index, although decreasing FCR is known to increase farm profit and decrease environmental impacts. This is because FCR is difficult to measure in fish that live in groups and FCR is assumed to have a favourable (negative) genetic correlation with growth, although the magnitude of this correlation is unknown. We investigated the effect of the genetic correlation between growth and FCR on the economic and environmental responses of a two-trait breeding goal (growth and FCR), compared to a single-trait breeding goal (growth only). Next, we evaluated the weights to assign to growth and FCR in a two-trait breeding goal to maximize sustainability of fish production. Methods: We used pseudo-best linear unbiased prediction (BLUP) index calculations to simulate a breeding program for sea bass. For the single-trait breeding goal, the trait in the breeding goal and in the index was thermal growth coefficient (TGC) and for the two-trait breeding goal, the traits in the breeding goal were TGC and FCR and the traits in the index were TGC and percentage of fat in the dorsal muscle (an indirect measure of FCR). We simulated responses to selection for genetic and phenotypic correlations between TGC and FCR ranging from 0 to - 0.8. Then, in the two-trait breeding goal, we calculated the economic return and the change in eutrophication when using economic values (EV) or environmental values (ENV). Results: When the genetic correlation between TGC and FCR was lower than - 0.45, we found major differences in economic returns and in eutrophication between single and two-trait breeding programs. At a correlation of - 0.25, the two-trait breeding goal based on EV increased economic return by 25% compared to the single-trait breeding goal, while using ENV decreased eutrophication by 1.34% per ton of fish produced after one generation of selection. Conclusions: The genetic correlation between TGC and FCR affects the magnitude of economic losses due to omitting FCR in the breeding program. In addition, the genetic correlation affects the importance of choosing EV or ENV to reduce eutrophication and increase profit.

    Circulaire oplossingen voor vluchtelingenkampen
    Rooij, L.L. de - \ 2020
    Wageningen : Wageningen University & Research
    Vluchtelingen komen vaak terecht in gebieden waar al armoede, water- of voedseltekort is. Wageningse onderzoekers, bedrijven en organisaties werken samen aan circulaire oplossingen om de leefomstandigheden van vluchtelingen en de gastbevolking te verbeteren. Zoals in Uganda, waar men bomen kapt voor brandhout om mee te koken. Pas wanneer je een alternatief biedt als kookstellen op zonne-energie, kun je gaan herbebossen. Een goede zaak, dat Nederlandse bedrijven en wetenschappers hieraan werken?
    A systematic literature review of the major factors causing yield gap by affecting growth, feed conversion ratio and survival in Nile tilapia (Oreochromis niloticus).
    Mengistu, Samuel ; Mulder, H.A. ; Benzie, John A.H. ; Komen, J. - \ 2020
    Reviews in Aquaculture 12 (2020)2. - ISSN 1753-5123 - p. 524 - 541.
    Productivity among small‐ and medium‐scale tilapia farms varies considerably. The difference between the best performers and lower ones (yield gap), is affected by differences in growth rate and feed conversion ratio (FCR). FCR at the farm level is strongly influenced by survival of fish. In this study a systematic literature review of two databases (ASFA and CAB‐Abstracts) identified 1973 potentially relevant articles. Data from 32 articles that met the inclusion criteria were analysed using linear mixed models for the most important factors with significant contributions to growth [investigated through analysis of the thermal growth coefficient (TGC)], survival and FCR of Nile tilapia. Increasing crude protein (CP), dissolved oxygen (DO) and pH significantly decreased FCR and increased TGC. Increasing stocking weight (SW) significantly improved both FCR and survival. Temperature had the largest effect on FCR followed by DO, pH and CP. DO had the largest effect on TGC followed by CP and pH. This study confirms that the optimal rearing temperature for Nile tilapia is between 27 and 32°C. Improving management to optimize DO (> 5 mg/L), stocking density (3–5 fish/m2), SW (> 10 g) and CP (25 − 30%) will improve performance and survival in small‐ and medium‐scale tilapia farming. However, it is hard to influence temperature in ponds and cages while DO is largely influenced by aeration. Since many small‐ and medium‐sized farms do not have aeration, these major tilapia farming systems could benefit from genetically improved strains selected for resilience to highly fluctuating diurnal temperature and DO levels.
    Leven met wilde natuur
    Buscher, Bram - \ 2020

    Wereldwijd komen wilde dieren op veel plekken in het nauw. Hun leefgebied slinkt door oprukkende menselijke bewoning, land- en mijnbouw en industrialisatie. Wageningse wetenschappers doen veldonderzoek naar oplossingen om mens en dier beter samen te leren leven. Ze stellen vast dat we meer natuur kunnen behouden wanneer we afscheid nemen van ongelimiteerde economische groei. Hoe denk jij dat we de natuur het beste kunnen beschermen?

    Chronic simultaneous exposure of common carp (Cyprinus carpio) from embryonic to juvenile stage to drospirenone and gestodene at low ng/L level caused intersex
    Šauer, Pavel ; Tumová, Jitka ; Steinbach, Christoph ; Golovko, Oksana ; Komen, Hans ; Maillot-Maréchal, Emmanuelle ; Máchová, Jana ; Grabic, Roman ; Aït-Aïssa, Selim ; Kocour Kroupová, Hana - \ 2020
    Ecotoxicology and Environmental Safety 188 (2020). - ISSN 0147-6513
    Adverse effects - Hormones - Pollutants - Progestogens - Reproduction

    Synthetic progestins are emerging contaminants of the aquatic environment with endocrine disrupting potential. The main aim of the present study was to investigate the effects of the synthetic progestins gestodene, and drospirenone on sex differentiation in common carp (Cyprinus carpio) by histological analysis. To gain insights into the mechanisms behind the observations from the in vivo experiment on sex differentiation, we analyzed expression of genes involved in hypothalamus–pituitary–gonad (HPG) and hypothalamus–pituitary–thyroid (HPT) axes, histology of hepatopancreas, and in vitro bioassays. Carp were continuously exposed to concentrations of 2 ng/L of single progestins (gestodene or drospirenone) or to their mixture at concentration 2 ng/L of each. The exposure started 24 h after fertilization of eggs and concluded 160 days post-hatching. Our results showed that exposure of common carp to a binary mixture of drospirenone and gestodene caused increased incidence of intersex (32%) when compared to clean water and solvent control groups (both 3%). Intersex most probably was induced by a combination of multiple modes of action of the studied substances, namely anti-gonadotropic activity, interference with androgen receptor, and potentially also with HPT axis or estrogen receptor.

    Check title to add to marked list
    << previous | next >>

    Show 20 50 100 records per page

    Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.