Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

Records 1 - 20 / 57

  • help
  • print

    Print search results

  • export

    Export search results

  • alert
    We will mail you new results for this query: q=Neven
Check title to add to marked list
Remote sensing and signaling in kidney proximal tubules stimulates gut microbiome-derived organic anion secretion
Jansen, Jitske ; Jansen, Katja ; Neven, Ellen ; Poesen, Ruben ; Othman, Amr ; Mil, Alain van; Sluijter, Joost ; Torano, Javier Sastre ; Zaal, Esther A. ; Berkers, Celia R. ; Esser, Diederik ; Wichers, Harry J. ; Ede, Karin van; Duursen, Majorie van; Burtey, Stéphane ; Verhaar, Marianne C. ; Meijers, Björn ; Masereeuw, Rosalinde - \ 2019
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 116 (2019)32. - ISSN 0027-8424 - p. 16105 - 16110.
Indoxyl sulfate - Kidney proximal tubule - Organic anion transporter 1 - Remote sensing and signaling

Membrane transporters and receptors are responsible for balancing nutrient and metabolite levels to aid body homeostasis. Here, we report that proximal tubule cells in kidneys sense elevated endogenous, gut microbiome-derived, metabolite levels through EGF receptors and downstream signaling to induce their secretion by up-regulating the organic anion transporter-1 (OAT1). Remote metabolite sensing and signaling was observed in kidneys from healthy volunteers and rats in vivo, leading to induced OAT1 expression and increased removal of indoxyl sulfate, a prototypical microbiome-derived metabolite and uremic toxin. Using 2D and 3D human proximal tubule cell models, we show that indoxyl sulfate induces OAT1 via AhR and EGFR signaling, controlled by miR-223. Concomitantly produced reactive oxygen species (ROS) control OAT1 activity and are balanced by the glutathione pathway, as confirmed by cellular metabolomic profiling. Collectively, we demonstrate remote metabolite sensing and signaling as an effective OAT1 regulation mechanism to maintain plasma metabolite levels by controlling their secretion.

Neveneffecten van niet-chemische onkruidbestrijding in de landbouw : Een literatuurstudie naar de (neven)effecten op drie groepen: bodemleven, insecten en broedsel
Rombout, Sjoerd ; Rozen, Klaas van; Riemens, Marleen - \ 2019
Lelystad : Stichting Wageningen Research, Wageningen Plant Research, Business unit Open Teelten (Stichting Wageningen Research, Wageningen Plant Research, Business unit Open Teelten rapport WPR-780) - 28
Mechanical and thermal weed control techniques are important and commonly used methods in organic plant production systems. These methods gain more and more attention from conventional growers due to among others lower availability of (a number of) herbicides. These methods may have potential (negative) effects on organisms which are present in or make use of agricultural land. This can be either directly through mortality and migration of organisms or indirectly through disruption of the habitat or food source. The aim of this literature study was to research what is known about effects of mechanical and thermal weed control on three groups of organisms, namely 1) soil life such as rainworms and fungi, 2) aboveground soil-dwelling insects and 3) breeding birds and nest success. Mechanical and thermal weed control techniques have a limited negative effect on soil life. Negative effects of both mechanical and thermal weed control on aboveground soil dwelling insects depend on the application timing and the amount and type of biomass that is left behind. The degree of disturbance of the insect population is likely to be larger under warmer conditions and presence of a large amount of (weed) biomass because such conditions stimulate insect activity and abundance. Furthermore, the degree of disturbance increases with a more frequent application of mechanical weed control. Mechanical weed control techniques are destructive for breeding birds and nest success. No information on the effects of thermal weed control techniques on breeding birds or nest success was found. It is important to look at combinations of these weed control methods and other farming practices as integral weed management and to quantify the effects of such management on the three groups of organisms. Within the groups, a subdivision into species or subgroups is necessary in order to properly identify the negative effects on the vulnerable species - threatened or rare species - and to introduce targeted protective measurements. Focus should be on which methods need to be applied in what way, when (timing and conditions) and in what frequency. Development of recognition and protection techniques should also gain more attention in order to prevent loss of organisms which make use of agricultural land. Two examples are nest recognition and caps to protect nests which can both be used to retain the bird population.
Human health risk associated with the management of phosphorus in freshwaters using lanthanum and aluminium
haese, P.C. D'; Douglas, G. ; A., Verhulst ; Neven, E. ; Behets, G.J. ; Vervaet, B.A. ; Finsterle, K. ; Lurling, M.F.L.L.W. - \ 2019
Chemosphere 220 (2019). - ISSN 0045-6535 - p. 286 - 299.
The use of geo-engineering materials to manage phosphorus in lakes has increased in recent years with aluminium and lanthanum based materials being most commonly applied. Hence the potential impact of the use of these compounds on human health is receiving growing interest. This review seeks to understand, evaluate and compare potential unintended consequences on human health and ecotoxicological risks associated with the use of lanthanum- and aluminium-based materials to modify chemical and ecological conditions in water bodies. In addition to their therapeutic use for the reduction of intestinal phosphate absorption in patients with impaired renal function, the phosphate binding capacity of aluminium and lanthanum also led to the development of materials used for water treatment. Although lanthanum and aluminium share physicochemical similarities and have many common applications, their uptake and kinetics within the human body and living organisms importantly differ from each other which is reflected in a different toxicity profile. Whilst a causal role in the development of neurological pathologies, skeletal lesions, hematopoietic disorders and respiratory effects has unequivocally been demonstrated with increased exposure to aluminium, studies until now have failed to find such a clear association after exposure to lanthanum although caution is warranted. Our review indicates that lanthanum and aluminium have a distinctly different profile with respect to their potential effects on human health. Regular monitoring of both aluminium and lanthanum concentrations in lanthanum-/aluminium-treated water by the responsible authorities is recommended to avoid acute accidental or chronic low level accumulation.
Lisa Neven
Verschoor, Jan - \ 2017
High Resolution Model Intercomparison Project (HighResMIP v1.0) for CMIP6
Haarsma, Reindert J. ; Roberts, Malcolm J. ; Vidale, Pier Luigi ; Senior, Catherine A. ; Bellucci, Alessio ; Bao, Qing ; Chang, Ping ; Corti, Susanna ; Fučkar, Neven S. ; Hazeleger, Wilco - \ 2016
Geoscientific Model Development 9 (2016)11. - ISSN 1991-959X - p. 4185 - 4208.

Robust projections and predictions of climate variability and change, particularly at regional scales, rely on the driving processes being represented with fidelity in model simulations. The role of enhanced horizontal resolution in improved process representation in all components of the climate system is of growing interest, particularly as some recent simulations suggest both the possibility of significant changes in large-scale aspects of circulation as well as improvements in small-scale processes and extremes. However, such high-resolution global simulations at climate timescales, with resolutions of at least 50 km in the atmosphere and 0.25° in the ocean, have been performed at relatively few research centres and generally without overall coordination, primarily due to their computational cost. Assessing the robustness of the response of simulated climate to model resolution requires a large multi-model ensemble using a coordinated set of experiments. The Coupled Model Intercomparison Project 6 (CMIP6) is the ideal framework within which to conduct such a study, due to the strong link to models being developed for the CMIP DECK experiments and other model intercomparison projects (MIPs). Increases in high-performance computing (HPC) resources, as well as the revised experimental design for CMIP6, now enable a detailed investigation of the impact of increased resolution up to synoptic weather scales on the simulated mean climate and its variability. The High Resolution Model Intercomparison Project (HighResMIP) presented in this paper applies, for the first time, a multi-model approach to the systematic investigation of the impact of horizontal resolution. A coordinated set of experiments has been designed to assess both a standard and an enhanced horizontal-resolution simulation in the atmosphere and ocean. The set of HighResMIP experiments is divided into three tiers consisting of atmosphere-only and coupled runs and spanning the period 1950-2050, with the possibility of extending to 2100, together with some additional targeted experiments. This paper describes the experimental set-up of HighResMIP, the analysis plan, the connection with the other CMIP6 endorsed MIPs, as well as the DECK and CMIP6 historical simulations. HighResMIP thereby focuses on one of the CMIP6 broad questions, "what are the origins and consequences of systematic model biases?", but we also discuss how it addresses the World Climate Research Program (WCRP) grand challenges.

De rol van gezin en bedrijf bij de migratie van Nederlandse boerenkinderen tussen 1850 en 1940
Mandemakers, K. ; Moenkediek, Bastian ; Kok, Jan - \ 2015
In: Familie en levenskansen in het verleden. / Puschmann, Paul, Paping, Richard, Matthijs, Koen, Leuven, België : Uitgeverij Acco - ISBN 9789462922587 - p. 25 - 56.
Deze bundel presenteert de resultaten van nieuw historisch onderzoek naar de invloed van familie op de levenskansen van individuen. Centraal staat de interactie tussen historische actoren en de demografische en socio-economische kenmerken van de families en huishoudens waarvan zij deel uitmaakten. De auteurs schenken hierbij telkens voldoende aandacht aan de bredere historische context.

Ook in het verleden speelde de gezins- en familiale context een sleutelrol in het dagelijkse leven. Naast opleidingsniveau, beroep en sociale status van beide ouders bepaalden de omvang en de samenstelling van de familie en het gezin in belangrijke mate de levenskansen van de kinderen. Enerzijds konden ouders van grote gezinnen minder geld en aandacht besteden aan elk kind apart, anderzijds konden kinderen uit zulke gezinnen in de loop van hun leven meer en vaker een beroep doen op broers, zussen, neven en nichten.

Dit boek biedt een antwoord op de vraag hoe de gezins- en familiale context zich in het verleden vertaalde in de opleiding, migratietrajecten, partnerkeuze en huwelijkskansen, vruchtbaarheid, gezondheid- en sterfterisico’s en carrièrekansen van kinderen.
Engerling: schone graver in de modder
Alebeek, F.A.N. van - \ 2015
Centre for Soil Ecology
Bodembiodiversiteit is hot. Dat enorme web van organismen is van levensbelang voor een gezonde bodem en duurzame voedselproductie. ‘Voedt het bodemleven’ klinkt het! Dat is allemaal mooi en aardig, zolang je aan de ‘goede’ kant staat. Want die lofzang op de bodembiodiversiteit geldt duidelijk niet, als je per ongeluk Verticillium, Pratylenchus of Melolontha heet. Dan hoor je er opeens niet meer bij. Neem mij nou, de engerling. Mijn naam alleen al zet mij in het verdomhoekje. Terwijl die naam alleen maar ‘kleine worm’ of ‘made’ betekent. Eenmaal volwassen zal ik als meikever veel positiever bekend staan. Zo’n 50 generaties (zeg een mensenleven) geleden zoemden mijn voorouders met miljoenen rond eiken en beukenhagen. Zij waren populair bij de jeugd, als ‘mulders’, vliegend aan een touwtje of brommend in een luciferdoosje. Maar lompe middelen als Lindaan en Parathion hebben mijn familie bijna weggevaagd. Tegenwoordig zijn we in grote delen van Nederland zeldzaam. Natuurlijk, sommige familieleden maken greenkeepers van golfbanen wel eens wanhopig, of betekenen een strop voor boomkwekers met plantgoed op een verkeerde plaats of tijd. Maar zou u mijn gesnor op warme mei-avonden willen missen? En hoe denkt u dat vleermuizen, egels en steenuiltjes hun jongen grootbrengen als mijn familie is uitgeroeid? Heeft u wel eens goed naar mij gekeken en u bijvoorbeeld afgevraagd hoe ik, de hele dag gravend in de modder, steeds zo glanzend schoon tevoorschijn kom? Of hoe ik van donkere wortels en rottende planten kan opgroeien tot een prachtige, witte larve en nog mooiere kever? Doe dat maar eens na! Heeft u mijn neven en nichten al eens goed bekeken? Het rozenkevertje, de Salland- en junikever, de prachtige julikever of mijn imposante oom de neushoornkever? Hoe zou de wereld er zonder ons uitzien? Denk daar nog eens over na, voordat u naar (mijn nachtmerrie:) de Heterorhabditis grijpt.
Mining minimal motif pair sets maximally covering interactions in a protein-protein interaction network
Boyen, P. ; Neven, F. ; Valentim, F.L. ; Dijk, A.D.J. van - \ 2013
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 10 (2013)1. - ISSN 1545-5963 - p. 73 - 86.
interaction sites - high-throughput - binding-sites - prediction - database - hardness
Correlated motif covering (CMC) is the problem of finding a set of motif pairs, i.e., pairs of patterns, in the sequences of proteins from a protein-protein interaction network (PPI-network) that describe the interactions in the network as concisely as possible. In other words, a perfect solution for CMC would be a minimal set of motif pairs that describes the interaction behavior perfectly in the sense that two proteins from the network interact if and only if their sequences match a motif pair in the minimal set. In this paper, we introduce and formally define CMC and show that it is closely related to the red-blue set cover (RBSC) problem and its weighted version (WRBSC)--both well-known NP-hard problems for that there exist several algorithms with known approximation factor guarantees. We prove the hardness of approximation of CMC by providing an approximation factor preserving reduction from RBSC to CMC. We show the existence of a theoretical approximation algorithm for CMC by providing an approximation factor preserving reduction from CMC to WRBSC. We adapt the latter algorithm into a functional heuristic for CMC, called CMC-approx, and experimentally assess its performance and biological relevance. The implementation in Java can be found at >http://bioinformatics.uhasselt.be
Interactome-Wide Prediction of Protein-Protein Binding Sites Reveals Effects of Protein Sequence Variation in Arabidopsis thaliana
Valentim, F.L. ; Neven, F. ; Boyen, P. ; Dijk, A.D.J. van - \ 2012
PLoS ONE 7 (2012)10. - ISSN 1932-6203
interaction networks - hot-spots - conservation - interfaces - database - topless - motifs - growth - roles - gene
The specificity of protein-protein interactions is encoded in those parts of the sequence that compose the binding interface. Therefore, understanding how changes in protein sequence influence interaction specificity, and possibly the phenotype, requires knowing the location of binding sites in those sequences. However, large-scale detection of protein interfaces remains a challenge. Here, we present a sequence- and interactome-based approach to mine interaction motifs from the recently published Arabidopsis thaliana interactome. The resultant proteome-wide predictions are available via www.ab.wur.nl/sliderbio and set the stage for further investigations of protein-protein binding sites. To assess our method, we first show that, by using a priori information calculated from protein sequences, such as evolutionary conservation and residue surface accessibility, we improve the performance of interface prediction compared to using only interactome data. Next, we present evidence for the functional importance of the predicted sites, which are under stronger selective pressure than the rest of protein sequence. We also observe a tendency for compensatory mutations in the binding sites of interacting proteins. Subsequently, we interrogated the interactome data to formulate testable hypotheses for the molecular mechanisms underlying effects of protein sequence mutations. Examples include proteins relevant for various developmental processes. Finally, we observed, by analysing pairs of paralogs, a correlation between functional divergence and sequence divergence in interaction sites. This analysis suggests that large-scale prediction of binding sites can cast light on evolutionary processes that shape protein-protein interaction networks
Integrated visions (part II): Envisioning Sustainable Energy Landscapes
Stremke, S. ; Koh, J. ; Neven, C.T. ; Boekel, A. - \ 2012
European Planning Studies 20 (2012)4. - ISSN 0965-4313 - p. 609 - 626.
landschapsarchitectuur - regionale planning - duurzame energie - hernieuwbare energie - klimaatverandering - zuid-nederland - landscape architecture - regional planning - sustainable energy - renewable energy - climatic change - south netherlands - design
ABSTRACT Climate change and resource depletion are driving the transition to renewable energy sources. Both the supply of renewables and the demand for energy are influenced by the physical environment and therefore concern spatial planning and landscape design. Envisioning the longterm development of alternative energy landscapes – that is sustainable energy landscapes – present spatial planners and landscape architects with new challenges. The first paper of this twopart series discussed several existing approaches to long-term regional planning and landscape design, and presented an alternative, five-step approach for the composition of integrated visions [Stremke, S., Kann, F. Van & Koh, J. (2012) Integrated Visions (part I): Methodological Framework, European Planning Studies, [20(2), pp. 305–320]. This paper illustrates how the fivestep approach was employed to compose a set of integrated visions for the development of sustainable energy landscapes in south of the Netherlands. The proposed five-step approach is then examined with respect to a set of criteria stressed in the planning and design literature.
Betrokkenheid van Nederlandse bedrijven bij transnationale grondverwerving en pacht : een eerste verkenning
Meijerink, G.W. ; Kamphuis, B.M. - \ 2012
Den Haag : LEI Wageningen UR (LEI Nota ) - 62
particuliere sector - buitenlandse investering - oppervlakte (areaal) - landbouwgrond - grondmarkten - particuliere investering - private sector - foreign investment - acreage - agricultural land - land markets - private investment
Vooral sinds de scherpe stijging van de voedselprijzen in 2007/2008 is er een sterk toegenomen belangstelling van landen en bedrijven om grond in andere landen in gebruik te nemen voor de productie van landbouwgewassen, zowel voor voedselgewassen als voor biobrandstoffen. Het gaat om zeer grote oppervlaktes cultuurgrond, met soms vergaande consequenties voor de plaatselijke bevolking. Naast China en de olierijke maar ‘voedselarme’ landen in het Midden Oosten zijn ook Europese bedrijven actief op dat terrein. Het is onduidelijk in hoeverre Nederlandse bedrijven bij dit fenomeen zijn betrokken. Nederland heeft een lange geschiedenis ten aanzien van het gebruik van landbouwgrond in het buitenland, denk aan de plantages in de Nederlands koloniën, de grootscheepse emigratie na de Tweede Wereldoorlog maar ook de (neven)vestigingen van landbouwbedrijven in Oost-Europa en groente en bloementeelt in Oost-Afrika. Het Ministerie van Economische zaken, Landbouw en Innovatie heeft het LEI gevraagd een verkennend onderzoek uit te voeren naar het areaal grond dat Nederlandse bedrijven in bezit of gebruik hebben in het buitenland en de omvang van de Nederlandse investeringen in grond in de wereld.
De SREX-methode
Stremke, S. ; Neven, C.T. ; Boekel, A. - \ 2011
In: Synergie tussen Regionale Planning en Exergie / van den Dobbelsteen, A., Broersma, S., Fremouw, M., Delft : Publikatieburo Bouwkunde - ISBN 9789052693996 - p. 107 - 112.
Dit boek bevat de resultaten van het 5-jarige EOS-LT-onderzoek SREX(2006 tot 2011). SREX staat voor Synergie tussen Regionale Planning en Exergie. Het SREX-onderzoek is gefinancierd is door het Ministerie van Economische Zaken, Landbouw en Innovatie vanuitAgentschap NL in het kader van het EOS programma, regeling Energie Onderzoek Subsidie: lange termijn. projectnummer: EOSLT03029 Meer informatie over het SREX-project is te vinden op www.exergieplanning.nl. Hier kunt u ook terecht voor het bestellen vanextra exemplaren van dit boek.
Sturen in melkproductie en melksamenstelling : verkennende studie naar de effecten van Clinoptiloliet
Verwer, C.M. ; Eekeren, N.J.M. van - \ 2011
[S.l.] : Louis Bolk Instituut (Biogeit rapport / Louis Bolk Instituut 23) - 25 p.
geitenhouderij - clinoptiloliet - voedertoevoegingen - melkproductie - melksamenstelling - biologische landbouw - goat keeping - clinoptilolite - feed additives - milk production - milk composition - organic farming
In dit Biogeit rapport wordt een praktijkonderzoek beschreven naar de effecten van Clinoptiloliet op de melkproductie en melksamenstelling van geiten. Voor het onderzoek zijn 50 nieuwmelkte geiten gebruikt. De geiten werden verdeeld over 2 groepen; een controle-groep en een Clinoptiloliet-groep. Clinoptiloliet werd verstrekt nadat alle dieren minimaal 6 weken in lactatie waren. Gedurende 6 maanden zijn om de 6 weken melkmonsters genomen om per individu de melkproductie, vetgehalte en eiwitgehalte te bepalen. Bij de start van het onderzoek en aan het einde van het onderzoek is ook het celgetal per geit bepaald. Clinoptiloliet had geen (neven)effect op de melkproductie en het eiwitgehalte van de melk. Clinoptiloliet had een positief verhogend effect op het vetgehalte van de melk met ongeveer 0.1-0.4 %.
Beyond uncertainties: how to envision long-term transformation of regions?
Stremke, S. ; Neven, C.T. ; Boekel, A. - \ 2011
In: Peer Reviewed Proceedings of the 12th annual International Conference on Information Technology in landscape Architecture: Digital Landscape Architecture 2011, Dessau and Bernburg, 26-28 May 2011. - Berlin : Wichmann Verlag - p. 187 - 194.
SLIDER: A Generic Metaheuristic for the Discovery of Correlated Motifs in Protein-Protein Interaction Networks
Boyen, P. ; Dyck, D. van; Neven, F. ; Ham, R.C.H.J. van; Dijk, A.D.J. van - \ 2011
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 8 (2011)5. - ISSN 1545-5963 - p. 1344 - 1357.
sequences - scale - pairs
Correlated motif mining (CMM) is the problem of finding overrepresented pairs of patterns, called motifs, in sequences of interacting proteins. Algorithmic solutions for CMM thereby provide a computational method for predicting binding sites for protein interaction. In this paper, we adopt a motif-driven approach where the support of candidate motif pairs is evaluated in the network. We experimentally establish the superiority of the Chi-square-based support measure over other support measures. Furthermore, we obtain that CMM is an NP-hard problem for a large class of support measures (including Chi-square) and reformulate the search for correlated motifs as a combinatorial optimization problem. We then present the generic metaheuristic SLIDER which uses steepest ascent with a neighborhood function based on sliding motifs and employs the Chi-square-based support measure. We show that SLIDER outperforms existing motif-driven CMM methods and scales to large protein-protein interaction networks. The SLIDER-implementation and the data used in the experiments are available on http://bioinformatics.uhasselt.be.
Zoektocht naar nationale beleidsruimte in de EU-richtlijnen voor het milieu- en natuurbeleid : een vergelijking van de implementatie van de Vogel- en Habitatrichtlijn, de Kaderrichtlijn Water en de Nitraatrichtlijn in Nederland, Engeland en Noordrijn-Westfalen
Boer, S. de; Bogaardt, M.J. ; Kersten, P.H. ; Kistenkas, F.H. ; Neven, M.G.G. ; Zouwen, M.W. van der - \ 2010
Wageningen : Wettelijke Onderzoekstaken Natuur & Milieu (WOt-werkdocument 174) - 194
natuurbescherming - milieubeleid - richtlijnen (directives) - nitraat - projectimplementatie - toepassing - nederland - engeland - duitsland - noordrijn-westfalen - natuurbeleid - habitatrichtlijn - kaderrichtlijn water - nature conservation - environmental policy - directives - nitrate - project implementation - application - netherlands - england - germany - north rhine-westphalia - nature conservation policy - habitats directive - water framework directive
In dit rapport is nauwkeurig uitgezocht hoe het proces van implementatie van drie EU-richtlijnen - de Vogel- en Habitatrichtlijn, de Nitraatrichtlijn en de Kaderrichtlijn Water - is verlopen in twee landen - Nederland en Engeland - en in een Duitse deelstaat - Noordrijn-Westfalen. Doel is te analyseren hoe nationale beleidsruimte werd gezocht en hoeveel ruimte werd gevonden. Het onderzoek beschrijft welke inspanningen men zich daarbij heeft getroost, welke strategieën en instrumenten zijn gehanteerd en tot welk resultaat dat uiteindelijk heeft geleid. Dit is gedaan aan de hand van officiële documenten, uitspraken van het Europese Hof van Justitie en aangevuld met een groot aantal interviews met de betrokkenen in de drie landen.
SLIDER: Mining correlated motifs in protein-protein interaction networks
Boyen, P. ; Dijk, A.D.J. van; Ham, R.C.H.J. van; Neven, F. - \ 2009
Abstract—Correlated motif mining (CMM) is the problem to find overrepresented pairs of patterns, called motif pairs, in interacting protein sequences. Algorithmic solutions for CMM thereby provide a computational method for predicting binding sites for protein interaction. In this paper, we adopt a motif-driven approach where the support of candidate motif pairs is evaluated in the network. We experimentally establish the superiority of the Chi-square-based support measure over other support measures. Furthermore, we obtain that CMM is an NP-hard problem for a large class of support measures (including Chi-square) and reformulate the search for correlated motifs as a combinatorial optimization problem. We then present the method SLIDER which uses local search with a neighborhood function based on sliding motifs and employs the Chi-square-based support measure. We show that SLIDER outperforms existing motif-driven CMM methods and scales to large protein-protein interaction networks.
Wonen aan de rand van het landschap : van stadsrand naar landschap als ontwerpopgave
Neven, C.T. ; Sauter, M. ; Haan, H.J. de - \ 2008
Wageningen/Borne : Wageningen Universiteit, Leerstoelgroep Sociaal-ruimtelijke Analyse/Programmabureau De Groene Poort - 133
Bast- en bladvlekkenziekte in Tilia : middelentoetsting en het ontwikkelen van een waarschuwingsysteem
Sluis, B.J. van der; Kuik, A.J. van - \ 2007
Lisse : PPO Bloembollen en Bomen - 28
bladvlekkenziekte - cercospora - tilia - boomteelt - plantenziektebestrijding - straatbomen - leaf spotting - arboriculture - plant disease control - street trees
In het project ‘Geïntegreerde gewasbescherming in de boomteelt’ bleek bast- en bladvlekkenziekte in Tilia, veroorzaakt door de schimmel Cercospora microsora, één van de belangrijke knelpunten in de teelt van laanbomen. Ook in het recent opgestarte vervolgproject ‘Telen Met Toekomst’ werd door de laanbomentelersgroep, bast- en bladvlekken als een belangrijk knelpunt aangemerkt. Schade als gevolg van bast- en bladvlekken wordt op verschillende manieren toegebracht. Namelijk een vermindering van de groei door aantasting van de bladeren, het afsterven van dunnere takken en bij jonge bomen het afsterven van een deel van de boom en beschadiging van de bast waardoor bomen pas later leverbaar zijn. Doordat de boom door een aantasting verzwakt kunnen gemakkelijk secundaire aantastingen zoals het meniezwammetje optreden. De bestrijding van de aantasting vormt in toenemende mate een probleem. Het bestrijdingsmiddelenpakket is sterk uitgedund. Daconil (chloorthalonil) en Maneb zijn wel toegelaten, maar voor een goede werking moeten deze middelen vroegtijdig en frequent worden ingezet. Folicur (tebuconazool) wordt in boomteeltgewassen ingezet tegen roest, maar heeft ook een (neven)werking tegen bast- en bladvlekkenziekte. Van de twee recent toegelaten meeldauw bestrijdingsmiddelen Ortiva (met de werkzame stof azoxystrobine) en Flint (trifloxystrobine) is bekend dat ze ook een nevenwerking hebben tegen bladvlekkenziekten. Met de genoemde middelen is nog weinig ervaring in de teelt van Tilia. Genoemde nieuwe middelen kennen een relatief groot risico op resistentieontwikkeling en mogelijk gewasschade. Om meer grip te krijgen op een effectieve inzet (op het juiste moment het juiste middel) van gewasbeschermingsmiddelen is meer kennis nodig van de omstandigheden die zorgen voor een verhoogde infectiekans. Een hulpmiddel voor het bepalen van het juiste spuittijdstip is een advies- of waarschuwingsysteem. Het doel van dit onderzoek is om de toetsing van de effectiviteit van beschikbare gewasbeschermingsmiddelen tegen blad- en bastvlekkenziekte in Tilia onder praktijkomstandigheden te bepalen. En het ontwikkelen en het implementeren van een waarschuwingsysteem als hulpmiddel bij de bestrijding van bast- en bladvlekkenziekte. De effectieve middelen kunnen daardoor efficiënter en effectiever worden ingezet.
Natura 2000 in het buitenland: feiten en fabels
Kistenkas, F.H. ; Neven, M.G.G. - \ 2007
Vakblad Natuur Bos Landschap 4 (2007)5. - ISSN 1572-7610 - p. 10 - 11.
natuurbescherming - eu regelingen - habitats - internationale vergelijkingen - natura 2000 - nature conservation - eu regulations - international comparisons
LNV wilde graag weten hoe men in het buitenland omgaat met het implementatieproces van het Natura 2000-beleid. Uit Alterra-onderzoek bleek dat Nederland niet echt uit de pas loopt qua implementatiepraktijk, interpretatie van kernbegrippen en het imago van de Vogel- en Habitatrichtlijn. Nederland neemt echter een aparte positie in qua integratie van het natuurbeleid met milieubeleid en ruimtelijke ordening.
Check title to add to marked list
<< previous | next >>

Show 20 50 100 records per page

 
Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.