Staff Publications

Staff Publications

  • external user (warningwarning)
  • Log in as
  • language uk
  • About

    'Staff publications' is the digital repository of Wageningen University & Research

    'Staff publications' contains references to publications authored by Wageningen University staff from 1976 onward.

    Publications authored by the staff of the Research Institutes are available from 1995 onwards.

    Full text documents are added when available. The database is updated daily and currently holds about 240,000 items, of which 72,000 in open access.

    We have a manual that explains all the features 

    Records 21 - 40 / 247

    • help
    • print

      Print search results

    • export

      Export search results

    Check title to add to marked list
    Kwaliteit en ruimtelijke data in relatie tot het LPIS : kwaliteitsaspecten rondom het beheer van ruimtelijk data
    Meijer, M. ; Vullings, L.A.E. - \ 2012
    Wageningen : Alterra (Alterra-rapport 2285) - 142
    verkaveling - identificatie - registratie - databanken - gemeenschappelijk landbouwbeleid - kwaliteitsnormen - land parcelling - identification - registration - databases - cap - quality standards
    Elke lidstaat is verplicht om een Geïntegreerd Beheers- en Controlesysteem (GBCS) op te zetten. Een belangrijk onderdeel van dit GBCS is een systeem voor de identificatie van percelen landbouwgrond, ook wel perceelsregister of LPIS (Land Parcel Identification System) genoemd. In 2010 is door de EU een nieuw raamwerk opgezet om die kwaliteit van het perceelsregister te toetsen. Dit raamwerk wordt ook wel LPIS QAF genoemd. De elementen die deel uitmaken van dit kwaliteitsraamwerk komen voor een groot deel overeen met al bestaande kwaliteitsraamwerken zoals ISO en NEN. De uitkomsten van het LPIS QAF geven over het algemeen een goed beeld van de kwaliteit van het perceelsregister, zij het dat een aantal elementen sterk context afhankelijk zijn.
    Starch identification supported by expert system determinator
    Raamsdonk, L.W.D. van; Hekman, W.E. ; Pinckaers, V.G.Z. ; Vliege, J.J.M. ; Ruth, S.M. van - \ 2012
    zetmeel - gemodificeerd zetmeel - identificatie - voedselanalyse - starch - modified starches - identification - food analysis
    Identification of starch as ingredient is important for a range of purposes. The Starch Identification System as implemented in the platform Determinator is helpful in this respect since it allows consistent identification of starch in a large variety of products.
    Voersysteem voor het individueel voeren van vleesvarkens: 'Voeren op maat' : de ontwikkeling van een nieuw voersysteem binnen project 'Vitale vleesvarkens'
    Dirx-Kuijken, N.C.P.M.M. ; Peet-Schwering, C.M.C. van der; Hoofs, A.I.J. - \ 2012
    Lelystad : Wageningen UR Livestock Research (Rapport / Wageningen UR Livestock Research 600) - 18
    varkenshouderij - vleesproductie - varkensvoeding - voedersystemen - individuele voeding - identificatie - individuele kenmerken - pig farming - meat production - pig feeding - feeding systems - individual feeding - identification - individual characteristics
    Om het resultaat van vleesvarkens te verhogen, is een ontwikkeltraject in gang gezet voor het voersysteem 'Voeren op maat'. Hiermee kunnen vleesvarkens individueel gevoerd worden op basis van individuele dierherkenning. In dit ontwikkeltraject is het systeem beoordeeld op de vooraf gestelde eisen.
    Systematics of the blackfly subgenus Trichodagmia Enderlein (Diptera: Simuliidae: Simulium) in the new world
    Hernández Triana, L.M. - \ 2011
    Wageningen University. Promotor(en): Marc Sosef; R.J. Post. - s.n. - ISBN 9789085858652 - 536
    simulium - taxonomy - identification - keys - nearctic region - simulium - taxonomie - identificatie - determinatietabellen - nearctisch gebied

    Systematics of the blackfly subgenus Trichodagmia ENDERLEIN (Diptera: Simuliidae:

    Simulium) in the New World

    The systematics of the New World subgenus Trichodagmia has been reassessed by employing an

    integrated taxonomic approach based upon revisionary taxonomy, phylogenetic (cladistics) analysis, and

    DNA barcoding. This subgenus included several species of great medical importance, which are all

    morphologically very similar. The history of the taxonomy and classification of the subgenus

    Trichodagmia has been put into context with other subgenera within New World Simuliidae, while

    descriptions and keys to the identification of species in this subgenus are also given.

    The subgenus Obuchovia is here considered a new junior synonym of Trichodagmia, and all its

    constituents’ species are now placed in the ALBELLUM species group to represent a Palaearctic

    element within this subgenus. Three new junior synonymies are here proposed: Simulium chiriquiense

    FIELD is a synonym of S. ethelae DALMAT n. syn.; S. biuxinisa COSCARÓN & IBÁÑEZ-BERNAL is a

    synonym of S. paynei VARGAS n. syn.; and S. keenani FIELD is a synonym of S. earlei VARGAS, MARTÍNEZ

    PALÁCIOS &DÍAZ NÁJERA n. syn. A neotype is designated for S. lahillei (PATERSON & SHANNON) and a

    lectotype for S. pulverulentum KNAB.1 Simulium falculatum ENDERLEIN is transferred from the

    TARSATUM species group of to the CANADENSE species group based on the morphology of the

    female genitalia. Two species, S. rivasi RAMÍREZ PÉREZ and S. oviedoi RAMÍREZ PÉREZ, are transferred

    from the TARSATUM species group to the subgenus Psilopelmia based on the morphology of the male

    gonostyle and the ventral plate. Keys to separate all species groups and species based on the adults,

    pupae and larvae are also provided.

    The phylogeny and classification of the subgenus Trichodagmia is delineated using a cladistic

    analysis of 63 taxa based on males, females, pupae and larvae, including two species belonging to the

    subgenus Aspathia and two species of the subgenus Simulium s.str. that served as outgroups. Analysis of

    the original full data set [67 taxa and 67 characters] with multistate characters treated as unordered

    under equal weights led to poorly resolved trees, with many polytomies within TARSATUM [= old

    subgenus Hemicnetha] and CANADENSE [= old subgenus Hearlea]. Nonetheless, the ALBELLUM [=

    old subgenus Obuchovia] and PICTIPES [= old subgenus Shewellomyia] species groups, and some clades

    within the CANADENSE species group were well supported. In the most parsimonious cladograms,

    the position of S. falculatum was problematic as it was placed basal to Trichodagmia. The position of S.

    jeteri, albeit within the ORBITALE [= old subgenera Trichodagmia + Thyrsopelma of MIRANDA-ESQUIVEL

    & COSCARÓN, 2001] clade, was also poorly resolved. This was certainly due to the numerous missing

    data in these two taxa. Therefore, they were removed from the data set together with other taxa in

    which three life stages (> 70% of characters) were missing (e.g. S. paracarolinae and S. tarsale). A second

    analysis was then performed with 63 taxa and 67 characters. In this analysis, the Strict Consensus Tree

    was better resolved and certain clades within the expanded concept of Trichodagmia (sensu SHELLEY et al.,

    2010) were recovered as monophyletic with high support values. The ALBELLUM species group is

    monophyletic in a sister-group relationship with the other species groups in Trichodagmia (sensu SHELLEY

    et al., 2010). The ORBITALE species group clade was recovered as monophyletic by a unique

    combination of seven characters with 89% bootstrap support. In this clade, all species close to S.

    guianense s.l. were better diagnosed by a combination of four characters, one of which (male ventral plate

    with a globular median process) was unique to this group. The position of S. hirtipupa is better resolved

    in the latter clade by the presence of black spiniform setae in the frontoclypeus and thorax of the pupa.

    In contrast, the TARSATUM and CANADENSE species groups were diagnosed by only four

    and five characters, respectively. Within the CANADENSE species group only species with larvae

    having sclerotized plates in the posterior region of the abdomen were well resolved. Species in the

    TARSATUM group were homoplastic. The PICTIPES group is only diagnosed by homoplasies, but the

    combination of these characters is unique to this clade (polythetic taxon). In general, this study supports

    some of the taxonomic changes proposed in SHELLEY et al. (2010), in which the subgeneric-names

    Hearlea, Hemicnetha, Shewellomyia, Trichodagmia + Thyrsopelma (sensu MIRANDA-ESQUIVEL & COSCARÓN,

    502

    2001) are treated as species groups within the subgenus Trichodagmia. Moreover, this study also supports

    the proposal of Obuchovia as a junior synonym within the clade Trichodagmia to represent the

    ALBELLUM species group.

    The utility of the COI DNA barcoding methodology for identification of species in the subgenus

    Trichodagmia and related taxa has been tested. In total, 24 morphospecies within the current expanded

    morphological concept of Trichodagmia were analyzed. In addition, three species of the subgenus

    Aspathia and 10 species of the subgenus Simulium s.str. were also included in the analysis because of their

    putative phylogenetic relationship with Trichodagmia. Within the barcoding neighbour-joining tree, most

    of the specimens were grouped together according to morpho-taxon (species groups and species).

    Mean genetic distance amongst groups (morphospecies) averaged 11.2% (ranged 2.8-19.5%), whereas

    intraspecific genetic divergence within morphologically distinct species averaged 0.5% (range 0-1.3%).

    In known species complexes, maximum values of genetic divergence (3.28-3.79%) indicate the probable

    presence of cryptic diversity. DNA barcoding achieved nearly 100% success in identifying all specimens

    of the subgenus Trichodagmia and related taxa.

    The existence of well defined groups within S. piperi, S. duodenicornium, S. canadense and S. rostratum

    highlighted the possible presence of species complexes in these taxa. In addition, the suspected

    presence of a sibling species in S. paynei and S. tarsatum among populations of Belize, Costa Rica, and

    the USA is confirmed. The use of shorter barcodes (midi and minibarcodes) from specimens held in

    collections was problematic with regards to the DNA quality and PCR success. However, in the cases

    that a readable sequence was obtained, they were sufficient for reliable species identification. With

    regards to the different extraction and preservation techniques tested, larvae preserved in diluted

    Carnoy’s (10% acetic acid) provided full DNA barcodes. Furthermore, legs added directly to the PCR

    mix from freshly collected individuals provided full length barcodes sequences. However, specimens of

    more than 10 years old did not yield good PCR products. In short, I conclude that DNA barcoding in

    combination with a morphological benchwork platform is an effective approach for identification and

    delineation of species in the subgenus Trichodagmia, and the discovery of hidden diversity in this taxon. 

    Determinator datamodel Jacobskruiskruid, versie 3.0 NL
    RIKILT, - \ 2011
    RIKILT
    senecio jacobaea - ruwvoer (forage) - giftige planten - senecio - modellen - identificatie - senecio jacobaea - forage - poisonous plants - senecio - models - identification
    Het voorkomen en zeker de uitbreiding in areaal van jacobskruiskruid (Senecio jacobaea, of bekend onder de nieuwere naam Jacobaea vulgaris) is een bedreiging voor de veestapel in Nederland. Het is gewenst om in weilanden en bij de productie en verwerking van ruwvoeder tijdig risico’s in te schatten. Een extra factor hierbij is dat niet alleen jacobskruiskruid, maar ook andere soorten van het geslacht kruiskruid dezelfde giftige stoffen bevatten. Met name de soorten klein kruiskruid en bezemkruiskruid hebben een uitgebreide verspreiding in Nederland of komen in toenemende mate voor, maar worden niet altijd als risicofactor herkend. Het programma Determinator in combinatie met het datamodel Jacobskruiskruid is bedoeld om gebruikers, weg- en terreinbeheerders en andere betrokkenen in de productieketen van ruwvoeder (met name grasproducten) te ondersteunen bij het herkennen van kruiskruid, en de kruiskruidsoorten te onderscheiden van andere geelbloeiende planten. Door een juiste herkenning kan een verantwoorde keuze gemaakt worden om partijen gras of andere ruwe producten te gebruiken als ruwvoeder of op andere wijze af te voeren en te gebruiken.
    Report of the Workshop on the identification of clupeoid, flatfish, gadoids and other fish larvae (WKIDFL)
    Imares, - \ 2011
    IJmuiden : IMARES (ICES WKIDFL report 2011)
    conferenties - larven - vis - dieridentificatiesystemen - dieridentificatie - identificatie - overeenkomsten - pleuronectiformes - conferences - larvae - fish - animal identification systems - animal identification - identification - agreements - pleuronectiformes
    The Workshop on the Identification of clupeoid, flatfish, gadoid and other fish larvae (WKIDFL) met from 5 to 9 September 2011 in IJmuiden, The Netherlands, to calibrate fish larvae identification. The meeting was chaired by Cindy van Damme, The Neth-erlands, and Matthias Kloppmann, Germany. In total 17 persons representing 10 in-stitutes from 8 countries participated in the workshop. The majority of the time at the workshop was spent identifying fish larvae. The re-sults promoted discussion and highlighted specific problem areas. These discussions led to the further development of standard keys and larval identification characteris-tic tables.
    Focus op landschap, Herfotografie als instrument voor landschapsmonitoring
    Kruit, Jeroen ; Veer, P.M. - \ 2011
    landscape - identification - photography - registration
    Emissieregistratie van landbouwbedrijven : verbeteringen met behulp van het Geografisch Informatiesysteem Agrarische Bedrijven
    Os, J. van; Gies, T.J.A. ; Naeff, H.S.D. ; Jeurissen, L.J.J. - \ 2011
    Wageningen : Wettelijke Onderzoekstaken Natuur & Milieu (WOt-werkdocument 275) - 72
    dierhouderij - statistische gegevens - landbouwstatistieken - dierlijke meststoffen - ammoniakemissie - identificatie - registratie - regio's - animal husbandry - statistical data - agricultural statistics - animal manures - ammonia emission - identification - registration - regions
    Voor het berekenen van emissie door de Emissieregistratie in Nederland werd tot nu toe gebruik gemaakt van gegevens uit de Landbouwtelling. Hierin wordt jaarlijks per bedrijf opgevraagd hoeveel dieren er aanwezig zijn. Sommige bedrijven houden echter een deel van het vee op nevenvestigingen. Via diertellingen vanuit de Identificatie en Registratie van landbouwhuisdieren zijn de nevenvestigingen gelokaliseerd en gekoppeld aan de hoofdvestigingen. Hiermee kunnen de dieren van de landbouwtelling aan de juiste locatie gekoppeld worden, waardoor de Emissieregistratie tot een betere ruimtelijke verdeling van bijvoorbeeld de ammoniakuitstoot uit de veehouderijbedrijven kan komen. Deze herverdeling van dieren is uitgevoerd met de landbouwtelling van 2009, waarbij een koppeling is gemaakt met de staltypen van 2008.
    Barcode van DNA. Democratisering van de taxonomie door digitaal identificatiesysteem
    Bakker, F.T. - \ 2011
    Kunst en Wetenschap 2011 (2011)1. - ISSN 0927-3506 - p. 15 - 16.
    taxonomie - biodiversiteit - genexpressieanalyse - dna - genoomannotatie - identificatie - taxonomy - biodiversity - genomics - genome annotation - identification
    Het herkennen van biologische soorten aan de hand van een gestandaardiseerde DNA-barcode heeft de laatste tijd een enorme vlucht genomen. Gedreven door aan de ene kant de biodiversiteitscrises en de mogelijke global change, en aan de andere kant zowel razendsnelle technologische vooruitgang als ook het vooruitzicht dat niet genoeg klassieke taxonomen worden opgeleid voor de nabije toekomst, lijkt DNA-barcoding zich een strategische plek te veroveren op huidige, al dan niet toegepaste, biodiversiteitsonderzoeksagenda’s. Maar er is meer en er blijven bovendien nog genoeg vragen over.
    Grip op virussen
    Vlugt, R.A.A. van der; Verbeek, M. ; Roenhorst, A. ; Botermans, M. ; Kock, M.J.D. de; Schadewijk, T. van; Miglino, R. ; Kormelink, R. ; Lent, J.W.M. van - \ 2011
    Gewasbescherming 42 (2011)2. - ISSN 0166-6495 - p. 62 - 65.
    virologie - plantenvirussen - detectie - identificatie - databanken - viroïden - epidemiologie - phytoplasma - virology - plant viruses - detection - identification - databases - viroids - epidemiology - phytoplasma
    Aan het begin van het FES-project ‘Versterking infrastructuur plantgezondheid' zijn de belangrijkste knelpunten op plantenvirologisch gebied in Nederland geïnventariseerd. Criteria hierbij waren vooral fytosanitaire status, economisch belang en de behoefte aan betrouwbare detectie- en identificatiemethoden. Op basis hiervan is een prioriteitenlijst opgesteld van de (gereguleerde) virussen uit de volgende virusgroepen: Potyvirussen, Nepovirussen, Tospovirussen en Potexvirussen. Daarnaast werd zo’n lijst opgesteld voor viroïden en fytoplasma’s. Aan de prioriteitenlijst werden toegevoegd: Pospiviroïden en Fytoplasma’s. De verkregen gegevens werden opgenomen in de Q-bank.
    Taxonomie van plant-pathogene schimmels als basis voor identificatie en detectie: resultaten van het Uitvoeringsconsortium Schimmels
    Zwiers, L.H. ; Aveskamp, M.M. ; Bonants, P.J.M. ; Brouwer, H. ; Cock, A. de; Damm, U. ; Gruyter, H. de; Meekes, E. ; Verstappen, E.C.P. ; Woudenberg, J. - \ 2011
    Gewasbescherming 43 (2011)2. - ISSN 0166-6495 - p. 57 - 62.
    mycologie - schimmels - plantenziekteverwekkende schimmels - databanken - colletotrichum - phoma - phytophthora - identificatie - mycology - fungi - plant pathogenic fungi - databases - colletotrichum - phoma - phytophthora - identification
    Plant-pathogene schimmels worden traditioneel geïdentificeerd op basis van morfologische karakteristieken. Dit is over het algemeen tijdrovend, veel expertise en leidt vaak tot misidentificatie. Het doel van het werk uitgevoerd door het Uitvoeringsconsortium Schimmels was dan ook gericht op de verbetering van detectie- en identificatietechnieken van plant pathogene schimmels met de nadruk op quarantaineorganismen. Op grond van het economische, wetenschappelijke, en ecologische belang, de aanwezigheid van Q-organismen, en de wetenschappelijke startpositie binnen Nederland is in eerste instantie de keuze gevallen op de geslachten Colletotrichum, Phoma, en Phytophthora. De gegenereerde dat zijn opgenomen in de Q-bank.
    Koudmerken : actualisatie van het gebruik van koudmerken op Nederlandse melkveebedrijven
    Hopster, H. ; Zijlstra, J.T. - \ 2011
    Leeuwarden : Hogeschool Van Hall Larenstein, Lectoraat Welzijn van Dieren - 15
    dierhouderij - melkveehouderij - identificatie - merken - brandmerken - bevriezing - dierenwelzijn - diergezondheid - animal husbandry - dairy farming - identification - marking - branding - frostbite - animal welfare - animal health
    Voor identificatie van runderen zijn wettelijk 2 ingrepen toegestaan. De 2 wettelijk verplichte gele oornummers laten daarmee geen ruimte voor het aanbrengen van een koudmerk. Op dit moment heeft de rundveesector van het ministerie van Economische zaken, Landbouw en Innovatie een ontheffing van dit verbod op het gebruik van koudmerken als derde ingreep. Deze ontheffing loopt in juni 2011 af. Dit rapport biedt inzicht in de acute, de subacute en de chronische effecten van koudmerken op het welzijn van de koe. Daarnaast is bij een aselecte en representatieve groep van 285 melkveehouders een telefonische enquête uitgevoerd naar het gebruik van koudmerken, gekoppeld aan bedrijfskenmerken. Koudmerken als ingreep brengt bij runderen een acute stressrespons teweeg. Uit de fysiologische- en gedragsreacties kan echter niet worden afgeleid of er ernstige schade aan het welzijn en de gezondheid van runderen wordt toegebracht.
    RFID biedt ook perspectief voor laanbomen
    Baltissen, A.H.M.C. ; Sluis, B.J. van der - \ 2011
    De Boomkwekerij 24 (2011)2. - ISSN 0923-2443 - p. 12 - 13.
    elektrotechniek - rfid - elektronica - identificatie - boomkwekerijen - straatbomen - electrical engineering - rfid - electronics - identification - forest nurseries - street trees
    Binnenkort zijn CC-karren elektronisch te registreren met RFID (Radio Frequency Identification) en deze technologie biedt ook mogelijkheden voor de laanbomenketen. Uit onderzoek door PPO blijkt dat zowel de kweker als de klant voordeel kan behalen met RFID. Er zijn echter nog veel praktische vragen te beantwoorden.
    Some mossmites new for the Netherlands (Acari: Oribatida)
    Siepel, H. ; Dimmers, W.J. - \ 2010
    Nederlandse Faunistische Mededelingen 34 (2010). - ISSN 0169-2453 - p. 41 - 44.
    mijten - oribatida - identificatie - soorten - inventarisaties - mites - oribatida - identification - species - inventories
    Bestudering van materiaal uit enkele Alterra projecten leverde negen soorten mosmijten op die nog niet waren opgenomen in de recent gepubliceerde Nederlandse naamlijst. Het totaal aantal soorten voor Nederland komt hiermee op 327.
    Anthericaceae, Burmanniaceae, Colchiceae, Crassulaceae, Dipterocarpaceae, Lemnaceae, Pittosporaceae, Rosaceae, Ternstroemiaceae, Thismiaceae, Triuridaceae
    Sosef, M.S.M. ; Florence, J. ; Ngok Banak, L. ; Bourobou Bourobou, H.P. - \ 2010
    Weikersheim [etc.] : Margraf [etc.] (Flore du Gabon 41) - ISBN 9783823615972 - 75
    planten - taxonomie - identificatie - determinatietabellen - gabon - plants - taxonomy - identification - keys - gabon
    Apodanthaceae, Balanophoraceae, Campanulaceae, Caricaceae, Hyacinthaceae, Hydroleaceae, Lobeliaceae, Menyanthaceae, Nymphaeaceae, Pontederiaceae, Typhaceae
    Sosef, M.S.M. ; Florence, J. ; Ngok Banak, L. ; Bourobou Bourobou, H.P. - \ 2010
    Weikersheim [etc.] : Margraf [etc.] (Flore du Gabon 40) - ISBN 9783823615835 - 73
    planten - taxonomie - identificatie - determinatietabellen - gabon - plants - taxonomy - identification - keys - gabon
    Aardkastanje, onopvallend en te weinig om te eten
    Spruijt, T. - \ 2010
    Nature Today 2010 (2010)05-07.
    bunium bulbocastanum - apiaceae - wilde planten - karakteristieken - identificatie - duinen - noord-holland - bunium bulbocastanum - apiaceae - wild plants - characteristics - identification - dunes - noord-holland
    Hij staat vanaf half juni volop in bloei, maar wordt door weinigen gezien. Hoewel een zoektocht op Google anders doet vermoeden, wordt hij niet meer gegeten. De Aardkastanje is daarvoor te onopvallend en te zeldzaam in Nederland. Toch is het een bijzondere schermbloem.
    Multiplex-detectie van Phytophthora: "padlock-based Universal Multiplex detection Array" (pUMA)
    Gaszczyk, K. ; Mendes, O. ; Verstappen, E.C.P. ; Bonants, P.J.M. ; Schoen, C.D. - \ 2010
    Gewasbescherming 41 (2010)3. - ISSN 0166-6495 - p. 145 - 146.
    phytophthora - detectie - identificatie - biochemische technieken - nucleotidenvolgordes - polymerase-kettingreactie - phytophthora - detection - identification - biochemical techniques - nucleotide sequences - polymerase chain reaction
    Plant Research International heeft een diagnostische methode ontwikkeld die toe te passen is 'in planta', en ook de meest recent beschreven (quarantaine-) soorten omvat. De methode omvat de ontwikkeling van een generieke Phytophthora-methode gevolgd door een Phytophthora-identificatie.
    Identification and epidemiology of pospiviroids
    Verhoeven, J.Th.J. - \ 2010
    Wageningen University. Promotor(en): Just Vlak, co-promotor(en): J.W. Roenhorst. - [S.l. : S.n. - ISBN 9789085856238 - 136
    solanum tuberosum - aardappelen - solanum lycopersicum - tomaten - viroïden - aardappelspindelknolviroïde - detectie - identificatie - methodologie - epidemiologie - siergewassen - waardplanten - moleculaire detectie - solanum tuberosum - potatoes - solanum lycopersicum - tomatoes - viroids - potato spindle tuber viroid - detection - identification - methodology - epidemiology - ornamental crops - host plants - molecular detection
    Pospiviroids can cause serious diseases in potato and tomato. Since 1988 viroid infections have occasionally been detected in tomato crops in the Netherlands. To identify these viroid isolates unequivocally, two novel universal primer sets were designed for ‘Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction’ (RT-PCR), a sensitive technique enabling detection and identification of pospiviroids. Sequence analyses identified the viroids as Citrus exocortis viroid (CEVd), Columnea latent viroid (CLVd) and Potato spindle tuber viroid (PSTVd). To find potential sources of infection, ornamental plants were screened for the presence of pospiviroids. These surveys revealed many new pospiviroid host plants as well as high infection rates for PSTVd in some ornamental species. Phylogenetic studies provided evidence that the PSTVd isolates from tomato originated from vegetatively propagated, solanaceous host plants. This conclusion was further substantiated by showing a high stability of predominant pospiviroid genotypes after mechanical pospiviroid transmission from ornamentals to potato and tomato. In addition, several experiments showed that mechanical inoculation is a likely way of pospiviroid transmission between these crops. In addition, a new pospiviroid from pepper was characterized, i.e. Pepper chat fruit viroid that also can infect potato and tomato. The results of above findings on pospiviroids are discussed in a broader context addressing diagnostic and epidemiological aspects as well as risk assessment in relation to quarantine measures.
    Highlights of the Didymellaceae: a polyphasic approach to characterise Phoma and related pleosporalean genera
    Aveskamp, M.M. ; Gruyter, H. de; Woudenberg, J. ; Verkley, G. ; Crous, P.W. - \ 2010
    Utrecht : CBS Fungal Biodiversity Centre (Studies in mycology 65) - ISBN 9789070351793 - 65
    dothideales - phoma - taxonomie - fylogenie - identificatie - pleosporaceae - coelomycetes - dothideales - phoma - taxonomy - phylogeny - identification - pleosporaceae - coelomycetes
    Check title to add to marked list

    Show 20 50 100 records per page

     
    Please log in to use this service. Login as Wageningen University & Research user or guest user in upper right hand corner of this page.